Day1!上次我们挑战成功NHANES已经成功投稿啦，但是meta的PROSPERO还没下来，只有继续等等啦。这次我们发起7天药物靶向MR挑战！Day1:老规矩，还是设定目标期刊药物靶向MR发的文章分都很高啊，检索一下就发现基本是顶刊文章，确实这个概念比较火热，发文数量也在疯狂增长。同样的思路

生信碱移语言模型嵌入小编先前分享了使用ChatGPT基因嵌入做平替的顶刊文章GenePT，只需要在原本的领域工作上插入这类的GPT嵌入，就能够实现降维打击。▲对于GenePT或者嵌入感兴趣的铁子，可以点击查看上面这篇推文。今天冲浪的时候又看到一篇文章提出的工具Scouter，做的是基因

在只有药物-基因（drug-gene）交互关系的任务中，设置零样本（Zero-ShotLearning,ZSL）和少样本（Few-ShotLearning,FSL）链路预测任务可以通过以下几种方法进行数据集划分和任务设计。1.核心思路零样本链路预测：完全移除特定药物或基因的交互数据，在测试时预测这些未见过的节点或关系。

EstablishingKomagataellaphaffiiasaCellFactoryforEfficientProductionofCholesterolSulfate将Komagataellaphaffii建立为高效生产胆固醇硫酸的细胞工厂摘要胆固醇硫酸（CS）是一种胆固醇的硫酸化衍生物，由于其广泛的生物学和药理学活性，在医学领域具有重要应用

一、CHIP-qPCR作用        CHIP-qPCR（染色质免疫共沉淀结合定量聚合酶链反应）是一种用于研究蛋白质与DNA相互作用的技术。它结合了染色质免疫共沉淀（ChIP）和定量聚合酶链反应（qPCR）两种方法，具有以下几个主要作用：分析蛋白质与DNA的相互作用：CHIP-qPCR可以用来检测特定蛋白质

给定一棵n个节点的有根树，节点i的父节点为parents[i]，根节点的父节点为-1，节点的基因值等于自身编号。有m个询问，queries[i]=[node[i],val[i]]，返回从根节点到node[i]的路径上所有节点基因值与val[i]的异或最大值。2<=n<=1E5;1<=m<=3E4;0<=val[i]<=2E5分析：01-trie+离线+dfs。（1）用01

前言遗传算法是数学建模中非常重要的一种搜索和优化算法，掌握遗传算法的精髓除了在竞赛中具有优势以外，更主要的是在解决实际问题的时候提供了一种全新的思路，通过将现实中的某种模式转换成算法，并用以解决某种问题的这种思路，或许是算法创新，提高效率的另一条路。本文将会介绍

一、案例背景某制药公司致力于研发一种新型抗癌药物，以满足市场对更有效治疗癌症的迫切需求。传统的药物研发过程漫长、成本高昂且成功率较低，该公司希望借助数据挖掘技术，充分利用现有的海量生物医学数据、临床试验数据以及药物研发过程中积累的数据，加速药物研发进程，提高研发效

小罗碎碎念今天分享的这篇文章于2024-05-21发表于CellReportsMedicine。这篇文章介绍了一个深度学习系统，该系统能够通过分析组织学图像来预测肿瘤微环境（TME），并提高癌症患者的预后准确性。角色姓名单位名称（中文）第一作者RuitianGao上海交通大学生命科学与生物技术学院

 以下是如何在R中使用tscR包来计算Frechet距离的基本步骤。安装和加载tscR包首先，您需要安装并加载tscR包。可以使用以下命令：R复制代码install.packages("tscR")library(tscR)准备时间序列数据tscR包中的FrechetDist函数需要输入两条时间序列。

今天为大家介绍新加坡国立大学ChenJinmiao实验室2024年10月25日发表在NatureMethods上的空间转录组学分析工具：scTM。该工具结合主题模型和深度生成模型，基于空间位置和基因表达信息，提取低维空间主题及生物相关的基因模块。说的通俗点就是把具有相似空间分布的基因作为一个基因

本文几乎没有任何现实依据，全是脑子里乱跑。前几天在思考这样一串问题：为什么那些具有抑郁倾向和自杀倾向的基因会在自然选择从里被保留下来呢？具有这些性状的个体显然应该是被自然选择淘汰掉了才对阿？（杀的就是你哈）为什么那些编码着噩梦的片段得以从从几万年几亿年的尺度上保留下来

