转录后剪接——AltAnalyze

AltAnalyze 是一个免费提供、开源和跨平台的程序，允许您获取 RNASeq 或相对原始的微阵列数据（CEL 文件或标准化），识别预测的替代剪接或替代启动子变化，并查看这些变化如何影响蛋白质序列，结构域组成和 microRNA 靶向。 AltAnalyze 与任何 RNASeq 数据（外显子和/或连接点）、多种 Affymetrix 剪接敏感阵列类型（Gene 1.0、外显子 1.0、连接点）以及许多常规阵列类型（例如，Affymetrix、Illumina、安捷伦）兼容。 该软件不需要生物信息学程序或脚本的高级知识。 您所需要的只是您的连接点/外显子读取或微阵列文件以及您正在分析的条件的一些简单描述。 在 AltAnalyze 2.0 中引入了 RNASeq 支持。 本网站以及 http://www.altanalyze.org 上提供了 AltAnalyze 文档和安装程序。