• 2024-11-01Anthropic 推出 Claude 桌面应用支持语音转录
    Anthropic推出了其AI聊天机器人Claude的桌面应用,支持Mac和Windows系统。这一新应用旨在将Claude的功能直接整合到用户的工作环境中,但目前不包括最近宣布的计算机使用功能。桌面应用对免费用户和订阅高级计划的用户均可用。此外,Anthropic还发布了Claude的听写
  • 2024-10-23SpatialDB:让空间转录组数据可视化
    SpatialDB:让空间转录组数据可视化原创修改于 2021-08-3115:30:101.3K0举报文章被收录于专栏:国家基因库生命大数据平台2019年11月,来自中国科学院生物物理研究所高通量测序中心的研究人员发布第一个单细胞空间转录组数据库及数据在线可视化平台:Spatial
  • 2024-10-21零基础入门转录组下游分析——数据处理(TCGA数据库)
    零基础入门转录组下游分析——数据处理(TCGA数据库)目录零基础入门转录组下游分析——数据处理(TCGA数据库)1.数据集获取2.数据处理(Rstudio)TCGA应该是肿瘤数据最权威的来源之一,但是从TCGA上下载数据集相对来说比较麻烦,因此出现了很多针对TCGA数据进行二次开发的衍生
  • 2024-10-18论文分享|[ACL 2024] 鲁棒的歌声转录服务于合成
    题目:RobustSingingVoiceTranscriptionServesSynthesisRobustSingingVoiceTranscriptionServesSynthesis作者:RuiqiLi, YuZhang, YongqiWang, ZhiqingHong, RongjieHuang, ZhouZhao论文:RobustSingingVoiceTranscriptionServesSynthesisDemo:RobustS
  • 2024-10-16流程升级----空间CNV分析流程升级
    作者,EvilGenius这一篇我们要继续升级我们的分析流程了,对于空间CNV分析,拿到如下的结果:我们需要借助inferCNV+python的力量实现这个目标。空间转录组的CNV(拷贝数变异)分析是一项通过空间基因表达数据来推测基因组拷贝数变异的技术。CNV分析可以帮助我们理解肿瘤或其他
  • 2024-09-18120分的转录组试题 (第一份答案)
  • 2024-09-13Whisper 模型在实时语音转录中有哪些具体的应用场景?
    关注我,持续分享逻辑思维&管理思维&面试题;可提供大厂面试辅导、及定制化求职/在职/管理/架构辅导;推荐专栏《10天学会使用asp.net编程AI大模型》,目前已完成所有内容。一顿烧烤不到的费用,让人能紧跟时代的浪潮。从普通网站,到公众号、小程序,再到AI大模型网站。干货满满。学成后可
  • 2024-08-29空间课程汇总
    作者,EvilGenius有人举报,不让上课,不让分享课程,不让收学员,我把内容全部汇总出来,大家如果有需要备一份,万一敌对势力强大,不得不屈服,也是没办法的事。2024年课程从6月22号开始上第一节课,8月21号上最后一节,视频全部上传到了B站,B站名字七夜听雪ii,连接在https://space.bilibili.com/
  • 2024-08-20【生化代谢基础笔记】RNA 合成
    第一节原核生物转录的模板和酶⚠️RNA合成需要:DNATemplate,NTP,RNApol,其他蛋白质因子,$Mg^{2+}$一、原核生物转录模板模板链(Templatestrand)VS编码链(Codingstrand)模板链为合成模板另一股单链为编码链,mRNA碱基序列与编码链一致二、RNA聚合酶催化RNA的合成
  • 2024-08-11BMC Genomics | 火龙果的转录组和代谢组分析揭示了果皮和果肉颜色形成的机制
    阐明火龙果果肉和果皮变色的候选基因和关键代谢产物,是培育具有优良新口味和高营养价值的火龙果的必要条件。在这里,使用转录组(RNA-Seq)和代谢组分析(UPLC-MS/MS)鉴定了属于两种不同量天尺属物种的三种火龙果的结构和调控基因以及与果皮和果肉颜色相关的关键代谢物。作者综合的转录
  • 2024-08-10生信技能总汇,总有一个技能可以帮助你!
