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甲基化
2024-11-18
易基因:华中农大周道绣团队利用BS-seq揭示水稻雄性配子发生过程DNA甲基化重编程机|Genome Biol
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。在开花植物中,DNA甲基化在配子和合子中部分重编程,但其在植物配子发生过程中的时机和功能意义尚不清楚。DNA甲基化在抑制转座元件(TE)和相关序列中起着关键作用,对于基因表达调控至关重要。近日,华中农业大学周道绣教授团
2024-11-05
易基因:多组学分析揭示围产期IL-6动物模型肾脏发育过程中的DNA甲基化+基因表达调控网络|Cells
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因,慢性肾脏病(Chronickidneydisease,CKD)是全球发病率和死亡率的主要原因之一。母体肥胖与系统性炎症和促炎细胞因子白细胞介素-6(Interleukin-6,IL-6)水平升高有关。此前研究证明妊娠期间母体IL-6增加会影响小鼠的宫内发育
2024-11-05
易基因: RNA-BS揭示动物不同发育阶段的mRNA m5C甲基化图谱和调控机制|Nat Commun
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。m5C是已知的RNA修饰之一,但其在mRNA中的发育动态、功能和进化仍然知之甚少。最初报道m5C在mRNA中普遍存在,但后来认识到许多最初被鉴定的位点可能假阳性。准确和系统地检测转录组范围mRNAm5C水平一直具有挑战性,缺乏对m
2024-10-29
易基因:Aging Cell/IF8:卵巢发育和衰老的m6A 甲基化揭示RNA稳定性和染色质状态调控
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。卵巢是女性重要的生殖器官,也是最早表现出衰老迹象的器官之一,通常在35岁左右开始,卵巢衰老(ovarianaging,OA)是导致与年龄相关的不孕问题的重要因素,包括卵泡数量和卵子质量的逐渐下降,对女性生育能力构成威胁。m6A是一种普
2024-10-17
易基因:DNA甲基化+转录组综合分析鉴定调控猪睾丸发育的潜在基因|附经典研究思路
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。DNA甲基化在调控基因表达和睾丸发育中发挥重要作用。WGBS和RNA-Seq数据综合分析可以绘制DNA甲基化与基因表达关系的全面图谱,从而鉴定受甲基化影响的关键基因。如对小鼠睾丸组织中WGBS和RNA-Seq的分析揭示了与
2024-10-08
易基因: cfMeDIP-seq揭示cfDNA甲基化高效区分原发性和转移性前列腺|Nat Commun
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。前列腺癌(Prostatecancer,PCa)是男性中第二常见的恶性肿瘤,也是全球癌症相关死亡的第三大原因。虽然大多数原发性前列腺癌可以治愈,但转移性前列腺癌患者的5年生存率仍低至30%。大多数患者很快就会发展成转移性去势抵抗性
2024-09-28
基因功能探索:DAP-seq技术如何简化研究流程
探索基因奥秘:DNA亲和纯化测序技术与组蛋白甲基化研究的新纪元在生物科学的世界中,基因的研究一直是一个神秘而深奥的领域。随着科技的不断进步,我们对基因的探索工具也在不断革新。今天,我们要为大家介绍两种前沿的技术:DNA亲和纯化测序(DAP-seq)和组蛋白甲基化修饰工具(H3K4me3Ch
2024-09-26
易基因:eLife:早期中度产前酒精暴露(PAE)和母体饮食介导子代DNA甲基化变化 | WGBS研究
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。妊娠期间饮酒是导致儿童神经发育障碍的主要原因之一,高剂量饮酒可导致儿童出现认知、行为和神经发育障碍,但目前对于低至中等饮酒水平的影响尚不完全清楚。DNA甲基化是一种表观遗传机制,涉及在碳-1代谢过程中向胞嘧啶碱
