基于扩散的结构预测算法在生物学中有广泛的应用，特别是在理解和模拟复杂生物系统的动态行为和相互作用方面。以下是几个关键的应用领域：1.蛋白质结构预测1.1蛋白质折叠基于扩散的算法可以模拟蛋白质从无序状态折叠到有序三维结构的动态过程。这在理解蛋白质功能和设计新药方面

引言在这篇指南中，我们介绍了Seurat的一个新扩展功能，用以分析新型的空间解析数据，将重点介绍由不同成像技术生成的三个公开数据集。VizgenMERSCOPE（用于小鼠大脑研究）NanostringCosMx空间分子成像仪（用于FFPE人类肺组织）AkoyaCODEX（用于人类淋巴结研究）人肺：NanostringCosMxSpa

AUCell和AddModuleScore分析是两种主流的用于单细胞RNA测序数据的基因集活性分析的方法。这些基因集可以来自文献、数据库或者根据具体研究问题进行自行定义。AUCell分析原理：1、AUCell分析可以将细胞中的所有基因按表达量进行排序，生成一个基因排名列表，表达量越高的基因排名

作者按本章节主要讲解了干预（不同处理）的单细胞数据的正确分析方法，讲解了干预分析与差异表达分析，细胞组成分析的区别，并介绍了查找受扰动影响最大的细胞类型以及预测单细胞对扰动的转录反应的干预分析方法。本教程首发于单细胞最好的中文教程，未经授权许可，禁止转载。全文字数|预计

作者按本章节主要讲解了不基于RNA速率的三种拟时序模型的代表算法，包括扩散时间，Slingshot，Palantir，VIA等，并简单介绍了细胞的状态转移。本教程首发于单细胞最好的中文教程，未经授权许可，禁止转载。全文字数|预计阅读时间:5000|10min——Starlitnightly（星夜）1.背景单细胞测序技

作者按本教程将是本系列教程中最重要的一章，我们后续所有的单细胞分析，都要基于准确的细胞类型注释。本系列教程首发于“[单细胞最好的中文教程](single_cell_tutorialReadthedocs)”，未经授权许可，禁止转载。全文字数|预计阅读时间:4500|5min——Starlitnightly1.背景我们

我们前面四次教程，已经完成单细胞数据的预处理了，包括质控，归一化，高可变基因筛选，降维。现在，我们就要开始单细胞测序的正式分析了，细胞类型注释等，在开始介绍细胞类型注释前，我们先来了解一下聚类。对于生物学家而言，聚类一词可能有点晦涩，因为这个词是机器学习领域里的概念。所以本章将详

作者按本章节主要讲解了单细胞数据的细胞组成（比例）的分析方法，讲解了为什么直接分析比例不行的原因与例子，并介绍了“有标签”，“有标签有层次”，“无标签”三个维度的细胞组成分析方法。本教程首发于单细胞最好的中文教程，未经授权许可，禁止转载。全文字数|预计阅读时间:5000|10min

目前，国内对于单细胞测序分析的教程五花八门，百花齐放，一个合适且准确的pipeline对于分析是很有价值的。2023年在NatRevGenet上发表的一篇论文Bestpracticesforsingle-cellanalysisacrossmodalities，详细介绍了单细胞最佳实践的流程。但是，其在国内的推广有两个不足：（一）全英文教

细胞计数算法（自动识别细胞并统计存活）——软件与平台实现结果展示项目介绍项目背景算法详解结果展示原图识别效果图项目介绍项目分为软件和平台双形态。软件可发送邮件至[email protected]处获取，平台可经由网址http://60.204.154.12访问使用。项目以霍

相关链接Conway'sGameoflife官网Glossaryofbasicterms-LifeWikihttps://conwaylife.com/wiki/Glossary_of_basic_terms网页端模拟：（复制器规则）Conway'sGameofLifeAJavaScriptversionofConway'sGameofLife,basedontheHashlife-algorithm.https://co

C#实验综合实例：生命游戏gameoflife《面向对象实验》嗨，我是射手座的程序媛，期待与大家更多的学习与交流，欢迎添加3512724768一、实验目的1.熟练掌握C#开发，编写WinForm应用程序。2.全面加深面向对象编程的概念，如类、对象、实例化等。3.学会使用C#图形图像编程。二、

