- 2024-10-17易基因:DNA甲基化+转录组综合分析鉴定调控猪睾丸发育的潜在基因|附经典研究思路
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。DNA甲基化在调控基因表达和睾丸发育中发挥重要作用。WGBS和RNA-Seq数据综合分析可以绘制DNA甲基化与基因表达关系的全面图谱,从而鉴定受甲基化影响的关键基因。如对小鼠睾丸组织中WGBS和RNA-Seq的分析揭示了与
- 2024-07-17全基因组DNA甲基化测序数据工作流程分析和性能评估 分析软件比较 | 生信专区
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。DNA甲基化与转录调控、基因组印记、干细胞分化、胚胎发育和炎症等过程有关。DNA甲基化异常可能揭示疾病状态,包括癌症和神经系统疾病。因此,人类基因组中5-甲基胞嘧啶(5mC)分布和位点是一个重要的研究方向。全基因组重亚
- 2024-05-15易基因: WGBS等揭示梨驯化和改良过程中DNA甲基化对果实成熟的作用机制 | 作物育种
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。梨(Pyrusssp.,蔷薇科杏仁核亚科)是世界上最重要的温带水果作物之一。与野生梨相比,栽培梨的果实在许多形态特征上表现出显著变化,包括果实大小、含糖量和核细胞含量。野生梨和栽培梨之间的比较分析可以深入了解关键表型变
- 2024-05-09易基因:cfDNA甲基化组多模式分析早期检测食管鳞状细胞癌和癌前病变|Nature子刊
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。食管癌(EC)是最常见的胃肠道恶性肿瘤之一,食管鳞状细胞癌(ESCC)是EC的主要组织学亚型,约占新EC病例的88%,大多数发生在东亚和中亚。与晚期ESCC的预后极差相比,早期ESCC(如黏膜内ESCC)和前体病变(如上皮内瘤变,IEN)可以通过内镜下整
- 2024-04-15WGBS上游分析
WGBS的分析全流程:主要参考资料:WGBS甲基化分析Bismark软件使用入门沉浸式体验WGBS(上游)甲基化流程浅析听说你不会处理WGBS数据?安排上全基因组甲基化分析简述:使用BS-Seeker2BismarkBisulfiteMapper学习笔记(二)甲基化信息提取以及文件解读DNA甲基化分析流程详解查看用
- 2024-01-16易基因: WGBS+RNA-seq揭示黄瓜作物的“源-库”关系受DNA甲基化调控|项目文章
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。作物产量取决于库(sink,获得同化物)的潜力和源(source,供给同化物)的能力,“源—库”关系的优化对作物产量调控具有重要意义。黄瓜(CucumissativusL.)是世界范围内广泛种植的蔬菜,是我国具有巨大经济价值的七大蔬菜之一,叶片和
- 2023-10-26易基因: WGBS等从DNA甲基化揭示杀鲑气单胞菌灭活疫苗对大菱鲆的免疫力:抗性育种
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。DNA甲基化是表观遗传学中最重要的修饰之一,在免疫应答中发挥着重要作用。自引进大菱鲆(Scophthalmusmaximus,商品名:多宝鱼)以来,养殖规模不断扩大,其间各种细菌、病毒和寄生虫引起的疾病日益严重。因此,灭活疫苗以其独
- 2023-08-295mC DNA甲基化介导茶树组织功能分化和重要风味物质合成调控|植物研究
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。在植物中,5mCDNA甲基化修饰(简称5mC甲基化)是一个重要而保守的表观基因标记,参与基因组稳定性、基因转录调控、发育调控、非生物胁迫响应、代谢物合成等多种调控。茶树(Camelliasinensis(L.)O.Kuntze)是一种缺乏成熟遗传
- 2023-08-24易基因:WGBS等揭示丹参甲基化表征及DNA甲基化在丹参酮生物合成中的调控机制|科研速递
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。丹参(Salviamiltiorrhiza,S.miltiorrhiza)是一种具有重要经济价值和药用价值的模式药用植物,丹参的根会合成一组称为丹参酮(tanshinone)的二萜类亲脂性生物活性成分。丹参酮的生物合成和调控引起广泛关注。DNA甲基化变化