    2022年教程总汇2023年教程总汇2024年更新文档对于教程,我们会持续更新!!!!若我们的教程对你有所帮助,请点赞+收藏+转发,这是对我们最大的支持。往期部分文章1.最全WGCNA教程(替换数据即可出全部结果与图形)WGCNA分析|全流程分析代码|代码一WGCNA分析|
  • 2024-08-08Genomics | 转录组和代谢组分析揭示了铁皮石斛中黄酮类化合物的积累
    铁皮石斛是一种在中国有着悠久使用历史的中草药。黄酮是铁皮石斛重要的次生代谢产物,但其在铁皮石斛中的分子调控机制尚不清楚。在这项研究中,作者收集了一年到四年生的铁皮石斛茎,用于rna测序和质谱数据收集。结果表明,代谢组学分析检测到124种不同的类黄酮代谢物,其中黄酮醇代谢物在
  • 2024-08-01Nature 对阿尔茨海默病进行单细胞转录组分析|详细解读
    Alzheimer’sdiseaseisapervasiveneurodegenerativedisorder,themolecularcomplexityofwhichremainspoorlyunderstood.Here,weanalysed80,660single-nucleustranscriptomesfromtheprefrontalcortexof48individualswithvaryingdegreesofAlzhe
  • 2024-07-29单细胞转录组上游fasta文件处理
    单细胞分析上游fasta文件处理——基于cellranger与dropseqRunner ###如果测序文件由10Xgenomics平台产生,则采用cellrangercount的基本流程进行fasta文件的上游处理;如果测序文件由dropseq平台产生,则采用dropseqRunner软件进行处理一、cellranger配置1、软件安装并查看帮助
  • 2024-07-24视频提取字幕软件有什么?推荐视频提取字幕软件
    在视频成为主流信息载体的今天,如何高效地从视频中提取知识成为了一个热门话题。设想一下,如果能够将视频中的对话直接转换成文字,不仅便于学习,还能方便分享。而“视频字幕提取成文字”技术正是为了满足这一需求而生。它将打开一个全新的视角,让人们可以更轻松地获取和利用视频
  • 2024-07-16录音转文字软件哪个最好用?下文告诉你
    7月15日,初伏的序幕缓缓拉开,在这一年之中最炎热的三伏天里,高温不仅考验着我们的耐心,也影响着我们的学习效率。当炎热让人难以集中精神,一款优秀的音频转文字软件无疑是学习的得力助手。无论是课堂录音,还是讲座资料,这款智能工具都能快速准确地将音频内容转换成文字,让你在复习时
  • 2024-07-01空间表观组学与转录组学联合分析
    作者,EvilGenius参考文章Spatialepigenome–transcriptomeco-profilingofmammaliantissues|Nature单细胞多组学,特别是染色质可及性表观遗传和转录组同时测序分析,可以不仅鉴别细胞类型和状态同时还可以揭示控制基因表达的机理–常常被认为是单细胞组学分析的终极利器
  • 2024-06-16课前准备-单细胞转录组联合VDJ数据分析
    作者,EvilGenius而我们需要实现的分析,即VDJ聚类与motif分析分析会在课上讲到,报名链接在2024年单细胞空间系列课程完整脚本如下(封装版)importnumpyasnpimportpandasaspdimportmatplotlib.pyplotaspltimportrandomimporttensorflowastffr
  • 2024-06-12易基因:表观基因组分析揭示转录因子结合区DNA甲基化表征其功能和进化背景 | 研究速递
    大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。DNA甲基化是一种重要的表观遗传修饰,对调控基因组功能有多种作用。其水平在整个基因组中具有空间相关性,通常在被抑制区域较高,在转录因子(TF)结合位点(TFBS)和活性调控区域较低。然而建立全基因组和TF结合位点甲基化模
  • 2024-05-31DecoupleR/CollecTRI network-单细胞转录因子活性分析
    DecoupleR包是一个可以从组学数据中分析内部生物学活性的计算方法集合。该R包内部收纳了11种分析方法,包括GSVA,GSEA,univariatelinearmodel(ULM),VIPER等。PMID:36699385根据包含的计算方法,我们也能大概的知道decoupleR包能够做哪些分析了,包括基本分析(AUCell,FastGSEA,
  • 2024-05-29空间转录组共定位展示分析图
    作者,EvilGenius关于空间共定位(细胞和配受体)的展示方式已经提供了好几种了,列在下面,供大家参考空间转录组细胞类型和配受体的空间定位图空间细胞类型方向图空间细胞类型密度分布图空间转录组数据分析之近邻热图绘制10X空间转录组绘图分析之体现两种细胞类型的空间位置10X
  • 2024-05-29空间组学邻域分析方法更新之BANKSY
    作者,EvilGenius最近分享了一些关于多组学的内容,其实就有人问我单细胞的数据能callsnp么?这个问题的答案是看情况,我们都知道单细胞数据的捕获原理,那么3‘数据是几乎不能callsnp的,唯有5'在某些情况下是可以的,例如前面分享的KRAS的G12D突变,就在单细胞5’数据的测序范围之内,就可
  • 2024-04-02预测蛋白是否为转录因子?
    1.TFpredictandSABINE:Sequence-BasedPredictionofStructuralandFunctionalCharacteristicsofTranscriptionFactors(TFpredict和SABINE:基于序列的转录因子结构和功能特征的预测)DOI:10.1371/journal.pone.0082238有一个疑问为啥不能找到在线预测的呀???2.DeepTFacto
  • 2024-03-19生信项目之生信名词解释
    目录一、高通量测序与Hi-C测序二、宏基因组三、启动子,终止子,起始密码子,终止密码子四、Read,Reads,Contig,Contigs五、CDS与ORF六、测序深度与覆盖度七、进化树,分子树,系统发生树一、高通量测序与Hi-C测序高通量测序技术(High-throughputsequencing)又称“下一代”测序技术
  • 2024-03-19转录后剪接——AltAnalyze
    AltAnalyze是一个免费提供、开源和跨平台的程序,允许您获取RNASeq或相对原始的微阵列数据(CEL文件或标准化),识别预测的替代剪接或替代启动子变化,并查看这些变化如何影响蛋白质序列,结构域组成和microRNA靶向。AltAnalyze与任何RNASeq数据(外显子和/或连接点)、多种Affymetrix