在服务器中提交lammps计算时，用多少个核计算，才会使得自己和别人的运算会更快？是不是提交核数越多越快？如何提高运算速度（pppm算法）？

标签：10 超负荷运算 lammps 提交 40 计算核数

（摘自以下内容）

下边我们做几组测试，并对比计算速度：（采用同一个模型，所含原子数：19144（算挺得多了））

4个核——未超负荷运行100%情况下——1天能跑0.488 ns=488 ps

26个核——超负荷10个核运行——1天能跑0.023 ns= 23 ps

56个核——超负荷40个核运行——1天能跑0.018 ns= 18 ps

126个核——超负荷100个核运行——1天能跑0.009 ns= 9 ps

由此可见，未超负荷运行情况下，计算速度是超负荷10个核情况的21倍（488/23），是超负荷100个核情况的54.2倍（488/9）。

一般情况下，大家可能会超负荷10-40个核左右，但是这时候已经使得自己核大家的计算都已经降低了20倍以上，本来1天算完，现在要20天以上。

因此，提交计算前要top看剩余核数，千万不要超负荷运行，自己提交计算，要预留空间给其他小伙伴。一起快才是真的快，一起慢也是真的蜗牛爬。

建议：
对于node01和node02，总核数只有40个核，课题组如果有8个人，建议每人用5-8个核在该服务器，未超负荷情况下（不一定要用满）运行速度会很快的。远比每人10-20个核导致超负荷要快十几倍以上。

对于node03，总核数为100左右，若4个人在算，每人用20-25个核，这样会比超负荷的要快很多倍。

所以，不是用核越多越快，有时，用核少反而越快，而且快的不是一点点，是十几倍的快。

1..在提交计算之前，打开putty，输入命令”top“，即可查看当前服务器的运算情况。

先看CPU使用情况，可以计算还剩余多少空间可以使用。如，当前显示cpu-60.7%，若总核数为40，经过计算还剩余16个核可用。

同时，还可以看当前的user是谁，以及大概推测各自所用核数为多少。

2.自己提交计算，应该用多少个核来计算比较适合呢？——自己提交计算，要预留一定的计算空间给其他伙伴，切不可全部占满。

通过top可以推测还剩16个核的空间可用，建议结合课题组的人数来使用。比如说，课题组有4个人要计算，服务器node01的总核数为40，人均10个核。现在还剩16个核的空间，但是仅有两个人在计算，那么要考虑到课题组另一个同门后边可能也提交计算。
因此，建议自己用8个核计算就比较适合，预留8个核给另一个伙伴。

切不可一个人把16个核都用完，这样其他人就没有空间用了。

3.提问：如果服务器总核数仅为40个核，当前还剩下16个核的空间（已用24个核），如果我提交超过16个核（如26，126，1000个核），计算会更快吗？——答案：会从飞机飞行速度变为蜗牛爬行，不仅仅是自己的速度，还有小伙伴的速度也跟着变化。

**注意：在CPU运行占比低于100%情况下，提交核数越多计算越快。而当高于100%，提交核数越多所有计算都越慢。就像百米冲刺赛道，假设有40个赛道，如果有40个运动员以内跑，速度都是最快的；如果是50个运动员，速度就会降低（而且是大大降低）；如果是1000个运动员，那就会变成蜗牛爬行。

下边我们做几组测试，并对比计算速度：（采用同一个模型，所含原子数：19144（算挺得多了））