• 2024-07-05易基因:表观基因组cfDNA分析检测晚期EGFR突变肺腺癌患者的小细胞转化 | 肿瘤监测研究
    晚期EGFR突变型(EGFRm)肺腺癌(LUAD)患者经EGFR酪氨酸激酶抑制剂(TKIs)治疗后,可能组织学会转化为小细胞肺癌(SCLC),这是一种治疗抵抗机制。目前诊断SCLC转化需要组织学复查,存在一定的局限性,如需要进行组织活检,具有一定风险且可能无法获取足够组织样本。因此开发一种基于表观基因组的无创
  • 2024-07-02易基因:番茄果实采后处理成熟诱导的DNA甲基化和转录组综合分析 | 作物研究
    番茄果实成熟是一个复杂的生理过程,涉及关键基因的去甲基化,改变其转录水平,从而触发一系列生理事件。然而果实采摘后的处理方法,如冷藏、化学处理等,虽然能延长番茄的货架寿命,但通常可能会降低果实品质,目前尚不清楚这些过程是如何改变的。因此,研究采后处理诱导的番茄果实DNA甲基化和转
  • 2024-06-20易基因:MeRIP-seq等揭示RNA m6A去甲基化酶调控植物雄性不育的分子机制 | 科研速递
    大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。水稻是全球重要的农作物,也是单子叶植物模型。在水稻中,N6-甲基腺苷(m6A)mRNA修饰对植物的发育和胁迫响应至关重要。OsFIP37作为m6A甲基化复合体的核心组分,其缺乏会导致雄性不育,强调了m6A在雄性生育中的重要性。m6A是
  • 2024-06-12易基因:表观基因组分析揭示转录因子结合区DNA甲基化表征其功能和进化背景 | 研究速递
    大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。DNA甲基化是一种重要的表观遗传修饰,对调控基因组功能有多种作用。其水平在整个基因组中具有空间相关性,通常在被抑制区域较高,在转录因子(TF)结合位点(TFBS)和活性调控区域较低。然而建立全基因组和TF结合位点甲基化模
  • 2024-06-06两种参与茶树O-甲基化儿茶素生物合成的O-甲基转移酶的特征分析-文献精读20
    CharacterizationoftwoO-methyltransferasesinvolvedinthebiosynthesisofO-methylatedcatechinsinteaplant两种参与茶树O-甲基化儿茶素生物合成的O-甲基转移酶的特征分析茶树三维基因组-文献精读19比较转录组分析揭示了116种山茶属(Camellia)植物的深层系统发
  • 2024-05-21易基因:WGBS+ChIP-seq等表观组分析揭示FOXM1 是抗肿瘤免疫应答的关键调控因子
    大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。食管癌是一种常见的恶性肿瘤,包括两种主要的组织学亚型:食管鳞状细胞癌(squamouscellcarcinoma,ESCC)和食管腺癌(adenocarcinoma,EAC)。近两年来对抗肿瘤免疫应答机制的理解得到了显著提高,免疫检查点阻断(ICB)疗法等免疫疗
  • 2024-05-16易基因:干货|DNA甲基化测序后的后期验证方法
    易基因:干货|DNA甲基化测序后的后期验证方法大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。做完测序后,如果需要对分析结果中感兴趣的内容进行后期验证,则需要进行下游实验设计。DNA甲基化研究的后期验证包括简单验证、全基因组甲基化干扰实验(非靶向)、靶向目标基
  • 2024-05-15易基因: WGBS等揭示梨驯化和改良过程中DNA甲基化对果实成熟的作用机制 | 作物育种
    大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。梨(Pyrusssp.,蔷薇科杏仁核亚科)是世界上最重要的温带水果作物之一。与野生梨相比,栽培梨的果实在许多形态特征上表现出显著变化,包括果实大小、含糖量和核细胞含量。野生梨和栽培梨之间的比较分析可以深入了解关键表型变
  • 2024-05-09易基因:cfDNA甲基化组多模式分析早期检测食管鳞状细胞癌和癌前病变|Nature子刊
