首页 > 其他分享 >数字基因表达谱(Digital Gene Expression Profiling,DGE)

数字基因表达谱(Digital Gene Expression Profiling,DGE)

时间:2023-08-16 10:13:46浏览次数:40  
标签:Profiling 表达 DGE 基因 RNA 测序 Digital transcript

数字基因表达谱(Digital Gene Expression Profiling,DGE)   利用新一代高通量测序技术和高性能计算分析技术,能够全面、经济、快速地检测某一物种特定组织在特定状态下的基因表达情况。   数字基因表达谱已被广泛应用于基础科学研究、医学研究和药物研发等领域。  

楼主应该是想说RNA-seq和DGE的区别吧?   虽然都是用二代测序的技术来对RNA进行测序,但实验目的和前期样本处理是不同的。   通常的RNA-seq,是指对对非rRNA的RNA样本进行二代测序,可以获得transcript的表达量。如果测序量足够的话,还可以研究transcript的结构,研究可变剪切,也可以发现新的transcript。   而DGE的话,只是用于获得transcript的表达量。前期处理使用酶切的方法,在每个transcript上切下一段tag序列,然后进行二代测序。这样就可以用这些tag的量来代表tanscript的表达量了。这样的好处在于,相对于RNA-seq,只需要较小的通量,就能获得较稳定的表达量数据。

标签:Profiling,表达,DGE,基因,RNA,测序,Digital,transcript
From: https://www.cnblogs.com/wangprince2017/p/17633232.html

相关文章

  • odoo15自定义小部件widget
    添加自定义widget的步骤比较简单,以下三步就可以了:1、JS实现widget的功能/*这个文件(文件名为my_basic_fields.js)要在__manifest__.py中设置,如下:'assets':{'web.assets_backend':['testaddons/static/src/js/my_basic_fields.js',],},*/odoo.define(�......
  • 知识图谱(Knowledge Graph)- Neo4j 5.10.0 Docker 安装
    知识图谱(KnowledgeGraph)-Neo4j5.10.0Docker安装知识图谱(KnowledgeGraph)-Neo4j5.10.0CentOS安装https://neo4j.com/docs/operations-manual/5/docker/introduction/拉镜像[root@localhost~]#cat/etc/docker/daemon.json{"registry-mirrors":["http......
  • EdgeBERT:极限压缩,比ALBERT再轻13倍!树莓派上跑BERT的日子要来了?
    文|Sheryc_王苏这个世界上有两种极具难度的工程:第一种是把很平常的东西做到最大,例如把语言模型扩大成能够写诗写文写代码的GPT-3;而另一种恰恰相反,是把很平常的东西做到最小。对于NLPer来说,这种“小工程”最迫在眉睫的施展对象非BERT莫属。从18年那个109M参数的BERT,到52M......
  • docker网络 bridge 与overlay 模式
    转载请注明出处:1.bridge网络模式工作原理: 在Bridge模式中,Docker通过创建一个虚拟网络桥接器(bridge)将容器连接到主机上的物理网络接口。每个容器都会被分配一个IP地址,使得它们可以相互通信,并且可以与主机进行通信。Docker的Bridge网络模式是默认的网络配置选项,它提供了容......
  • Qt 之 QWidget QLabel
    @TOC前言一、Qt工程介绍QtCreator以工程项目的方式对源码进行管理一个QtCreator工程包含不同类型的文件。a-.pro.user用户配置描述文件-.h头文件.cpp源文件.ui界面描述文件资源文件(图片,音频,等)pro项目描述文件的基本组成#一注释起始符:以“#”开始,到这一行结束。快捷键:C......
  • 知识图谱(Knowledge Graph)- Neo4j 5.10.0 Docker 安装
    拉镜像[root@localhost~]#cat/etc/docker/daemon.json{"registry-mirrors":["https://XXX.mirror.aliyuncs.com"]#阿里镜像源}#拉取镜像[root@localhost~]#dockerpullneo4j:5.10.0运行#创建目录[root@localhost~]#mkdir-p/opt/neo4j#--envNEO......
  • 知识图谱(Knowledge Graph)根本概念
    目录知识图谱定义基础概念:知识图谱构建的关键技术知识图谱的构建实体命名识别知识抽取实体统一指代消解知识图谱的存储RDF和图数据库的主要特点区别知识图谱能干什么反欺诈不一致性验证客户失联管理知识推理常见图数据库2012年5月17日,Google正式提出了知识图谱(KnowledgeGraph)的概......
  • 知识图谱(Knowledge Graph)- Neo4j 5.10.0 CentOS 安装
    系统需求版本JDKCPU内存硬盘Neo4j5.x17Intelx86-x64Corei3minimum,Corei7recommended.AMDx86-x64,MacARM.最低2GB,推荐16GB+10G+Neo4j5.x11Neo4j5.x8JDK17下载:https://www.oracle.com/java/technologies/downloads/#java17基于jar的......
  • 知识图谱(Knowledge Graph)- Neo4j 5.10.0 CentOS 安装
    系统需求版本JDKCPU内存硬盘Neo4j5.x17Intelx86-x64Corei3minimum,Corei7recommended.AMDx86-x64,MacARM.最低2GB,推荐16GB+10G+Neo4j5.x11Neo4j5.x8JDK17下载:https://www.oracle.com/java/technologies/do......
  • 知识图谱(Knowledge Graph)根本概念
    目录知识图谱定义基础概念:知识图谱构建的关键技术知识图谱的构建实体命名识别知识抽取实体统一指代消解知识图谱的存储RDF和图数据库的主要特点区别知识图谱能干什么反欺诈不一致性验证客户失联管理知识推理常见图数据库2012年5月17日,Google正式提出了知识图谱(KnowledgeGraph)的......