数字基因表达谱(Digital Gene Expression Profiling,DGE) 利用新一代高通量测序技术和高性能计算分析技术,能够全面、经济、快速地检测某一物种特定组织在特定状态下的基因表达情况。 数字基因表达谱已被广泛应用于基础科学研究、医学研究和药物研发等领域。
楼主应该是想说RNA-seq和DGE的区别吧? 虽然都是用二代测序的技术来对RNA进行测序,但实验目的和前期样本处理是不同的。 通常的RNA-seq,是指对对非rRNA的RNA样本进行二代测序,可以获得transcript的表达量。如果测序量足够的话,还可以研究transcript的结构,研究可变剪切,也可以发现新的transcript。 而DGE的话,只是用于获得transcript的表达量。前期处理使用酶切的方法,在每个transcript上切下一段tag序列,然后进行二代测序。这样就可以用这些tag的量来代表tanscript的表达量了。这样的好处在于,相对于RNA-seq,只需要较小的通量,就能获得较稳定的表达量数据。 |