近期，RajeevK.Varshney团队在Naturegenetics发表综述文章：Unlockingplantgeneticswithtelomere-to-telomeregenomeassemblies。摘要连续基因组序列组装将帮助我们实现作物转化基因组学的全面潜力。最近在测序技术方面的进步，尤其是长读长测序策略，使得构建无间隙的端粒到

论文提出了T2T-ViT模型，引入tokens-to-token（T2T）模块有效地融合图像的结构信息，同时借鉴CNN结果设计了deep-narrow的ViT主干网络，增强特征的丰富性。在ImageNet上从零训练时，T2T-ViT取得了优于ResNets的性能MobileNets性能相当来源：晓飞的算法工程笔记公众号论文:Tokens-to-Token

目录影响组装的基因组特性长读长和长范围（long-range）测序技术近T2T基因组组装核心组装算法评估序列组装李恒的观点生信领域大神李恒今年发在预印本上的一篇综述：Genomeassemblyinthetelomere-to-telomereera，小编总结下要点。影响组装的基因组特性决定基因组组装难易程度的主

多基因组比对（multiplegenomealignment,MGA）首先要定义多序列比对（multiplesequencealignment,MSA）。MSA是将同源关系分配给3个或更多序列的方法（对于2个序列，使用“成对”而非“多个”），其中一组核苷酸是同源的，如果它们来自同一个共同祖先。这些比对通常由二维数组表示，其中

目录主要结果主要方法数据策略工具问题来了2023年9月29日，哈尔滨工业大学王亚东团队联合中国农科院韩天富团队在bioRxiv发表了题为“Atelomere-to-telomeregenomeassemblyofZhonghuang13,awidely-grownsoybeanvarietyfromtheoriginalcenterofGlycinemax”的研究