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2024-09-24下载测序数据那些事儿（一）
文章目录前言检索下载数据坑聊聊天前言最近在下载（分析）公共数据，无法避免的从NCBISRA数据库下载已发表的“”优质“”数据。曾经一直以为，数据下载就是小case，直到我因为下载数据，折腾了几天……所以，聊一下目前下载拆分单细胞转录组测序数据踩过的SHIT。希望能为
2024-07-21《痞子衡嵌入式半月刊》第 105 期
痞子衡嵌入式半月刊：第105期这里分享嵌入式领域有用有趣的项目/工具以及一些热点新闻，农历年分二十四节气，希望在每个交节之日准时发布一期。本期刊是开源项目（GitHub:JayHeng/pzh-mcu-bi-weekly），欢迎提交issue，投稿或推荐你知道的嵌入式那些事儿。上期回顾：《痞子衡嵌入式半月
2024-07-17利用bwa将自己的数据与参考基因组比对与sam格式转换
1.bwa的下载与安装https://www.jianshu.com/p/19f58a07e6f4主要参考这篇帖子，如果之前的步骤都走通了的话，依赖什么的不用特别安装，报错了再补也可以安好了之后，进到他的路径，输./bwa,就可以确认bwa有没有安装好了，环境设置好以后可以在其他地方输入bwa，也可以叫他出来。在正式开始
2024-06-20单细胞测序最好的教程（十四）测序原始数据公开至NCBI数据库
作者按国内对于单细胞测序相关的中文教程确实不够全面，当然NCBI官网给的上传教程也比较详细了，所以变成了会者不难。本教程你现在可能用不上，但是你如果做单细胞测序，那么未来你一定会用上，建议收藏。在这里，我们将演示如何将测序文件完整上传到NCBI上。本教程首发于单细胞最好的中文
2024-04-1152 Things: Number 26: Describe the NAF scalar multiplication algorithm.
52Things:Number26:DescribetheNAFscalarmultiplicationalgorithm.52件事：第26件：描述NAF标量乘法算法。 Thisisthelatestinaseriesofblogpoststoaddressthelistof '52ThingsEveryPhDStudentShouldKnow' todoCryptography:asetofquestion
2023-12-27bwa比对
GATKfastpbwa---产生sam文件bwa有三种算法,其中mem比较全面bwaindexref.fa先建立index,下载参考基因组的fasta文件。？不知道可不可以用压缩文件，教程是解压的。在操作的时候我也解压了bwamemref.faread1.fqread2.fq>aln-pe.sam#无参数R这里输入的.fq可以是压缩
2023-12-17ICPC2023重庆市赛游记
人生总是由遗憾构成的Day-1比赛前2天，由于dlh和fq需要考四级，所以我提前到重庆来"旅游"。来的路上vp了一场codeforsediv.2，1.5h写了3题，手感不是很好（也有可能题太阴间）来到重庆，天下着小雨，但是我还是开始我的CityWalk--ChongQing，我循着5年前的足迹走在解放碑
2023-12-17stepValue
<body><styletype="text/css">*{margin:0;padding:0;}textarea{display:block;margin:50pxauto;padding-left:0;width:40
2023-11-2515-有参转录组实战1-批量质控-fastp
#本教程部分参考B站15天入门生物信息教程，在开启以下教程前，请务必看看我前面两个教程，Linux系统上安装R语言（https://www.bilibili.com/read/cv24718269）和下载好转录组（https://www.bilibili.com/read/cv24719254）。#1，我们对上次下载的转录组进行实战分析，首先进行质量控制，使用fast
2023-10-15fqkit: 一个处理fastq序列的小工具（一）
一个用于处理fastq测序文件的命令行小工具，功能还在不断更新中，子命令也不多，支持gzip压缩文件的输入和输出（结果文件名以.gz结尾，结果会自动压缩）。reop:https://github.com/sharkLoc/fqkitinstall:cargoinstallfqkitusage:fqkit:asimpleprogramforfastqfilemanipulatio
2023-10-12汇编实战！手把手教你从“计算器”入门汇编语言
基于汇编语言的简单整数计算器设计与实现（此代码仅供学习使用，请勿用作其他用途）摘要本论文介绍了一款使用汇编语言编写的简单整数计算器程序，该程序支持基本的四则运算操作，并能处理包含括号的数学表达式。本文通过分析程序的代码结构，宏定义、数据段、子程序以及关键功能的实
2023-09-24crash —— 获取所有内核符号
查看所有的内核符号以及地址crash>sym-l0(D)__per_cpu_start0(D)irq_stack_union4000(D)cpu_debug_store5000(D)cpu_tss_rw8000(D)gdt_page9000(d)exception_stackse000(d)entry_stack_storagef000(D)espfix_waddrf008(D)espfix_stackf010(D)cpu
2023-08-16安卓环境配置
好久没搞android，一些基础配置忘得差不多了，这里慢慢回忆补充下。window:AndroidIDE需要FQ。gradle更新失败，一般是代理配置错误。需要修改代理，位置为：gradle/gradle.properties.一般代理不支持HTTPS，屏蔽即可。安装JavaSDK,https://www.oracle.com/cn/java/technologies/
2023-06-16背包问题 V3（ $01$ 分数规划入门题）
附赠题目链接：$\text{51Nod-1257}$目录$\text{description}$$\text{sol}$$\text{CODE}$$\text{Else}$$\text{description}$$n$个物品的体积为$w_1,w_2,\cdots,w_n$（$w_i$为整数），与之相对应的价值为$p_1,p_2,\cdots,p_n$（$p_i$为整数），从中选出\(
2023-05-16windows系统下校验测序数据MD5？
本地上传测序文件到Linux系统，做md5时发现有少数文件失败。$catmd5.check84305_FDSW190448400-1a_1.fq.gz:OK84305_FDSW190448400-1a_2.fq.gz:FAILEDmd5sum:WARNING:1computedchecksumdidNOTmatch可能是上传有误，也可能是本地测序文件本身不完整。但是文件太大，在没
2023-04-02有限域的实例化表示探讨
Z /(p)有限域最普通的例子是Zp= Z/(p)，其中Z是整数环，p是一个素数. Zp有非常直观的实例化表示，即：Zp={0+(p),1+(p),...,p-1+(p)}={[0]p,[1]p,...,[p-1]p}.这个表示法可以非常直观地看到char(Zp)=p，以及(Zp,+)构成加法交换群，比如[i]p的加法逆元
2023-02-12IntelliJ IDEA插件
1.官方汉化：Chinese(Simplified)LanguagePack（软件使用利器）2.文本翻译：Translation（源码阅读利器）可以FQ的使用默认的Google翻译，不能FQ的改成微软翻译即可使用就是右
2023-02-05DaemonSet方式部署nginx-ingress
前言nginx-ingress是k8s官方维护的一个IngressController，具体使用，官方有详细的文档：https://kubernetes.github.io/ingress-nginx/deploy/直接按照官方文档进行安装，一般
2023-01-05Metagenome数据库构建_物种组成_丰度估计 2023.01.04
物种组成_丰度估计***下载数据库###kraken2databasewgethttps://genome-idx.s3.amazonaws.com/kraken/k2_pluspf_8gb_20210517.tar.gztar-zxvfk2_pluspf_8gb_20210517.
2023-01-04Metagenome宏基因组质控过滤比对去除宿主 2023.01.01-202301.02
质控过滤比对去除宿主#云硬盘挂在100Gvirtio-disk-bxgzkldx/dev/disk/by-id/virtio-disk-bxgzkldx/dataext4defaults00#uniport数据库下载wgethttps://ftp.unip