1.安装SRATools通过SRAToolkit可以方便的从NCBI下载SRA数据，但是速度较慢，Aspera虽然快，但是难点在于找NCBI的源文件地址，而且SRAToolkit好像可以调用Aspera（虽然还没找到方法）具体操作可以参考这个帖子，下载安装很容易，主要是配置环境要配置好，不然用不了https://blog.csdn.net/m0_6

如何从NCBI上下载数据——使用ASCP下载数据1.下载ASCPhttps://cloud.tencent.com/developer/article/23681502.获取NCBI上的ACCESSIONIDs①.在NCBI-SRA上检索自己想要数据。②.拉到最底下，选择sendto,再选择Runselect，最后选择GO。③.进入SRARunselect页面，选择Accessi

作者按国内对于单细胞测序相关的中文教程确实不够全面，当然NCBI官网给的上传教程也比较详细了，所以变成了会者不难。本教程你现在可能用不上，但是你如果做单细胞测序，那么未来你一定会用上，建议收藏。在这里，我们将演示如何将测序文件完整上传到NCBI上。本教程首发于单细胞最好的中文

 001、ncbi官网   002、SRALite和SRANormalized的区别：https://www.omicsclass.com/article/2178如下图：sra.lite的磁盘占用小于标准sra的，以SRR3156163为例。    003、sra.lite和sra标准数据下载 004、点击dataaccess  005、如下图：1未标准

 001、进入ncbi官网 002、点击blast 0 003、点击downloadblast 004、点击如下链接： 005、点击下载linux64位：下载链接：https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/  006、下载完成后，上传至linux系统 

1.服务器端Anaconda安装&配置1.1下载Anaconda安装包wgethttps://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-2022.05-Linux-x86_64.sh1.2安装bashAnaconda3-2022.05

Kraken2是用于物种分类的分析软件。安装mkdir-p~/Softwarecd~/Softwaregitclonehttps://github.com/DerrickWood/kraken2cdkraken2shinstall_kraken2.sh~/

exportPATH=/home/ubuntu/software:$PATH#PATH=PWD:$PATHcondacreat-cbioconda-nname_envsfastqc#conda子环境安装fastqccondaactivatename_envs#切换到子环境

 今天测试了fastq-dump直接根据SRA号无法下载。只有下面一种方法测试成功。001、   002、   003、   004、   005、[root@PC1test