标签：分析 联合 课程 汇总 细胞 转录 单细胞 空间
作者，Evil Genius
有人举报，不让上课，不让分享课程，不让收学员，我把内容全部汇总出来，大家如果有需要备一份，万一敌对势力强大，不得不屈服，也是没办法的事。
没办法，视频如果举报有下架的风险。
B站从最开始的单细胞分析课程，到如今的系列多组学课程，一共70个视频。
2024年全系列课程表，略有改动，包括单细胞六课，空间22课，2节汇总课程，空间包括Visium、HD、Xenium。
第一课:单细胞联合突变信息分析
第二课:单细胞数据分析之新版 velocity
第三课:单细胞数据分析之 CNV 聚类
第四课:单细胞通讯分析大汇总(cellphoneDB、NicheNet、CellChat)
第五课:单细胞联合 VDJ分析
第六课:单细胞联合 ATAC 分析
第七课:空间转录组整合分析与形态学判定(空间注释)
第八课:单细胞空间联合分析(cell2location)与区域细胞富集
第九课:空间细胞类型共定位与细胞通路同定位
第10课:单细胞空间联合分析之 MIA
第 11 课:空间生态位通讯与 COMMOT
第 12 课:空间转录组之分子 niche 与细胞 niche
第 13 课:空间网络(基因、细胞、通路网络)
第14课:空间转录组微生物的检测运用
第 15 课:空间 VDJ(暂定)
第 16 课:空间 CNV burden 与 CNV 聚类
第 17 课:空间邻域分析(banksy、CellNeighborEx)，分子邻域与细胞邻域
第 18 课:空间转录组 hotspot
第 19 课:空间细胞“社区”(空间细胞“unit”)
第20课:空间基因梯度
第21课:空间转录组的活性空间域
第 22 课:空间转录组之 velocity
第 23 课:空间轨迹
第24课:细胞邻域特征评分(异型细胞网络)
第25课:空间分子生态位差异分析
第 26 课:高精度 HD 平台数据分析框架
第 27 课:高精度 HD 平台分析内容与 niche
第 28 课:Xenium 分析框架
第29 课:原位数据细胞分割导论
第 30 课:Xenium 生态位分析与微环境分析
2023年全系列空间课程表，也略有改动。
空间基础处理（Seurat）
空间多样本联合分析（Seurat）
空间基础处理（scanpy）
单细胞空间联合分析（Seurat）
单细胞空间联合分析（cell2location）
单细胞空间联合分析（RCTD）
单细胞空间联合分析（MIA）
空间转录组通讯分析（stlearn）
空间转录组通讯分析（COMMOT）
空间转录组轨迹分析（SPATA2）
空间转录组CNV分析（SPATA2、siCNV）
空间转录组富集分析（GSVA、包括marker的富集打分）
空间转录组高级绘图（细胞共定位、饼图、空间密度图）
空间转录组高级绘图（细胞类型方向图、区域细胞密度气泡图）
空间转录组绘图（配受体空间分布、配受体共定位、细胞定位近邻热图）
空间转录组细胞聚类
空间转录组细胞共定位
空间转录组细胞网络（cell degree）
空间轨迹（SPATA2）
空间基因开关
空间轨迹向量场
空间文章复现
还有很多单细胞的课程
生活很好，有你更好
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