- 2024-11-18易基因:华中农大周道绣团队利用BS-seq揭示水稻雄性配子发生过程DNA甲基化重编程机|Genome Biol
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。在开花植物中,DNA甲基化在配子和合子中部分重编程,但其在植物配子发生过程中的时机和功能意义尚不清楚。DNA甲基化在抑制转座元件(TE)和相关序列中起着关键作用,对于基因表达调控至关重要。近日,华中农业大学周道绣教授团
- 2024-11-14基因组编辑与CRISPR技术:基因治疗的革命性突破
引言基因组编辑技术的出现,尤其是CRISPR-Cas9技术的问世,极大地推动了生物医学研究和基因治疗的发展。这一技术不仅为基础科学研究提供了强大的工具,也为治疗遗传性疾病、癌症以及某些病毒感染开辟了新的治疗思路。基因组编辑技术可以精准地修改生物体内的DNA,精确去除、替换或添
- 2024-11-10动态规划-古生物DNA序列血缘分析
问题描述DNA是由A、C、G、T四种核苷酸组成,例如AAAGTCTGAC,假定自然环境下DNA发生异变的情况有:基因缺失一个核苷酸基因新增一个核苷酸基因替换一个核苷酸且发生概率相同。古生物学家Sam得到了若干条相似DNA序列,Sam认为一个DNA序列向另外一个DNA序列转变所需的
- 2024-11-056分钟看懂分子生物学聚合酶链式反应(PCR)
在现代生物科学中,聚合酶链反应(PCR)是一项革命性的技术,它改变了我们对DNA的认识和应用。无论是在医学诊断、遗传研究,还是在法医科学中,PCR都发挥着至关重要的作用。这期,由全优统计译制的视频带我们一起深入了解PCR的原理及应用。什么是PCR和qPCR?PCR的原理及应用/Theprincip
- 2024-11-05易基因:多组学分析揭示围产期IL-6动物模型肾脏发育过程中的DNA甲基化+基因表达调控网络|Cells
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因,慢性肾脏病(Chronickidneydisease,CKD)是全球发病率和死亡率的主要原因之一。母体肥胖与系统性炎症和促炎细胞因子白细胞介素-6(Interleukin-6,IL-6)水平升高有关。此前研究证明妊娠期间母体IL-6增加会影响小鼠的宫内发育
- 2024-11-05合成生物学:工程化生命科学的前沿探索
合成生物学(SyntheticBiology)是结合生物学、工程学、计算科学等多学科的一门新兴技术,旨在利用工程化设计的方式来改造和构建生物系统。与传统的生物技术不同,合成生物学不仅关注理解自然生物系统,更侧重于通过基因编辑、分子设计等手段,从头构建新的生物元件或有机体。这一领域的
- 2024-11-02源鲁杯2024[Round 3] CheckImg
新思路:十六进制错位恢复新知识:DNA编码下载文件,是一张图片,010、属性、pngcheck都没有发现信息,用stegslove打开查看,在red0通道发现图片下面有明显的隐写,后面的green0有提示(这图片真的好大,一整个屏幕看不到完整的)Green0通道的整句话应该是attentiontodetails,先存一下red0的
- 2024-10-24AbMole|哺乳动物 DNA 中无碱基位点的复杂基因组模式研究
DNA损伤在生物学和疾病中起着至关重要的作用,而无碱基(AP)位点作为一种常见的DNA损伤类型,其基因组学特征仍未被充分探索。来自华侨大学医学院基因组学研究所的YeCai, 1HuifenCao, 2FangWang等多名研究人员发表了题为《Complexgenomicpatternsofabasicsitesinm
- 2024-10-17易基因:DNA甲基化+转录组综合分析鉴定调控猪睾丸发育的潜在基因|附经典研究思路
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。DNA甲基化在调控基因表达和睾丸发育中发挥重要作用。WGBS和RNA-Seq数据综合分析可以绘制DNA甲基化与基因表达关系的全面图谱,从而鉴定受甲基化影响的关键基因。如对小鼠睾丸组织中WGBS和RNA-Seq的分析揭示了与
- 2024-10-08易基因: cfMeDIP-seq揭示cfDNA甲基化高效区分原发性和转移性前列腺|Nat Commun
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。前列腺癌(Prostatecancer,PCa)是男性中第二常见的恶性肿瘤,也是全球癌症相关死亡的第三大原因。虽然大多数原发性前列腺癌可以治愈,但转移性前列腺癌患者的5年生存率仍低至30%。大多数患者很快就会发展成转移性去势抵抗性
- 2024-09-26易基因:eLife:早期中度产前酒精暴露(PAE)和母体饮食介导子代DNA甲基化变化 | WGBS研究
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。妊娠期间饮酒是导致儿童神经发育障碍的主要原因之一,高剂量饮酒可导致儿童出现认知、行为和神经发育障碍,但目前对于低至中等饮酒水平的影响尚不完全清楚。DNA甲基化是一种表观遗传机制,涉及在碳-1代谢过程中向胞嘧啶碱
- 2024-09-25支原体“现形记”:培养、指示、PCR
支原体,细胞培养人员的梦魇,堪称细胞培养界的“隐形杀手”。支原体就像慢性毒药一样,杀细胞于无形之中。经常悄然潜入细胞培养体系,无声无息的毁掉细胞。除了经验丰富的实验室老手,一般人难以察觉支原体污染。科研方面,Nature、Cell等期刊高度重视细胞培养实验中的支原体检测信息。
- 2024-09-23非洲猪瘟病毒检测仪的工作原理
单通道非洲猪瘟病毒检测仪在非洲猪瘟的防控中发挥着重要作用,其工作原理和功能特点主要体现在以下几个方面:一、工作原理单通道非洲猪瘟病毒检测仪主要基于PCR(聚合酶链反应)技术和荧光检测技术进行工作。具体来说,其工作原理包括以下几个步骤:样品处理:首先,需要收集疑似感染非洲猪
