SNP
  • 2024-06-19R:SNP数据筛选.R
    #清空工作环境,删除所有对象rm(list=ls())library(data.table)#加载data.table包library(data.table)#设置工作目录setwd("C:\\Users\\Administrator\\Desktop")#设置为你的工作目录路径#读取大文件file_path<-"AMP_lines456_maf0.05_het2N_geno0.6.hmp.txt"
  • 2024-04-27scPagwas-gwas data pruning的处理-inhouse 【未完成整理】
    总共三个大步骤:step1:提取503例EUR-Sample的1000G.EUR.QC.chr,通过python脚本批量跑plink得到step2:提取my-MDD中SNP的1000G.EUR.QC.chr-sub-chr,通过python脚本批量跑plink得到step3:进行pruning,得到MDD.chr*_plink_prune_EUR_filtered_LD0.8.prune.in,通过python脚本批量跑pli
  • 2024-04-1503、IS-IS认证
    IS-IS认证IS-IS认证是基于网络安全性的要求而实现的一种认证手段,通过在IS-IS报文中增加认证字段对报文进行认证。当本地路由器接收到远端路由器发送过来的IS-IS报文,如果发现认证密码不匹配,则将收到的报文进行丢弃,达到自我保护的目的。认证的分类根据报文的种类,认证可以分为
  • 2024-01-29企业如何遵守数据安全法规进行SAP数据脱敏处理?
    随着信息技术的飞速发展,大数据时代的到来使得数据成为国家经济、企业竞争力和个人隐私的重要载体。在这种背景下,数据安全问题日益凸显,各国政府纷纷出台相关法规以保护数据安全。我国也不断完善数据安全法规体系,以确保国家利益、企业发展和公民权益不受侵害。本文将结合中国数据安全
  • 2023-12-17全球汽车行业的数字化转型:产品和后端的渐进之旅
    如何管理汽车行业的数字化转型?在我们本篇文章中了解更多有关如何设定长期目标的信息。正在改变汽车行业的26个数字化主题最近一篇关于汽车行业数字化转型的论文确定了26个数字技术主题(论文详情请点击阅读原文),分为三个主要集群:1)驾驶辅助系统;2)路线、定位和环境监测;3)数据、连接
  • 2023-12-17SNP Bluefield助力日日顺物流公司进行IT系统代码拆分
         日日顺是海尔集团旗下综合服务品牌,旗下有日日顺物流、日日顺乐家、日日顺乐农等。日日顺物流为家电、家具、卫浴等品类的厂商、线下零售商和电子商务客户提物流服务。日日顺网点遍布全国,深入县、乡、村级地区,日日顺的优势在于大件配送。2018年,日日顺品牌价值301.08
  • 2023-11-25linux shell实现计算SNP在指定群体的ROH片段中出现的频率
     001、ROH检测[s20213040583@admin1test]$ls##测试文件outcome.mapoutcome.ped##plink软件检测[s20213040583@admin1test]$plink--fileoutcome--homozyg--homozyg-density50--homozyg-gap1000--homozyg-kb500--homozyg-sn
  • 2023-11-09欧莱雅SAP系统成功合并
    欧莱雅集团是全球化妆品行业的大型企业。该集团分为四个部门:消费品(欧莱雅巴黎、卡尼尔、美宝莲Jade)、专业产品(欧莱雅专业人士、卡诗、Redken、Matrix)、欧莱雅奢侈品(兰蔻、碧欧泉、赫莲娜、阿玛尼香水等)和活性化妆品(薇姿、理肤泉等)。其中消费品和专业产品部门、活性化妆品部门都
  • 2023-11-09SNP应邀参加2023中国企业数字化转型峰会暨赛意用户大会
    创新驱动科技,数智驱动未来。如今,我国产业数字化进程提速升级,数字产业化规模持续壮大。数据显示,2022年,我国数字经济规模达50.2万亿元,总量稳居世界第二。数字经济已经成为推动传统产业转型升级、促进高质量发展的新引擎。10月27日,2023中国企业数字化转型峰会暨赛意用户大会在武汉隆重
  • 2023-10-29如何将SAP数据集成到任意云平台
    十年前就在使用SAP的客户询问我当时突然出现的新事物:大数据。五年前,变成了数据湖和机器学习。现在一切都是关于数据集成,当然还有人工智能。有时处理数据的基本方法已经改变或者发展。有时只是名字的改变。例如,在过去十年中,数据湖演变成数据网格(DataMeshes),当你想到它时,它只不过是
  • 2023-10-24【SNP 喜讯】贝里精英集团SAP S/4 HANA PCE系统成功上线
    经过近六个月的不懈努力,贝里精英集团大中国区的多个工厂成功地将SAPECC系统选择性数据升级转换到SAPS/4HANAPCE(私有云)系统,并正式上线使用。这一壮举标志着贝里精英集团步入数字化工厂建设的新阶段,开启了数字化工厂建设的新征程。贝里精英集团在国内拥有十多家工厂(15+SAP公司
  • 2023-10-15SNP间的上位效应
    传统的全基因组关联分析(GWAS)计算的是单个SNP与表型的相关性,除此之外,我们还可以进行SNP之间的互作效应与表型的相关性分析。上位效应的公式为:Y~b0+b1.A+b2.B+b3.AB+eY为表型,A和B分别为两个变异位点,在GWAS中通常指SNP,如果b3为显著,则说明存在上位效应。  REFhttps:
  • 2023-10-14基因分型数据与碱基序列的输入
    基因分型数据和碱基序列的输入都是对DNA信息的编码,但它们的表达方式和所提供的信息不同。为了理解它们之间的联系,让我们首先明确这两者的定义:基因分型数据:基因分型数据通常是在特定的单核苷酸位置上(即SNP位置)对个体的DNA的描述。每个SNP位置可以有三种情况:两种纯合子和一种杂合
  • 2023-10-14基因分型数据
    基因分型数据是对一个个体在特定的DNA位点或基因座的等位基因组成的记录。换句话说,基因分型是描述特定位置上DNA变化的方法。DNA和变异:DNA由四种碱基:腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、鸟嘌呤(C)和鸟苷酸(G)组成。大部分人类的DNA序列是相同的,但某些位置上存在变异。这些变异点上的不同
  • 2023-10-13GBLUP方法的缺点
    GBLUP(GenomicBestLinearUnbiasedPrediction)是一种在基因组选择中广泛使用的方法,但它也有一些潜在的缺点和限制,包括:计算复杂性:GBLUP的计算复杂性相对较高,特别是在大规模基因组数据集上。需要处理大量的SNP标记数据,这可能需要大量的计算资源和时间。不考虑基因互作:GBLUP通常假
  • 2023-09-26生信教程:使用全基因组SNP数据进行ABBA-BABA分析
    动动发财的小手,点个赞吧!简介ABBABABA统计(也称为“D统计”)为偏离严格的分叉进化历史提供了简单而有力的测试。因此,它们经常用于使用基因组规模的SNP数据(例如来自全基因组测序或RADseq)来测试基因渗入。在本次实践中,我们将结合使用可用软件和一些用R从头编写的代码来执行
  • 2023-09-18SAP国内金牌合作公司有哪些?
