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DNA测序中的reads mapping方向的信息

时间:2023-05-10 16:13:31浏览次数:40  
标签:DNA 测序 mapping 序列 reads 方向

在DNA测序中,reads mapping方向指的是描绘short-reads(短序列)对于参考基因组的比对方向,即将短读序列与参考基因组进行比对时匹配的方向。

这个方向信息通常被编码为“+”或“-”,其中“+”表示reads的5'端与正向链的3'端相对应,“-”表示reads的5'端与负向链的3'端相对应。

具体来说,在DNA序列比对过程中,比对算法会将短读序列与参考基因组中的一个区域进行比对,比对结果会给出短读序列所匹配的位置及方向。根据比对结果可以确定reads mapping方向信息,这些信息可用于分析DN¥¥段在参考序列上的位置和方向。

读取映射方向对于各种生物信息学应用程序非常重要,例如测序数据的拼接、SNP检测、RNA-seq定量测量等。通过了解reads mapping方向信息,可以更好地理解位点的表达和转录备份,并帮助发现多态性位点的变异信息以及确定参考序列上的基因结构。

标签:DNA,测序,mapping,序列,reads,方向
From: https://www.cnblogs.com/wzbzk/p/17388279.html

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