- 2024-09-19易基因:单细胞甲基化+转录组多组学分析揭示哺乳期母体低蛋白饮食对子代的跨代传递|项目文章
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。环境因素如饮食和生活方式,可以影响哺乳期母体及其子代的健康,但其跨代传递及潜在机制尚不清楚。研究表明,父母的饮食模式和生活方式可以影响子代的健康;同时大量研究表明孕产妇营养状况与子代健康之间存在相关性。母
- 2024-09-12易基因:朱健康团队WGBS揭示主动DNA去甲基化缺失植物的DNA甲基化跨代增加|PNAS
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。DNA甲基化是一种在植物和哺乳动物中保守的表观遗传标记,对生长、发育、疾病和寿命具有重要作用。植物和动物基因组中DNA甲基化的主动获得或丢失,以及DNA甲基化水平变化可能导致减数分裂稳定的表观遗传变异,这些变异产生
- 2024-09-10《使用 LangChain 进行大模型应用开发》学习笔记(二)
前言本文是HarrisonChase(LangChain创建者)和吴恩达(AndrewNg)的视频课程《LangChainforLLMApplicationDevelopment》(使用LangChain进行大模型应用开发)的学习笔记。由于原课程为全英文视频课程,国内访问较慢,同时我整理和替换了部分内容以便于国内学习。阅读本文可快
- 2024-09-08PNAS | 基因组预训练网络模型精准预测 DNA 突变
❝我们能教会计算机理解人类语言,同样也能让它们读懂DNA。2023年10月31日,加利福尼亚大学伯克利分校的科学家们在《美国科学院院刊》(PNAS)上发表了一篇突破性研究,提出了一种基于无监督DNA语言模型的新方法,该方法在全基因组范围内预测基因变异效果上,超越了现有的保守性评分模型。
- 2024-09-05AbMole|DNA双链断裂修复中的序列与染色质特征:MRX复合体的作用与机制
在生物学领域中,DNA双链断裂(DSB)作为一种极具破坏性的基因组损伤,其准确且高效的修复对于维持细胞基因组的稳定性和功能至关重要。由来自哥伦比亚大学欧文医学中心微生物学与免疫学系的RobertGnügge和瑞士苏黎世工业大学(ETH)生物化学研究所生物系的 GiordanoReginato,Petr
- 2024-09-05易基因:中国农大田见晖教授团队揭示DNA甲基化保护早期胚胎线粒体基因组稳定性|项目文章
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。在早期哺乳动物胚胎中,线粒体氧化代谢增强是着床后生存和发育的重要特征;着床前期的线粒体重塑是正常胚胎发生的关键事件。在这些变化中,氧化磷酸化(OXPHOS)增强对于支持着床后胚胎的高能量需求至关重要,但线粒体氧化代谢的
- 2024-09-03AGRI10051 2024 Prac
AGRI100512024Prac1PRACTICAL INFORMATIONANDAPPENDICESWelcome to the Biology Laboratory!This first page contains important information that will help you duringyour practicalclasses,soyou maywishto readthrough it carefully so
- 2024-08-28树形 DNA
由于左右子树不等价,我们可以以Trie树的视角考察原树,发现“叶子节点不超过20个”的条件等价于这棵Trie树可以用不超过20个01字符串表示树的匹配不好做,但字符串匹配是可做的。于是我们可以想到把树的匹配“折叠”成20个字符串的匹配猜想时间复杂度是O(20n),其中20是枚举的复杂度把
- 2024-08-22易基因:泪腺RRBS+RNA-seq揭示Sjögren综合征相关干眼症的潜在基因|项目文章
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。Sjögren综合征(Sjögren’ssyndrome,SS)相关干眼症是一种以泪腺(lacrimalglands,LGs)慢性炎症为特征的难治性自身免疫性疾病,表观遗传因子在SS相关干眼症发病机制中起着至关重要的作用。然而,泪腺中的DNA甲基化变化及其在S
- 2024-08-15修复DNA
AC自动机上DP的典型题目假设我们已经获得了最终的串,那么将这个串放在AC自动机上匹配的时候,一定是不会匹配到一个模式串的,我们考虑利用这一点来DP设\(f[i][j]\)表示将经过修改后的文本串的前\(i\)个字符放在AC自动机上匹配中途没有匹配到模式串且当前匹配到AC自动机的\(j\)号节点
- 2024-08-13洛谷P7767 DNA 题解
ProblemSolution考虑DP。设\(dp_{i,0}\)表示前\(i\)个字符全为A的最小操作次数,\(dp_{i,1}\)表示前\(i\)个数全为B的最小操作次数。考虑转移。若当前位为A则\(dp_{i,0}=\min(dp_{i-1,0},dp_{i-1,1}+1)\),\(dp_{i,1}=\min(dp_{i-1,0}+1,dp_{i-1,1}+1)\);若当前位
- 2024-08-13易基因:儿童和成人实体瘤共有微小差异甲基化区域(mDMR)的全面分析 | 表观研究
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。癌症是美国1~14岁儿童第二大常见死因,每年约有11000例新发病例和1200例死亡病例。与成人癌症相比,儿童肿瘤通常突变负荷较低。然而儿童肿瘤的表观基因组发生显著变化,尤其具有广泛的DNA甲基化变化。儿童肿瘤的罕见性对开