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编程问答
pathWay
2023-11-06
KEGG PATHWAY
KEGGPATHWAYDatabaseKEGGPATHWAY数据库是一个手工画的代谢通路的集合,包含以下几方面的分子间相互作用和反应网络:1.新陈代谢2.遗传信息加工3.环境信息加工4.细胞过程5.生物体系统6.人类疾病7.药物开发PATHWAY的五种类型仅仅第一种参考通路(referencepathway)图是手动画出来的
2023-09-13
使用R语言查询某物种所有通路及通路内的基因
使用R语言查询某物种所有通路及通路内的基因,这里使用Y书的clusterProfiler包。这里以人类为例查询所有通路及通路内的基因:library(R.utils)R.utils::setOption("clusterProfiler.download.method","auto")hsa_kegg<-clusterProfiler::download_KEGG("hsa") 这里使用的
2023-04-20
已确定迷宫求解所有路线(递归)
importjava.lang.reflect.Array;importjava.util.ArrayList;importjava.util.Arrays;importjava.util.List;publicclassMazePath{ publicstaticvoidmain(String[]args){ int[][]maze={{0,1,0,0,0,0}, {0,1,1,0,0,0}, {0,0,
2022-10-04
KEGG图
1.生信分析中KEGG图的作用是什么在生物信息学分析过程中,KEGG通路富集分析常常应用于差异表达基因的功能注释,了解差异表达基因的相关功能与作用通路。2. KEGG气泡图的解
2022-08-18
转录相关signalling pathway活性打分 | 常见打分系统
历史分析:pathway是一个不得不研究的主体,比如我们的paper就给很多GOpathway的基因打分了,很简单就是一个求均值。关于complex的活性打分,就得使用几何平均,因为缺失任何