在生物学中，DNA序列通常指非编码序列，因为DNA是生物体内存储基因信息的一种生物大分子，具有一定的生物学特性和结构。然而，基于DNA序列的机器学习预测可以包括编码和非编码序列的任务。以下是一些基于DNA序列的机器学习应用：
应用于非编码DNA序列的机器学习模型：
- 基因预测：使用机器学习算法预测非编码DNA序列中的基因区域。
- 启动子预测：预测非编码DNA序列中的启动子区域，即基因转录起始点。
- 基因组装：使用机器学习算法将高通量测序数据拼接成完整的非编码DNA序列。
应用于编码DNA序列的机器学习模型：
- 蛋白质结构预测：使用机器学习算法预测编码DNA序列翻译后得到的蛋白质的三维结构。
- 位点预测：使用机器学习算法预测编码DNA序列中的功能位点，例如磷酸化位点、修饰位点等。
- 序列分类：使用机器学习算法将编码DNA序列分类为不同的基因家族或物种。