大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。01.技术简述RNA修饰指在RNA分子上发生的化学变化，这些变化不涉及RNA序列改变，而是通过添加或去除某些化学基团来改变RNA分子的性质。甲基化修饰是最常见的RNA修饰之一，包括m6A、m5C、m1A、m7G等，参与RNA稳定性、定位、剪

Nature与Science重磅！AI与生物医药迎来百年来最重磅进展！https://mp.weixin.qq.com/s/Vw3Jm4vVKP14_UH2jqwsxA第一天理论部分深度学习算法介绍1.有监督学习的神经网络算法1.1全连接深度神经网络DNN在基因组学中的应用举例1.2卷积神经网络CNN在基因组学中的应用举例1.3循

在了解Future之前要明白线程同步和异步线程同步需要等待，线程异步无需等待Netty中的Future机制1，基于jdkFuture改造而来2，保留了同步获取结果的能力，也提供了异步的Listener机制Netty中的Future:Netty自己实现的Future继承了|DK的Future，新增了Listener机制，任务结束会回

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。卵巢癌是全球死亡率最高的妇科癌症，其中上皮性卵巢癌是最常见的卵巢癌类型。由于缺乏可靠的卵巢癌早期筛查，导致诊断延迟，5年生存率仅为50%。尽管近些年来治疗技术取得了进展，但由于其发病机制的基因调控网络不明确，卵巢癌

第一节原核生物转录的模板和酶⚠️RNA合成需要：DNATemplate，NTP，RNApol，其他蛋白质因子，$Mg^{2+}$一、原核生物转录模板模板链（Templatestrand）VS编码链（Codingstrand）模板链为合成模板另一股单链为编码链，mRNA碱基序列与编码链一致二、RNA聚合酶催化RNA的合成

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。N4-乙酰胞苷（ac4C）是一种高度保守的化学修饰，广泛存在于真核和原核生物RNA中，如tRNA、rRNA和mRNA。这种修饰与多种人类疾病显著相关，尤其是癌症，其形成主要依赖于N-乙酰转移酶10（NAT10）（唯一已知ac4C的writer蛋白）的催化活性。

摘要：使用PLEKv2识别鉴定lncRNA，只需要输入RNA的序列（fa文件）即可。 在生物信息学领域，长非编码RNA（lncRNA）和信使RNA（mRNA）的准确区分对于理解基因调控机制至关重要。随着深度学习技术的兴起，我们迎来了PLEKv2——PLEK工具的全新升级版，它在RNA序列分类精度方面取得了显著提高。这里探

来自：scTranslator:Apre-trainedlargegenerativemodelfortranslatingsingle-celltranscriptometoproteome工程地址：https://github.com/TencentAILabHealthcare/scTranslator在scTranslator中，有3个阶段：pairedbulk上监督学习，pairedsc上监督学习，scRNA上推理。前

–https://stuartlab.org/signac/articles/pbmc_multiomic看文章看累了来看看代码，换换口味。本章主要涉及peakstogenes的联动。留意更多内容，欢迎关注微信公众号：组学之心数据下载：wgethttps://cf.10xgenomics.com/samples/cell-arc/1.0.0/pbmc_granulocyte_sorted_10k

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。脂肪组织是主要的脂肪沉积和代谢场所，在人类和动物的健康、代谢平衡和免疫稳态中起着重要作用。肥胖引起的多种代谢疾病已成为全球性健康问题。家禽腹部脂肪的过量沉积也会导致代谢疾病和增加饲料浪费，从而增加家禽生产

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。RNA修饰近来已成为热门话题，它们通过影响RNA生成、转运、功能和代谢等过程，是细胞生物学的关键调节因子。本文介绍了包括N6-甲基腺苷（m6A）、5-甲基胞嘧啶（m5C）、N1-甲基腺苷（m1A）、N7-甲基鸟苷（m7G）、N4-乙酰胞嘧啶（ac4C）、假尿苷

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)是真核生物mRNA中最丰富的化学修饰，在基因表达调控中发挥着重要作用，包括转录调控和转录后调控。m6A是一种可逆修饰，分别由甲基转移酶(writer)、去甲基化酶(eraser)和m6A结合蛋白(r

作者，EvilGenius参考文章Spatialepigenome–transcriptomeco-profilingofmammaliantissues|Nature单细胞多组学，特别是染色质可及性表观遗传和转录组同时测序分析，可以不仅鉴别细胞类型和状态同时还可以揭示控制基因表达的机理–常常被认为是单细胞组学分析的终极利器

作者按本章节详细讲解了基于RNA速率的三种拟时序模型，包括稳态模型，EM模型和深度学习模型，并对比了不同模型的适用场景与计算特点。本教程首发于单细胞最好的中文教程，未经授权许可，禁止转载。全文字数|预计阅读时间:5000|10min——Starlitnightly（星夜）5.2RNA速率1.背景单细

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。水稻是全球重要的农作物，也是单子叶植物模型。在水稻中，N6-甲基腺苷（m6A）mRNA修饰对植物的发育和胁迫响应至关重要。OsFIP37作为m6A甲基化复合体的核心组分，其缺乏会导致雄性不育，强调了m6A在雄性生育中的重要性。m6A是

单细胞测序技术是在单个细胞水平上，对基因组、转录组和表观基因组水平进行分析测序技术。bulkRNA-seq获得的是组织或器官等大量细胞中表达信号的均值，无法获取细胞之间的差异信息（即丢失了细胞的异质性），而单细胞测序技术可以很好的弥补bulkRNA-seq这一不足，即获取混合样本中

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。RIP-seq是将RNA免疫共沉淀（RNAImmunoprecipitation，RIP）与二代测序技术（NGS）相结合以研究细胞内RNA与蛋白互作的技术，RIP利用目标蛋白抗体把相应的RNA-蛋白复合物（RNABindingProtein，RBP）沉淀下来，然后经过富集和纯化就可以

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。喜讯！易基因表观转录组学RNA-BS技术服务见刊《ADVANCEDSCIENCE》表观遗传修饰包括有丝分裂遗传和稳定的修饰，这些修饰在不改变基础DNA序列的情况下调控基因表达。通常癌症中的表观遗传失调表现为突变、表观遗传修饰酶

1.详细介绍一下各种排序算法，以及对应的时间复杂度。冒泡排序（BubbleSort）基本思想：通过相邻元素之间的比较和交换，使每一趟最大的元素能像气泡一样“浮”到数列的一端。时间复杂度：最优情况：O(n)平均情况：O(n^2)最坏情况：O(n^2)空间复杂度：O(1)选择排序（SelectionSort）基

全文链接：https://tecdat.cn/?p=35691原文出处：拓端数据部落公众号分析师：QingLi在生物学和医学研究中，乳腺发育是一个复杂而精细的过程，涉及众多基因的表达调控。近年来，随着高通量测序技术的发展，RNA测序（RNA-seq）技术已经成为研究基因表达模式的有力工具。通过RNA-seq技术，我们可以获

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。视网膜母细胞瘤（retinoblastoma,RB）是儿童期最常见的眼内恶性肿瘤，可导致失明甚至死亡。RB1缺失（＞90%）和MYCN扩增（～10%）被认为是致癌驱动事件，导致细胞周期更新增强和癌基因激活。最近的研究表明，表观遗传缺陷也参与RB肿瘤进展