转自：https://www.cnblogs.com/kerrycode/p/5940626.html在ORACLE数据库中有物理读（PhysicalReads）、逻辑读（LogicalReads）、一致性读（ConsistantGet）、当前模式读（DBBlockGets）等诸多概念，如果不理解或混淆这些概念的话，对你深入理解一些知识无疑是一个障碍，但是这些概念确实挺让让人犯

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。ChIP-seq（染色质免疫沉淀测序）实验指南和实践（ChIP-seqguidelinesandpracticesoftheENCODEandmodENCODEconsortia），由ENCODE（EncyclopediaofDNAElements）和modENCODE（ModelOrganismENCODE）联盟研究人员撰写。文

2022-11-2012:09:06星期日目的原先写过DNAgermline变异可信度判定(证据项收集）和DNAgermline变异可信度判定，基于pysam对bam文件的解析，从突变相关的reads收集一些统计指标，再根据各指标人工划分阈值进行评分的增减，从最终得分的高低进而评估突变的可信度。这一年

原文链接：https://blog.csdn.net/qq_35462323/article/details/1318115931、Innodb_buffer_pool_reads和Innodb_buffer_pool_read_requests的含义？Innodb_buffer_pool_readsInnodb_buffer_pool_readsThenumberoflogicalreadsthatInnoDBcouldnotsatisfyfromthebuffer

GATKfastpbwa---产生sam文件bwa有三种算法,其中mem比较全面bwaindexref.fa先建立index,下载参考基因组的fasta文件。？不知道可不可以用压缩文件，教程是解压的。在操作的时候我也解压了bwamemref.faread1.fqread2.fq>aln-pe.sam#无参数R这里输入的.fq可以是压缩

查找前十条性能差的sql语句：SELECT*FROM(selectPARSING_USER_ID,EXECUTIONS,SORTS,COMMAND_TYPE,DISK_READS,sql_textFROMv$sqlareaorderBYdisk_readsDESC)whereROWNUM<10; 查看占io较大的正在运行的session：SELECTse.sid,se.serial#,pr.SPID,se.username,se

目录1.Oracle查询SQL语句1.1.性能查询常用SQL1.1.1.查询最慢的SQL1.1.2.列出使用频率最高的5个查询1.1.3.消耗磁盘读取最多的sqltop51.1.4.找出需要大量缓冲读取(逻辑读)操作的查询1.1.5.查询每天执行慢的SQL1.1.6.从V$SQLAREA中查询最占用资源的查询1.1.7.

一个用于处理fastq测序文件的命令行小工具，功能还在不断更新中，子命令也不多，支持gzip压缩文件的输入和输出（结果文件名以.gz结尾，结果会自动压缩）。reop:https://github.com/sharkLoc/fqkitinstall:cargoinstallfqkitusage:fqkit:asimpleprogramforfastqfilemanipulatio

http://www.ebi.ac.uk/ena/about/sra_formatReadmetadataformatMetadataisrepresentedusingXMLdocuments.FordetailedinformationaboutthemetadataXMLspleaserefertoSRAXML1.5metadataformat.ForexampleshowtopreparetheXMLspleasereferto

DBBlockGets:请求的数据块在buffer能满足的个数当前模式块意思就是在操作中正好提取的块数目，而不是在一致性读的情况下而产生的块数。正常的情况下，一个查询提取的块是在查询开始的那个时间点上存在的数据块，当前块是在这个时刻存在的数据块，而不是在这个时间点之前或者之后的数据

项目场景：mysql创建function报错误1418-ThisfunctionhasnoneofDETERMINISTIC,NOSQL,orREADSSQLDATAin问题描述：执行创建函数的sql语句时，提示:ThisfunctionhasnoneofDETERMINISTIC,NOSQL,orREADSSQLDATAinitsdeclarationandbinaryloggingisenab

1、基于Select机制的服务端代码#include<stdio.h>#include<stdlib.h>#include<string.h>#include<unistd.h>#include<arpa/inet.h>#include<sys/socket.h>#include<sys/time.h>#include<sys/select.h>#defineBUF_SIZ

  NIPT检测流程 转自：https://pzweuj.github.io/2019/03/20/NIPT.htmlNIPT即非侵入性产前检测，适用于检测21、18、13号染色体的三体综合征。实际上，NIPT的分析流程与CNV的分析流程相似。主要的分析流程是先得到唯一比对的reads，再提取每条染色体的reads来做一个Z检验得到Z值

检测cnv的范围：1KB～几M，中值100KB杂合性缺失，位于一对同源染色体上的相同基因座位的两个等位基因中的一个（或其中部分核苷酸片段）发生缺失，与之配对的染色体上仍然存在1:在有的文献中指出cfDNA长度一般在167bp,ctDNA一般在145bp.在脑脊液中发现（ctDNA）取代在血浆中。本文对13个病人进行了

"Reads"（序列）是指从DNA测序技术中得到的短片段DNA序列。通常这些序列长度较短，可能只有几百个碱基对长。"Contigs"（连读）是通过将读取序列拼接在一起来形成更长的序列。Contigs相对较长，可能达到数千个碱基对长，但它们可能仍然缺少一些重要的信息，例如重复序列或缺失区域。"k-mers"（k个

在DNA测序中，readsmapping方向指的是描绘short-reads（短序列）对于参考基因组的比对方向，即将短读序列与参考基因组进行比对时匹配的方向。这个方向信息通常被编码为“+”或“-”，其中“+”表示reads的5'端与正向链的3'端相对应，“-”表示reads的5'端与负向链的3'端相对应。具体来说，在

前言NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析（Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析(重磅综述：三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程（原理、代码和评述）)、DNA甲基化分析、重测序分析、GEO数据挖掘（典型医学设计实

 001、star报错 002、解决方法fastq文件为压缩格式，运行时需添加该参数：--readFilesCommandzcat 

找出SQLServer数据库I/O高的原因影响SQLServer性能的因素有很多，比如CPU、I/O、内存、错误的执行计划、不恰当的索引或缺少索引等。当查询变慢时，我发现最常见的一件事是由于查询执行的I/O太大。当一个查询因为I/O而变慢时，可能是因为糟糕的硬件、糟糕的执行计划，但通常是糟糕的数据

TCP/IP网络编程--（十二）I/O复用如果为了并发使用多进程服务器，代价很大。因为创建进程需要大量的运算和内存空间，并且相互之间的数据交换也要用管道这种相对复杂的方法复用

1.ChIPseq简介染色质免疫沉淀，然后进行深度测序(ChIPseq)是一种成熟的技术，可以在全基因组范围内识别转录因子结合位点和表观遗传标记。1.1.实验处理交联和蛋白质

一致性读一致性读意味着InnoDB使用多版本技术在某个时间点使用该时间点的快照进行一致性读；默认可重复读隔离级别，当前事务只能看到在当下时间点之前提交事务产生的变化，时间

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。全基因组重亚硫酸盐测序（WGBS）是甲基化研究的重要技术。尽管已经开发了一系列工具来解决由亚硫酸盐处理引

链接:https://www.luogu.com.cn/problem/P4694题目描述:有\(k\)个光盘要在\(n\)天之内加工完毕.有\(2\)个工厂\(A,B\),每一个光盘要先在\(A\)工厂加工,再在\(B\)工厂加工,

[\(Code\)+#4]最短路链接:https://www.luogu.com.cn/problem/P4366题面:给定一个\(n\)个点，\(m\)条边的无向图，若任意点对\((i,j)\)之间还有一条长为\((ixorj)\timesC\)