作者，EvilGenius作为公司的分析人员，多方法比较和优化也是必修课。今天我们来看看Xenium的一些分析点及可能得优化方案Xenium本身的细胞分割更加适合于规整的、圆形或者其他形状不太奇怪的细胞，这一点得到了上海10X技术支持的确认，不过对于大多数样本，这个方法就够用了。这一篇

作者，EvilGenius我们来了解一下关于HE图片细胞分割的一些算法，以备后续的使用我们在做Xenium或者其他ISS技术的数据时候，通常都要获得一个polygons文件，直译过来就是多边形文件，其实就是我们进行的图像细胞分割文件。其实ISS技术由来已久，不过现在由于10Xxenium的发布，对于空间原

一、NMN是什么？众所周知，人体是由细胞构成的，而细胞的存在、运作、修复、分裂分化都需要能量。而能量来自于三羚酸循环-一人体最主要的能量代谢通路。不管你吃的碳水、蛋白质、脂肪......最终都是通过这个通路转化为能量，为细胞提供动力。三羚酸循环中有一个很重要的辅酶I--NAD+

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。喜讯！易基因表观转录组学RNA-BS技术服务见刊《ADVANCEDSCIENCE》表观遗传修饰包括有丝分裂遗传和稳定的修饰，这些修饰在不改变基础DNA序列的情况下调控基因表达。通常癌症中的表观遗传失调表现为突变、表观遗传修饰酶

作者，EvilGenius关于空间共定位（细胞和配受体）的展示方式已经提供了好几种了，列在下面，供大家参考空间转录组细胞类型和配受体的空间定位图空间细胞类型方向图空间细胞类型密度分布图空间转录组数据分析之近邻热图绘制10X空间转录组绘图分析之体现两种细胞类型的空间位置10X

                人类微生物群构成了一个复杂的多王国群落，与宿主在多个身体部位共生相互作用。宿主-微生物群的相互作用影响多种生理过程和各种多因素的疾病条件。在过去的十年中，微生物群落被认为会影响多种癌症类型的发展、进展、转移形成和治疗反应。虽

前言肿瘤组织不是单纯的只包含肿瘤细胞，它是由各种不同类型的细胞组成的，其中就包含基质细胞，成纤维细胞，还有免疫细胞等，这些细胞就构成了肿瘤的微环境。我们比较关注的是免疫细胞在这微环境中的作用。免疫细胞又包括很多种，如B细胞，T细胞等。不同的免疫细胞在肿瘤发生过程中

小罗碎碎念先说明，目前小罗只是硕士，以下个人观点很有可能不准确，欢迎批评指正！！小罗虚心听取有益建议！！众所周知，医学数据相比于其他领域的数据来说，属于小样本数据。那么从工科角度出发，模型的预测效果要想更精准，那么数据量就要尽可能大。好的，既然要解决的问题已经明确了，那么怎

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。食管癌是一种常见的恶性肿瘤，包括两种主要的组织学亚型：食管鳞状细胞癌（squamouscellcarcinoma，ESCC）和食管腺癌（adenocarcinoma，EAC）。近两年来对抗肿瘤免疫应答机制的理解得到了显著提高，免疫检查点阻断（ICB）疗法等免疫疗

这篇论文主要介绍了一种名为"Robustmappingofspatiotemporaltrajectoriesandcell-cellinteractionsinhealthyanddiseasedtissues"的新方法，该方法能够在健康和疾病组织中对细胞过程进行可靠的映射，同时研究细胞间的相互作用。在生物组织中，细胞类型、局部组成和状态、分

#include<iostream>#include<cstdlib>usingnamespacestd;#definemax50000structpos{ intx; inty;};typedefstructse{ posdata[max]; intfront,rear;}Sequeue;voidinit(Sequeue*&Q){ Q=(Sequeue*)malloc(sizeof(Sequeue))

Luteolin|木犀草素Luteolin|木犀草素中文名：木犀草素CAS：491-70-3品牌：MedChemExpress(MCE)存储条件：Powder:-20°C,3years;4°C,2years.Insolvent:-80°C,6months;-20°C,1month.生物活性：木犀草素(Luteoline)是一种类黄酮化合物，是一种有效的Nrf2抑制剂

\(5.15\)学考捏，目前书一共翻开过\(1\)次，遥遥领先！不太想手写笔记，就发到洛谷博客吧。\[\Large\textbf{必修一}\]第\(1\)章走进细胞第\(1\)节细胞是生命活动的基本单位（一）细胞学说及其建立过程\(\color{blue}\checkmark\)细胞学说的内容：细胞是一个有机体，一切动植