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。结直肠癌（colorectalcancer，CRC）是全球范围内致死率极高的癌症之一，尤其是晚期患者。尽管手术切除是CRC的主要治疗手段，但肿瘤转移仍是影响患者长期生存的关键难题，而化疗对于提高生存率的效果有限。糖皮质激素（Glucocortic

一、引言在当今科技飞速发展的时代，人工智能（AI）和基因编辑技术成为了推动农业变革的两大关键力量。随着全球人口的不断增长和对粮食需求的日益增加，培育高效作物成为解决粮食安全和可持续发展问题的重要途径。人工智能和基因编辑技术的结合为实现这一目标带来了前所未有的机遇。

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。生菜（LactucasativaL.，莴苣属）是世界范围内重要的菊科（Asteraceae）蔬菜作物，全球广泛种植，也是人类植物营养素的重要来源。现代生菜品种根据形态特征被分为多个不同的园艺类型，包括奶油生菜、脆叶生菜、cos（也称为罗马生

单细胞转录组已在生物学研究中广泛应用，但仅靠此技术无法全面反映细胞核内的染色质状态及其调控机制。为此，单细胞ATAC测序技术应运而生，它能在单细胞水平上揭示染色质的可及性，提供基因调控元件活性的重要信息。将单细胞ATAC与单细胞转录组相结合，能综合解读基因表达调控，解析细胞分

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。全球约有3800万HIV-1感染者，每年新增感染者约150万。HIV-1主要攻击CD4+T细胞，导致其耗竭，最终发展为艾滋病和死亡。尽管抗逆转录病毒治疗有效抑制HIV-1复制，但由于病毒在潜伏感染细胞中的持续存在，这种病毒仍然是一个重大

WGCNA+网药+分子对接+体外实验提到网络药理学，许多人首先会联想到它在中医药领域的应用，但事实上，这种高效的生物信息学方法在多种研究领域都展示出了广泛的适用性。今天要分享的是一篇发表在《BritishJournalofDermatology》（影响因子11.0）的研究文章。该研究创新性地整合了WGC

CRISPR-Cas9基因编辑：基因编辑是指通过改变生物体基因组中的DNA序列，来修改和调控特定基因的表达或功能。CRISPR-Cas9基因编辑技术是一种广泛应用的基因编辑方法，它利用CRISPR（簇间重复短回文序列）和Cas9（CRISPR相关的蛋白质9）酶的系统来实现精确的基因组编辑。   CRISPR-Cas9基

中文关键词：时序数据聚类，时间序列数据聚类，基因表达数据聚类，机器学习，角度特征 中文摘要：在对基因表达进行聚类时，预计同一聚类中基因的相关系数很高，大多数聚类的基因本体（GO）富集分析将具有重要意义。然而，现有的短期基因表达聚类算法存在局限性。为了解决这个问题，我们提出了一种基

中文关键词：单细胞测序scRNA-seq，基因调控关系，基因调控网络，调控因果关系，深度学习，机器学习 中文摘要：基因调控网络（GRNs）揭示了生物体内基因之间的复杂相互作用，这对于理解生命系统的运作至关重要。生物技术的快速发展，特别是单细胞RNA测序（scRNA-seq），产生了大量的scRNA-eq数据，可以在

组学常见图形应用PCA图的作用以及使用技巧PCA图的原理：基本概念PCA（PrincipalComponentAnalysis）即主成分分析，是一种常用的数据分析方法。它的主要目的是通过线性变换将原始数据转换为一组新的变量，这些新变量被称为主成分。主成分是原始变量的线性组合，并且它们是按照方差大

以下是10个关于如何梳理RPA自动化场景的创新点子：一、财务领域发票自动核验与归档：创新点：利用OCR技术识别发票信息后，不仅进行常规的真伪核验，还可以根据发票类型、金额大小等自动分类归档到不同的电子文件夹中，并生成可视化的发票统计报表，方便财务人员随时查看各类发票的

AI大模型相当于“超级大脑”，正成为人工智能“新高地”。AI大模型有望实现人工智能从感知到认知的跃迁，重新定义人工智能产业模式和产业标准，给部分产业带来重大变革。前排提示，文末有大模型AGI-CSDN独家资料包哦！盈利能力通常表现为一定时期内企业收益数额的多少及其水平的高