    SAP是国内外知名的ERP品牌,至今已有50年的企业信息化经验,拥有10万多名员工,体系遍布全球130多个国家和地区,是全球大型的企业管理和协同化商务解决方案供应商,总部位于德国,1995年在中国设立分公司,截至目前合作伙伴覆盖网络极其庞大,在国内约有几百家合作伙伴,能够为不同地区的每位客户提
  • 2023-09-18【直播回顾】应对数智化时代下SAP用户的系统转型挑战——SNP TDO
    “京西重工通过20天的项目周期,实现了将SAPECC系统2.5T的总数据量,按13个月以时间切片方式刷新测试数据。存储和管理成本降低多达80%、测试数据量减少70%、生产系统零停机。”  “海尔日日顺历经不到3个月的时间,将70多家公司代码从海尔源系统拆分迁移至新系统。”2023年8月31日,在
  • 2023-08-22“赛意力量&SNP”南京站深探智改数转新境界 精典回顾
    7月28日,“赛意力量·全国行”来到中国科技的创新中心之一,同样也是专精特新“小巨人”成林的城市——江苏南京,以“芯片”为纽带,聚焦高科技企业未来发展的大方向,带领嘉宾深度挖掘智改数转领域的新思考与新路径。通过沙龙主题演讲与现场问答等深入互动,解析前沿资讯,总结实战经验,从而洞
  • 2023-08-22SNP BLUEFIELD助力ABM集团S/4HANA数字转型
    ABM的愿景是成为一家在矿业资源、矿业服务和矿业基础设施方面进行战略投资的公司。在业务发展中,ABM努力实现各业务部门之间的整合和协同,以满足矿业业务供应链活动的需求。来百度APP畅享高清图片挑战:营造敏捷数据环境以适应发展需求2020年,ABM集团继续加强其业务部门间的整合协同,成为
  • 2023-08-11智胜未来——即刻开始为您的S/4HANA迁移做准备
    SAP即将结束对ECC的维护SAP即将结束对ECC的维护,早在2019年,SAP就宣布将在2025年之前结束对其ECC的维护,随后又延长至2027年。尽管距离2027年似乎还有很长的路要走,但对于许多企业来说,这个截止日期的到来将比预期的要快得多。出于这个原因,以及企业对构建智慧企业架构,实现现
  • 2023-07-26如何快速简化vcf信息?
    目录需求描述可能存在错误的做法更靠谱的做法需求描述vcf是标准的基因型格式文件,其中包含的信息可多可少。主要在于INFO可无限扩展特征,以及每个样本的FORMAT信息,会大大增加vcf文件的大小。一般来说,GATK等软件得到的基因型都会有这些信息,初始变异我们最好保留它们,因为这是过滤位
  • 2023-06-23QQplot
    在GWAS(基因组关联研究)中,QQplot(Quantile-Quantileplot,分位数-分位数图)是一种常用的统计图形,用于评估GWAS结果中的关联统计量是否偏离了预期的分布。GWAS旨在寻找基因型和表型之间的关联,通过对大量的SNP(单核苷酸多态性)进行关联分析。在GWAS中,每个SNP都会计算一个关联统计量(例如p
  • 2023-06-21遗传相关估计方法
    遗传相关(GeneticCorrelation)是遗传学核心概念,用于衡量表型之间由基因决定的相关性。实现方法包括LDSC(连锁不平衡得分回归; https://github.com/bulik/ldsc)、HDL(高精度似然函数;https://github.com/bulik/ldsc)、GNOVA(geneticcovarianceanalyzer;https://github.com/
  • 2023-06-19SNP宣布与德勤英国达成合作协议
    近日英国伦敦——知名的SAP系统数字化转型流程和自动化数据迁移软件解决方案提供商SNP很高兴地宣布与德勤签署合作协议,正式确立双方的关系。两家公司将共同为客户提供端到端解决方案,简化并加快复杂SAP转型项目的价值实现时间,从而节省大量成本并提高运营效率。客户将进一步受益,因为