2024-09-19
易基因:单细胞甲基化+转录组多组学分析揭示哺乳期母体低蛋白饮食对子代的跨代传递|项目文章
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。环境因素如饮食和生活方式,可以影响哺乳期母体及其子代的健康,但其跨代传递及潜在机制尚不清楚。研究表明,父母的饮食模式和生活方式可以影响子代的健康;同时大量研究表明孕产妇营养状况与子代健康之间存在相关性。母
2024-09-12
易基因:朱健康团队WGBS揭示主动DNA去甲基化缺失植物的DNA甲基化跨代增加|PNAS
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。DNA甲基化是一种在植物和哺乳动物中保守的表观遗传标记,对生长、发育、疾病和寿命具有重要作用。植物和动物基因组中DNA甲基化的主动获得或丢失,以及DNA甲基化水平变化可能导致减数分裂稳定的表观遗传变异,这些变异产生
2024-09-11
易基因:Adv Sci:ACE等揭示产前不良环境暴露通过DNA羟甲基化变化介导子代自闭症|国人佳作
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。自闭症谱系障碍(Autismspectrumdisorder,ASD)是一种神经发育障碍,以社交沟通障碍和刻板行为为主要特征。许多研究证明,妊娠期暴露于环境毒素会导致儿童中ASD患病率快速增长。1-硝基芘(1-Nitropyrene,1-NP)一种主要存在
2024-09-08
Nature Com. | 鲲鹏院王培培等团队整合多组学数据预测植物复杂性状
全基因组预测(或全基因组选择)在缩短动植物育种周期、提高育种效率等方面起到越来越重要的作用。在以往的研究中,通常只有基因组序列信息被用于全基因组预测中,但植物复杂性状的形成受到多个维度的遗传信息调控,包括基因组序列、基因转录调控、基因甲基化修饰、染色体三维结构与修饰等
2024-09-05
易基因:中国农大田见晖教授团队揭示DNA甲基化保护早期胚胎线粒体基因组稳定性|项目文章
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。在早期哺乳动物胚胎中,线粒体氧化代谢增强是着床后生存和发育的重要特征;着床前期的线粒体重塑是正常胚胎发生的关键事件。在这些变化中,氧化磷酸化(OXPHOS)增强对于支持着床后胚胎的高能量需求至关重要,但线粒体氧化代谢的
2024-08-22
易基因:泪腺RRBS+RNA-seq揭示Sjögren综合征相关干眼症的潜在基因|项目文章
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。Sjögren综合征(Sjögren’ssyndrome,SS)相关干眼症是一种以泪腺(lacrimalglands,LGs)慢性炎症为特征的难治性自身免疫性疾病,表观遗传因子在SS相关干眼症发病机制中起着至关重要的作用。然而,泪腺中的DNA甲基化变化及其在S
2024-08-13
易基因:儿童和成人实体瘤共有微小差异甲基化区域(mDMR)的全面分析 | 表观研究
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。癌症是美国1~14岁儿童第二大常见死因,每年约有11000例新发病例和1200例死亡病例。与成人癌症相比,儿童肿瘤通常突变负荷较低。然而儿童肿瘤的表观基因组发生显著变化,尤其具有广泛的DNA甲基化变化。儿童肿瘤的罕见性对开
2024-08-06
易基因:哺乳动物胎盘DNA甲基化变化和胎儿出生体重的综合分析 | 科研速递
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。出生体重是一个复杂的多因素性状,与后期生活中的健康状况和疾病风险有关。胎盘对胎儿的正常生长至关重要,并负责促进母体和发育中胎儿之间的气体、营养和废物交换。胎盘DNA甲基化变化如何影响胎儿出生体重尚未完全阐明
2024-08-01
易基因:MeRIP-seq+RNA-seq揭示家禽(鸡)脂肪沉积中的m6A RNA甲基化调控机制|项目文章
