首页 > 其他分享 >基因图谱(Genomic Mapping)分析与应用

基因图谱(Genomic Mapping)分析与应用

时间:2024-09-03 19:52:59浏览次数:12  
标签:遗传 基因图谱 基因 Mapping 距离 构建 图谱 Genomic

基因图谱(Genomic Mapping)是基因组学研究中一项至关重要的技术,它为科学家提供了关于基因的位置和距离的详细信息。通过基因图谱的构建,研究人员可以揭示基因与性状之间的关系,探索疾病的遗传机制,并推动个性化医学的发展。本文将详细分析基因图谱的类型、构建方法、应用场景以及它在现代生物医学中的重要性。


1. 基因图谱概述

基因图谱是一种描述基因在染色体上的相对位置和距离的工具。它可以帮助科学家识别基因与性状或疾病之间的关联,并为进一步的基因功能研究提供基础。基因图谱主要分为两类:遗传图谱和物理图谱。

1.1 遗传图谱

遗传图谱基于基因之间的遗传连锁关系构建。通过分析基因之间的重组频率,可以估算它们在染色体上的相对距离。遗传图谱通常以“厘摩”(cM)为单位,表示基因之间的重组概率。

1.2 物理图谱

物理图谱直接基于DNA分子上核苷酸序列的实际距离构建。它以“碱基对”(bp)为单位,表示基因或标记之间的物理距离。物理图谱通常比遗传图谱更精确,能够提供关于基因组的详细结构信息。


2. 基因图谱的构建方法

基因图谱的构建依赖于多种实验技术和生物信息学工具。以下是构建基因图谱的几种主要方法:

2.1 遗传连锁分析

遗传连锁分析是一种经典的方法,用于构建遗传图谱。通过分析多个个体(如家族或群体)的遗传标记(如微卫星或单核苷酸多态性(SNP))的共分离情况,科学家可以确定这些标记之间的遗传距离。

示例代码࿱

标签:遗传,基因图谱,基因,Mapping,距离,构建,图谱,Genomic
From: https://blog.csdn.net/weixin_65409651/article/details/141870228

相关文章

  • Allen基因图谱:python Aabgen的安装
    1.abagen使用教程的官方链接:abagen:AtoolboxfortheAllenBrainAtlasgeneticsdata—abagen0.1.3-doc+0.g2aeab5b.dirtydocumentation2.在安装abagen之前先提前安装好一下的包window系统操作步骤:(1)安装好python(假如安装在E盘,E:\python\)(2)win+R打开任务管理器,输入......
  • Lecture 05 Real-time Environment Mapping
    Lecture05Real-timeEnvironmentMappingRecap:EnvironmentLighting一张表示了来自四面八方的无穷远处光(distancelighting)的图片Sphericalmapvs.cubemapShadingfromenvironmentlighing非正式地命名为Image-BasedLighting(IBL)\[L_o(p,\omega_o)=\int_{\Om......
  • Lecture 06 Real-time Environment Mapping (Precomputed Radiance Transfer)
    Lecture06Real-timeEnvironmentMapping(PrecomputedRadianceTransfer)Shadowfromenvironmentlighting通常情况下要实时渲染非常困难在不同观察方向上Asamany-lightproblem:CostofShadowMapislinearlyto#lightAsasamplingproblem:Visibility项V会......
  • Autosar(Davinci) --- ADT和IDT如何Mapping
    前言    这里我们讲一下ADT如何与IDT进行Mapping一、ADT为什么要与IDT进行Mapping二、ADT和IDT如何Mapping鼠标右键【typeMappingSets】,选择【NewDatatypeMappingSet...】打开之后,我们起一个名字【DemoTypeMapping】然后选择【DataTypeMaps】来将ADT......
  • BMC Genomics | 火龙果的转录组和代谢组分析揭示了果皮和果肉颜色形成的机制
    阐明火龙果果肉和果皮变色的候选基因和关键代谢产物,是培育具有优良新口味和高营养价值的火龙果的必要条件。在这里,使用转录组(RNA-Seq)和代谢组分析(UPLC-MS/MS)鉴定了属于两种不同量天尺属物种的三种火龙果的结构和调控基因以及与果皮和果肉颜色相关的关键代谢物。作者综合的转录......
  • Elasticsearch Mapping类型修改
    背景通常数据库进行分库分表后,目前比较常规的作法,是通过将数据异构到Elasticsearch来提供分页列表查询服务;在创建Elasticsearch索引时,基本都是会参考目前的业务需求、关系数据库中的类型以及对数据的相关规划来定义相关字段mapping的类型.在Elasticsearch的mapping中的列(或则......
  • Genomics | 转录组和代谢组分析揭示了铁皮石斛中黄酮类化合物的积累
    铁皮石斛是一种在中国有着悠久使用历史的中草药。黄酮是铁皮石斛重要的次生代谢产物,但其在铁皮石斛中的分子调控机制尚不清楚。在这项研究中,作者收集了一年到四年生的铁皮石斛茎,用于rna测序和质谱数据收集。结果表明,代谢组学分析检测到124种不同的类黄酮代谢物,其中黄酮醇代谢物在......
  • BMC Genomics | 综合代谢组学和转录组学分析揭示了菊花黄酮和咖啡酰奎宁酸的生物合成
    杭白菊是一种流行的药用和食用植物,主要通过黄酮类和咖啡酰奎宁酸(CQAs)的存在发挥其生物活性。然而,菊花头状花序中黄酮和CQA生物合成的调控机制尚不清楚。本研究采用高效液相色谱法测定了菊花头状花序发育过程中黄酮类化合物和CQAs的含量,发现在S1和S2阶段含量较高,在S3~S5阶段含......
  • 出现 No mapping for DELETE/GET等
    出现NomappingforDELETE/GET等错误一:请求url不对修改前如下图可知后端请求url为http://localhost:8080/user/addressBook运行后控制台出现发现后端请求url比前端请求url少了/改正:在@DeleteMapping后面加上/ @DeleteMapping("/")@ApiOperation("根据id......
  • iMAP: Implicit Mapping and Positioning in Real-Time实时隐式建图和定位(论文阅读记
    一、论文阅读知识储备    这篇论文是将NeRF结合进SLAM的探索性的尝试,在我的这篇文章中并没有太多涉及NeRF的详细解说,但看懂这篇论文有必须懂NeRF,所以推荐读者去看:【较真系列】讲人话-NeRF全解(原理+代码+公式)_哔哩哔哩_bilibili       论文原文地址:[2103.12352......