- 2024-10-06GB | Seqrutinator:一个用于鉴定和去除非功能性序列的基因家族分析流程
分享一篇近期发表在GenomeBiology上 的一个基因家族分析软件:Seqrutinator。该软件用于识别和去除基因家族数据集中的无功能基因,包括假基因、测序错误、基因结构错误、比对错误等,从而避免基因家族鉴定中的假阳性结果,进一步确保基因家族注释的准确性,以便于后续系统发育分析和功
- 2024-08-25最容易理解的Swin transformer模型(通俗易懂版)
SwinTransformer:HierarchicalVisionTransformerusingShiftedWindows1.论文信息原文地址:https://arxiv.org/abs/2103.14030官网地址:https://github.com/microsoft/Swin-Transformer2.网络框架2.1swimVSvit 从图中可以得到,Swin相较于ViT的区别在于:Swim模型
- 2024-08-18AlphaFold2:Highly accurate protein structure prediction with AlphaFold(蛋白质结构预测)
ICLR-15July2021MainMethod:MSA+EvoformerPytorchcode:https://github.com/lucidrains/alphafold2literatures:https://www.nature.com/articles/s41586-021-03819-2JohnJumper,RichardEvans,AlexanderPritzel,TimGreen,MichaelFigurnov,OlafRonneberger
- 2024-07-28VIPdb,有害突变预测以及植物育种
VIPdb简介VIPdb(VariantImpactPredictordatabase)是一个专门收集和总结变异影响预测工具(VariantImpactPredictors,简称VIPs,也称为VariantEffectPredictors,简称VEPs)的数据库。这些工具用于帮助科研人员和医生从基因组中检测到的数百万遗传变异中识别出可能致病的变异。VIPdb
- 2024-06-03Swin-Transformer白话详解
Swin-Transformer得益于其窗口注意力和偏移窗口注意力机制,平衡了感受野和计算效率,逐渐替代Vit成为了很多视觉网络的Backbone。下面将尽可能的清晰地解释其各个模块!参考文献nsformer网络结构详解文章目录1.SwinTransformer的创新点2.PatchPartition和LinearEmbed
- 2024-01-15每日总结2024/1/15(爬虫学习)
原文链接python爬虫-Python3.x+Fiddler抓取APP数据-学习分享-SegmentFault思否我爬取的为浏览器数据 可以看到在这里我们成功爬取到了浏览器数据,但是在实现python中爬取数据遇到了很多版本以及配置缺少的问题,同时我的版本中http为2,不知道有没有其他影响,代码目前
- 2023-12-29Swin Transformer
SwinTransformer目录SwinTransformer简介VIT的缺陷核心创新总体结构和运作网络细节PatchpartitionLinearEmbeddingPatchMergingSwinBlock模块W-MSASW-MSAAttentionMask计算成本分析主要优势SwinTransformerV2参考简介论文地址:https://arxiv.org/pdf/2103.14030.pdf
- 2023-11-11T2T组装时代的多基因组比对MGA
多基因组比对(multiplegenomealignment,MGA)首先要定义多序列比对(multiplesequencealignment,MSA)。MSA是将同源关系分配给3个或更多序列的方法(对于2个序列,使用“成对”而非“多个”),其中一组核苷酸是同源的,如果它们来自同一个共同祖先。这些比对通常由二维数组表示,其中
- 2023-11-09有关新一代J2ME移动终端标准 MSA
新的MSA通用标准(JSR-248)旨在通过两种方式改善Java领域的标准分化的局面。首先,MSA清晰地定义了一套在下一代手机中必须支持的强制性的Java规范请求(JSR)。其次,MSA通过明确强制性JSR与可选JSR相互作用的条件,使得JSR实现过程更顺畅,无需过多的解释。 MSA支持的新强制性应用程
- 2023-09-27ICCV 2023 清华ETH提出 Retinexformer 刷新十三大暗光增强榜单
前言 本文介绍了ICCV2023上的新工作《Retinexformer:One-stageRetinex-basedTransformerforLow-lightImageEnhancement》本文转载自我爱计算机视觉仅用于学术分享,若侵权请联系删除欢迎关注公众号CV技术指南,专注于计算机视觉的技术总结、最新技术跟踪、经典论文解读