大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。m5C是已知的RNA修饰之一，但其在mRNA中的发育动态、功能和进化仍然知之甚少。最初报道m5C在mRNA中普遍存在，但后来认识到许多最初被鉴定的位点可能假阳性。准确和系统地检测转录组范围mRNAm5C水平一直具有挑战性，缺乏对m

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。卵巢是女性重要的生殖器官，也是最早表现出衰老迹象的器官之一，通常在35岁左右开始，卵巢衰老（ovarianaging，OA）是导致与年龄相关的不孕问题的重要因素，包括卵泡数量和卵子质量的逐渐下降，对女性生育能力构成威胁。m6A是一种普

新冠病毒入侵到消灭的分子角度介绍新冠病毒（SARS-CoV-2）入侵和宿主细胞的免疫反应是一个复杂而协调的分子过程。本文将详细介绍每个过程，从分子角度阐述新冠病毒的入侵到最终被宿主免疫系统消灭的全过程。阶段一：入侵病毒结合：新冠病毒的S蛋白与宿主细胞表面的ACE2受体结合，通过特

埃博拉病毒感染过程埃博拉病毒粒子具有约80-100纳米的直径,其中包含一个纺锤形的核心。该核心由NP蛋白质组成,紧密地包裹着单链RNA的病毒基因组,以保护其不被降解。粒子表面嵌入了约10纳米长的弹性蛋白GP,它可以与宿主细胞膜发生融合。GP的中间区域具有一个受体结合结构域,

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。卵巢癌是全球死亡率最高的妇科癌症，其中上皮性卵巢癌是最常见的卵巢癌类型。由于缺乏可靠的卵巢癌早期筛查，导致诊断延迟，5年生存率仅为50%。尽管近些年来治疗技术取得了进展，但由于其发病机制的基因调控网络不明确，卵巢癌

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。Sjögren综合征（Sjögren’ssyndrome，SS）相关干眼症是一种以泪腺（lacrimalglands，LGs）慢性炎症为特征的难治性自身免疫性疾病，表观遗传因子在SS相关干眼症发病机制中起着至关重要的作用。然而，泪腺中的DNA甲基化变化及其在S

第一节原核生物转录的模板和酶⚠️RNA合成需要：DNATemplate，NTP，RNApol，其他蛋白质因子，$Mg^{2+}$一、原核生物转录模板模板链（Templatestrand）VS编码链（Codingstrand）模板链为合成模板另一股单链为编码链，mRNA碱基序列与编码链一致二、RNA聚合酶催化RNA的合成

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。N4-乙酰胞苷（ac4C）是一种高度保守的化学修饰，广泛存在于真核和原核生物RNA中，如tRNA、rRNA和mRNA。这种修饰与多种人类疾病显著相关，尤其是癌症，其形成主要依赖于N-乙酰转移酶10（NAT10）（唯一已知ac4C的writer蛋白）的催化活性。

摘要：使用PLEKv2识别鉴定lncRNA，只需要输入RNA的序列（fa文件）即可。 在生物信息学领域，长非编码RNA（lncRNA）和信使RNA（mRNA）的准确区分对于理解基因调控机制至关重要。随着深度学习技术的兴起，我们迎来了PLEKv2——PLEK工具的全新升级版，它在RNA序列分类精度方面取得了显著提高。这里探

来自：scTranslator:Apre-trainedlargegenerativemodelfortranslatingsingle-celltranscriptometoproteome工程地址：https://github.com/TencentAILabHealthcare/scTranslator在scTranslator中，有3个阶段：pairedbulk上监督学习，pairedsc上监督学习，scRNA上推理。前

–https://stuartlab.org/signac/articles/pbmc_multiomic看文章看累了来看看代码，换换口味。本章主要涉及peakstogenes的联动。留意更多内容，欢迎关注微信公众号：组学之心数据下载：wgethttps://cf.10xgenomics.com/samples/cell-arc/1.0.0/pbmc_granulocyte_sorted_10k

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。脂肪组织是主要的脂肪沉积和代谢场所，在人类和动物的健康、代谢平衡和免疫稳态中起着重要作用。肥胖引起的多种代谢疾病已成为全球性健康问题。家禽腹部脂肪的过量沉积也会导致代谢疾病和增加饲料浪费，从而增加家禽生产

