传统的全基因组关联分析(GWAS)计算的是单个SNP与表型的相关性,除此之外,我们还可以进行SNP之间的互作效应与表型的相关性分析。
上位效应的公式为:Y ~ b0 + b1.A + b2.B + b3.AB + e
Y为表型,A和B分别为两个变异位点,在GWAS中通常指SNP,如果b3为显著,则说明存在上位效应。
REF
https://www.cnblogs.com/chenwenyan/p/13813946.html
标签:GWAS,表型,效应,上位,SNP,b3 From: https://www.cnblogs.com/emanlee/p/15336390.html