第五章主要讲的是自组织系统方法，首先还是其，历史发展，主要讲述了自，组织系统理论的提出并不是偶然的，他是19世纪中期以来热力学同生物学矛盾发展的结果，而随着其矛盾的解决，就产生了自组织系统理论，而第二节主要讲的是耗散结构理论简介，而耗散结构就是能量耗散过程，它还具有动态性，有序性，宏观性等特征，由此得出，耗散结构是一种宏观有序的动态结构，而耗散结构的形成有三个基本条件，一是系统处于远离平衡态，二是系统的开放性，三是系统内不同要素之间存在非线性机制。
第三小节主要讲的是协同学，协同学是由原西德斯图加特大学理论物理学教授，在1973年提出来的一种学说，而他的研究对象同耗散结构理论的研究对象一样，也是自组织现象，不同的是，协同学主要是从系统内部各要素相互作用的方式上去研究自治组织机制的，比耗散结构的理论更丰富一些，他的研究对象主要为组织，他组织和自组织。协同学的应用，目前还是初步的，主要是在物理学，流体力学等。
第四节主要讲的是突变论，突变论是一种数学理论，无论是在自然现象还是社会现象中，突变论都是普遍存在的，而突变论的基本内容包括稳定性和非稳定性。突变过程的本质及特征以及突变形式具有多样性，而突变论的应用主要是在物理学方面。