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。RNA修饰近来已成为热门话题，它们通过影响RNA生成、转运、功能和代谢等过程，是细胞生物学的关键调节因子。本文介绍了包括N6-甲基腺苷（m6A）、5-甲基胞嘧啶（m5C）、N1-甲基腺苷（m1A）、N7-甲基鸟苷（m7G）、N4-乙酰胞嘧啶（ac4C）、假尿苷

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)是真核生物mRNA中最丰富的化学修饰，在基因表达调控中发挥着重要作用，包括转录调控和转录后调控。m6A是一种可逆修饰，分别由甲基转移酶(writer)、去甲基化酶(eraser)和m6A结合蛋白(r

作者，EvilGenius参考文章Spatialepigenome–transcriptomeco-profilingofmammaliantissues|Nature单细胞多组学，特别是染色质可及性表观遗传和转录组同时测序分析，可以不仅鉴别细胞类型和状态同时还可以揭示控制基因表达的机理–常常被认为是单细胞组学分析的终极利器

作者按本章节详细讲解了基于RNA速率的三种拟时序模型，包括稳态模型，EM模型和深度学习模型，并对比了不同模型的适用场景与计算特点。本教程首发于单细胞最好的中文教程，未经授权许可，禁止转载。全文字数|预计阅读时间:5000|10min——Starlitnightly（星夜）5.2RNA速率1.背景单细

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。水稻是全球重要的农作物，也是单子叶植物模型。在水稻中，N6-甲基腺苷（m6A）mRNA修饰对植物的发育和胁迫响应至关重要。OsFIP37作为m6A甲基化复合体的核心组分，其缺乏会导致雄性不育，强调了m6A在雄性生育中的重要性。m6A是

单细胞测序技术是在单个细胞水平上，对基因组、转录组和表观基因组水平进行分析测序技术。bulkRNA-seq获得的是组织或器官等大量细胞中表达信号的均值，无法获取细胞之间的差异信息（即丢失了细胞的异质性），而单细胞测序技术可以很好的弥补bulkRNA-seq这一不足，即获取混合样本中

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。RIP-seq是将RNA免疫共沉淀（RNAImmunoprecipitation，RIP）与二代测序技术（NGS）相结合以研究细胞内RNA与蛋白互作的技术，RIP利用目标蛋白抗体把相应的RNA-蛋白复合物（RNABindingProtein，RBP）沉淀下来，然后经过富集和纯化就可以

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。喜讯！易基因表观转录组学RNA-BS技术服务见刊《ADVANCEDSCIENCE》表观遗传修饰包括有丝分裂遗传和稳定的修饰，这些修饰在不改变基础DNA序列的情况下调控基因表达。通常癌症中的表观遗传失调表现为突变、表观遗传修饰酶

1.详细介绍一下各种排序算法，以及对应的时间复杂度。冒泡排序（BubbleSort）基本思想：通过相邻元素之间的比较和交换，使每一趟最大的元素能像气泡一样“浮”到数列的一端。时间复杂度：最优情况：O(n)平均情况：O(n^2)最坏情况：O(n^2)空间复杂度：O(1)选择排序（SelectionSort）基

全文链接：https://tecdat.cn/?p=35691原文出处：拓端数据部落公众号分析师：QingLi在生物学和医学研究中，乳腺发育是一个复杂而精细的过程，涉及众多基因的表达调控。近年来，随着高通量测序技术的发展，RNA测序（RNA-seq）技术已经成为研究基因表达模式的有力工具。通过RNA-seq技术，我们可以获

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。视网膜母细胞瘤（retinoblastoma,RB）是儿童期最常见的眼内恶性肿瘤，可导致失明甚至死亡。RB1缺失（＞90%）和MYCN扩增（～10%）被认为是致癌驱动事件，导致细胞周期更新增强和癌基因激活。最近的研究表明，表观遗传缺陷也参与RB肿瘤进展

原作：Chaotropy引言：这篇文章是关于生命起源、无机起源、化学进化和RNA世界假说的系列文章中的第二篇。/机器翻译/现在让我们从另一个方向来看待进化：在今天的生命中，存在着一种高度保守的密码，我们人类与所有其他生物（无论是果蝇还是森林大象）都（部分地）共享这种密码。这个密码不是储

喜讯！易基因表观转录组学RNA-BS技术服务见刊《核酸研究》大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。2024年2月15日，吉林大学张涛、赵飞宇、李金泽为共同第一作者，吉林大学李占军、隋婷婷及赖良学为共同通讯在《NucleicAcidsResearch》（NAR/IF14.9）发表题为“Pro