参考电荷泵倍压输出电路，把参考电压由Vcc改为GND，即可得到电荷泵负压输出电路。
当Vin为高电平Vh时，T1测试点的电压VT1是GND（为了简便起见，忽略二极管的压降） Vin为电容C1充电，使C1左右两端的左右两端的电压差Vh。充电电流通过D1到达GND，同时也会使C2储存一些电荷。当Vin为低电平时，由于电容两端电压不会突变，所以对于电容C1来说，左右两端的电压差仍是Vh，左侧变为低电平以后，右侧VT1就变为了-Vh。
此时，输出电流的方向是从Vo到T1，忽略D2上的压降，Vo的值将会介于0V与-Vh之间，实现了负压输出，并且受Vin频率与有效值影响。
以上分析中忽略了二极管的压降，实际应用中为了减小二极管的压降的影响，选用了压降较低的肖特基二极管。可以看出，不论是倍压还是负压，输出电压都依赖于输出电容储存的能量，所以电荷泵电路一般不用于大电流电路。一般用于DC/DC转换器辅助电压输出。
下图是电荷泵负压输出电路中，C1电压与输出电压的波形。
