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编程问答
Desmond
2022-12-09
【译】Desmond命令行介绍
本手册描述了在Schrödinger环境中通过命令行使用Desmond的情况:使用Schrödinger作业控制设施运行作业所需的程序、实用程序和文件。Desmond后端在执行作业时使用其他文件
2022-12-06
【译】Desmond2022-4_7分析Desmond模拟
您可以用几种方法来分析Desmond模拟。有些分析可以在任何分子动力学模拟上进行,有些则只能在特定类型的模拟上进行。要以电影形式播放轨迹,提取快照,并进行交互式分析,请使用
2022-12-06
【译】Desmond2022-4_4从maestro运行Desmond模拟
Desmond面板使您能够设置和运行Desmond的主要任务:分子动力学、最小化、模拟退火、复制交换和元动力学工作。这些面板的设计是为了使设置这些类型的工作尽可能简单,并提供最
2022-12-06
【译】Desmond2022-4_2计算概述
2.计算概述Desmond工作应该从准备好的结构开始。对于蛋白质,我们建议用蛋白质制备向导来制备(详见《蛋白质制备指南-内容》)。对于其他类型的分子,如配体,分子应该有一个相当好