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。脂肪组织是主要的脂肪沉积和代谢场所,在人类和动物的健康、代谢平衡和免疫稳态中起着重要作用。肥胖引起的多种代谢疾病已成为全球性健康问题。家禽腹部脂肪的过量沉积也会导致代谢疾病和增加饲料浪费,从而增加家禽生产
2024-07-26
易基因:通过cfDNA甲基化和半甲基化分析结合机器学习检测多癌种生物标志物
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。癌症是全球主要的公共卫生威胁,虽然癌症死亡率自1991年达到顶峰以来持续下降,但仅在2021年,美国就有超过60万人死于癌症。2020年,全球有近1000万人死于癌症,近年来一些低收入和中等收入国家的死亡率有所上升。因此,抗
2024-07-24
易基因:RNA m6A甲基化修饰和特定基因m6A位点的检测方法|干货分享
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)是真核生物mRNA中最丰富的化学修饰,在基因表达调控中发挥着重要作用,包括转录调控和转录后调控。m6A是一种可逆修饰,分别由甲基转移酶(writer)、去甲基化酶(eraser)和m6A结合蛋白(r
2024-07-17
全基因组DNA甲基化测序数据工作流程分析和性能评估 分析软件比较 | 生信专区
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。DNA甲基化与转录调控、基因组印记、干细胞分化、胚胎发育和炎症等过程有关。DNA甲基化异常可能揭示疾病状态,包括癌症和神经系统疾病。因此,人类基因组中5-甲基胞嘧啶(5mC)分布和位点是一个重要的研究方向。全基因组重亚
2024-07-15
易基因:表观多组学揭示SETDB1调控神经前体细胞的短散在核元件和染色质环构象
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。转座元件(TE)在神经发育期间的维持基因组结构中起着关键作用。短散在核元件(ShortInterspersedNuclearElements,SINE)是转座元件的主要亚型,已知含有CCCTC结合因子(CTCF)的结合位点,并在调控染色质构象中具有重要作用
2024-07-10
微量样本及单细胞DNA甲基化研究如何发高分SCI文章(特别适用珍稀样本)
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。单细胞及微量样本的DNA甲基化组学研究很大程度上受制于建库技术。传统的文库构建方法或类似于基因组DNA的单细胞扩增技术很难应用到甲基化实验过程中。易基因建立了一系列微量及单细胞甲基化检测方法,可对于不同项目需
2024-07-05
易基因:表观基因组cfDNA分析检测晚期EGFR突变肺腺癌患者的小细胞转化 | 肿瘤监测研究
晚期EGFR突变型(EGFRm)肺腺癌(LUAD)患者经EGFR酪氨酸激酶抑制剂(TKIs)治疗后,可能组织学会转化为小细胞肺癌(SCLC),这是一种治疗抵抗机制。目前诊断SCLC转化需要组织学复查,存在一定的局限性,如需要进行组织活检,具有一定风险且可能无法获取足够组织样本。因此开发一种基于表观基因组的无创
2024-07-02
易基因:番茄果实采后处理成熟诱导的DNA甲基化和转录组综合分析 | 作物研究
番茄果实成熟是一个复杂的生理过程,涉及关键基因的去甲基化,改变其转录水平,从而触发一系列生理事件。然而果实采摘后的处理方法,如冷藏、化学处理等,虽然能延长番茄的货架寿命,但通常可能会降低果实品质,目前尚不清楚这些过程是如何改变的。因此,研究采后处理诱导的番茄果实DNA甲基化和转
2024-06-20
易基因:MeRIP-seq等揭示RNA m6A去甲基化酶调控植物雄性不育的分子机制 | 科研速递
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。水稻是全球重要的农作物,也是单子叶植物模型。在水稻中,N6-甲基腺苷(m6A)mRNA修饰对植物的发育和胁迫响应至关重要。OsFIP37作为m6A甲基化复合体的核心组分,其缺乏会导致雄性不育,强调了m6A在雄性生育中的重要性。m6A是