    大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。食管癌(EC)是最常见的胃肠道恶性肿瘤之一,食管鳞状细胞癌(ESCC)是EC的主要组织学亚型,约占新EC病例的88%,大多数发生在东亚和中亚。与晚期ESCC的预后极差相比,早期ESCC(如黏膜内ESCC)和前体病变(如上皮内瘤变,IEN)可以通过内镜下整
  • 2024-04-28易基因:Nat Commun:RRBS测序揭示小鼠衰老过程中的DNA甲基化变化轨迹|研究速递
    大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。DNA甲基化数据可以生成非常精确的年龄预测器,但关于这一关键表观遗传生物标志物在生命周期中的动态变化知之甚少。关于衰老不连续方面的研究仍处于起步阶段,关键的分子过程如表观基因组调控过程还有待研究。莱布尼
  • 2024-04-15WGBS上游分析
    WGBS的分析全流程:主要参考资料:WGBS甲基化分析Bismark软件使用入门沉浸式体验WGBS(上游)甲基化流程浅析听说你不会处理WGBS数据?安排上全基因组甲基化分析简述:使用BS-Seeker2BismarkBisulfiteMapper学习笔记(二)甲基化信息提取以及文件解读DNA甲基化分析流程详解查看用
  • 2024-04-09易基因:肝脏DNA甲基化分析揭示表观遗传衰老对异生素代谢和转运基因的影响|研究速递
    大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。65+岁的老年人发生药物不良反应(adversedrugreactions,ADR)的可能性是年轻人的7倍。随着年龄增长,生理变化会损害身体安全处理药物的能力,从而影响ADR风险。这些变化包括肝血流量减少、止血储备下降和身体成分改变,这些都
  • 2024-04-09文献速递|估算中国人群生理年龄的DNA甲基化时钟
    标题DNAmethylationclocksforestimatingbiologicalageinChinesecohorts期刊和影响因子Protein&Cell(IF:21.1,JCRQ1,中科院大类Q1小类Q2)简介文章主要介绍了在中国人群中使用DNA甲基化时钟来估计生物年龄的研究成果。DNA甲基化可以作为生理年龄的预测指
  • 2024-03-28易基因:NSUN2介导的m5C RNA甲基化在视网膜母细胞瘤进展中的重要作用 | 科研速递
    大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。视网膜母细胞瘤(retinoblastoma,RB)是儿童期最常见的眼内恶性肿瘤,可导致失明甚至死亡。RB1缺失(>90%)和MYCN扩增(~10%)被认为是致癌驱动事件,导致细胞周期更新增强和癌基因激活。最近的研究表明,表观遗传缺陷也参与RB肿瘤进展
  • 2024-03-22易基因: WGBS+RNA-seq揭示松材线虫JIII阶段形成过程中的DNA甲基化差异
    大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。松木线虫(PWN,Bursaphelenchusxylophilus)是一种破坏性病原体,可引起松树枯萎病,感染PWN的松树最终会死亡。这种微观线虫具有复杂的生命周期,具有植食性(以植物为食)和菌丝体(以真菌为食)的发育阶段,以及不同的生命周期,包括繁殖
  • 2024-03-20易基因:MeRIP-seq揭示m6A修饰在肺动脉高压(PAH)发病机制中的潜在作用和新治疗靶点|项目文章
    大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。肺动脉高压(pulmonaryarterialhypertension,PAH)是一种不可逆的心血管疾病,其特征是肺血管阻力进行性增加,最终导致肺动脉高压和右心衰竭。PAH主要成因包括血管收缩、肺血管重塑和细胞外基质(ECM)沉积。肺血管重塑主
  • 2024-03-18易基因:人类大脑的单细胞DNA甲基化和3D基因组结构|Science
    大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。高通通量表观基因组分析技术可用于阐明大脑中细胞复杂性的基因调控程序。5'-甲基胞嘧啶(5mCs)是哺乳动物基因组中最常见的修饰碱基,大多数5mCs发生在胞嘧啶-鸟嘌呤二核苷酸(CpGs)上。CG差异甲基化区域(DMRs)通常是顺式
