首页 > 系统相关 >linux 中 prefetch命令批量下载sra测序数据

linux 中 prefetch命令批量下载sra测序数据

时间:2023-10-06 10:24:05浏览次数:37  
标签:sra 测序 命令 prefetch linux 下载

 

001、 prefetch的安装

 

 

002、准备下载sra号的列表

 

 

003、设置下载存储目录

 

 

004、下载命令

 

 

参考:

https://codeleading.com/article/83981102254/

标签:sra,测序,命令,prefetch,linux,下载
From: https://www.cnblogs.com/liujiaxin2018/p/17744287.html

相关文章

  • 重测序数据碱基质量评估
     001、测序数据为fastq格式fastq格式数据没四行为一个单位,其中第二行是碱基,第四行为对应的碱基质量值:如下:(base)[b20223040323@admin1test01]$ls##测试fastq格式数据test.fastq(base)[b20223040323@admin1test01]$head-n4test.fastq|cat-n##第......
  • 【原】S27KL0642DPBHV023、S27KL0642DPBHV020、S27KL0642DPBHA020、S27KL0642DPBHI020
    一、概述S27KL0642DPBHV023、S27KL0642DPBHV020、S27KL0642DPBHA020、S27KL0642DPBHI020伪静态随机存储器(PSRAM)HyperRAM™是具备HyperBus™接口的高速CMOS自刷新DRAM。其存储阵列的内部结构类似于DRAM,而外在行为则与SRAM相似。(明佳达供求库存)DRAM阵列需要定期刷新以保持数......
  • 为什么要双末端测序
     001、测序时,DNA片段被打断,但是打断的片段仍然很长。二代测序的读长短,为了更多的获取同一个DNA片段上的信息,因此出现了从两端测序,尽可能多的捕获这个DNA片段的信息。  。 ......
  • 2. MGI Pacbio ONT 测序原理
    本人的生物只有高中且4年没碰的水平,如果涉及生物的笔记没写对请见谅.1.总览2.MGI测序原理  MGI属于华大智造的专利技术,同样是用于测序.在解决下面三个问题上使用了不同的方法.(1)如何区分不同碱基:这里可以看作一致,是相似的技术.(2)荧光微弱:滚环扩增,形成DNA纳米......
  • 1. illumina测序原理
    本人的生物水平只有高中且4年没碰的水平,如果涉及生物的笔记没写对请见谅.1.一个典型的生物信息分析  我们在做生物信息分析时,常常是有一个目的,比如分析为什么某朵花是红色的.假设我们在做转录组数据分析,流程一般如下图所示:  得到数据后,我们会进行标准分析,得到一些......
  • [THUPC2022 决赛] rsraogps
    [THUPC2022决赛]rsraogps题目描述给序列\(a_1,\dots,a_n\),\(b_1,\dots,b_n\),\(c_1,\dots,c_n\),定义区间\([l,r]\)的价值为\(a_l,\dots,a_r\)按位与,\(b_l,\dots,b_r\)按位或,\(c_l,\dots,c_r\)的最大公因数,这三者的乘积;\(m\)次查询,每次查询给出区间\([l,r]\),查询满足......
  • 【北汇信息 | MISRA C 通识及实践】
    上周三我们在直播课中讲解了MISRAC通识及实践(请看VCR),今天我们来探讨一下MISRAC++:2023~ http://mp.toutiao.com/feoffline/mp-article-preview/video?pgc_id=7272194497587446308 MISRAC++:2023®是广受期待的MISRAC++®标准的下一个版本,将于今年晚些时候发布。新版本......
  • 测序深度
        ......
  • 第一二代测序仪
    一代测序:ABI 二代测序:Roche454 IlluminaiSeq100最大读长:2×150bp应用:SmallWhole-GenomeSequencing(microbe,virus),TargetedGeneExpressionProfiling等等最大数据量:1.2Gb时长:9.5–19hrs Hiseq2500最大读长:2×250bp最大数据量:9Gb-1Tb H......
  • RAM、ROM、SRAM、DRAM、FLASH等常见存储器学习记录
    存储器按照掉电失去数据分为两类:易失性和非易失性。RAM:随机存取存储器(英语:RandomAccessMemory,缩写:RAM),也叫主存,是与CPU直接交换数据的内部存储器。它可以随时读写(刷新时除外),而且速度很快,通常作为操作系统或其他正在运行中的程序的临时数据存储介质。RAM工作时可以随时从任何一个......