  • 2024-03-06易基因:妊娠期母体甲基供体摄入对IUGR猪模型回肠DNA甲基化和功能影响|项目文章
    出生体重较低的宫内生长受限(Intrauterinegrowthrestriction,IUGR)影响肠道的生长、形态和功能,导致生长性能不佳和高死亡率。最近研究表明,IUGR导致肠道中不同的DNA甲基化,可能在IUGR肠道损伤中起关键作用。母体营养可以通过表观遗传修饰(例如DNA甲基化和组蛋白乙酰化)导致后代的永久表
  • 2024-03-05易基因:NAR:RCMS编辑系统在特定细胞RNA位点的靶向m5C甲基化和去甲基化研究|项目文章
    喜讯!易基因表观转录组学RNA-BS技术服务见刊《核酸研究》大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。2024年2月15日,吉林大学张涛、赵飞宇、李金泽为共同第一作者,吉林大学李占军、隋婷婷及赖良学为共同通讯在《NucleicAcidsResearch》(NAR/IF14.9)发表题为“Pro
  • 2024-02-27易基因:CHH甲基化丢失可触发玉米表观等位基因的可遗传变化|作物研究
    大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。研究人员已经在多种植物物种中观察到在杂交过程中跨染色体间互作而导致DNA甲基化变化。然而,这些互作的原因或结果知之甚少。2023年12月18日,佛罗里达大学微生物学和细胞科学系meixiaZhao等人在《PlantPhysiology》
  • 2024-01-31易基因:RNA m6A修饰促进玉米籽粒发育过程中的DNA甲基化|互作研究
    大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。mRNA中的N6-甲基腺苷(m6A)和DNA中的5-甲基胞嘧啶(5mC)对于调控基因表达和调节植物生长发育具有关键功能。然而,m6A和5mC之间的互作是一个难以捉摸的领域,在植物中的机制尚不清楚。2023年11月23日,中国农业大学贺岩教授课题
  • 2024-01-19易基因:cfDNA甲基化在器官和组织损伤检测中的强大力量
    大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。检测器官和组织损伤对于早期诊断、治疗决策和监测疾病进展至关重要。由于DNA甲基化模式可以响应组织损伤而改变,甲基化检测提供了一种有前途的方法,在早筛早诊、疾病进展监测、治疗效果和器官移植评估等可行性方面具有
  • 2024-01-16易基因: WGBS+RNA-seq揭示黄瓜作物的“源-库”关系受DNA甲基化调控|项目文章
    大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。作物产量取决于库(sink,获得同化物)的潜力和源(source,供给同化物)的能力,“源—库”关系的优化对作物产量调控具有重要意义。黄瓜(CucumissativusL.)是世界范围内广泛种植的蔬菜,是我国具有巨大经济价值的七大蔬菜之一,叶片和
  • 2024-01-15易基因:表观遗传学和表观转录组修饰在植物金属和准金属暴露中的作用 | 抗逆综述
    大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。非必需金属(non-essentialmetal)和准金属(metalloid,也称类金属)对土壤的污染是全球许多地区面临的严重问题。这些非必需金属和准金属对影响作物产量和人类健康的所有生物体均有毒性。作物暴露于高浓度的这些金属中会导致
  • 2023-12-28易基因:DNA甲基化和转录组分析揭示番茄黄化曲叶病毒感染过程中的转录和表观遗传学变化
    大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。双生病毒(Geminiviruses)是一种DNA植物病毒,可引起影响全球作物的高度破坏性疾病。在感染过程中,双生病毒调控细胞过程,抑制植物防御,并导致感染细胞的大量重编程,导致整个植物稳态重大变化。测序技术进步允许大规模同时分析