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  • 2024-03-27高斯混合模型(GMM)和EM算法 —— python实现
    一、EM算法EM算法是一种迭代算法,用于含有隐含变量的概率模型参数的极大似然估计。设Y为观测随机变量的数据,Z为隐藏的随机变量数据,Y和Z一起称为完全数据。观测数据的似然函数为:模型参数θ的极大似然估计为:这个问题只有通过迭代求解,下面给出EM算法的迭代求解过程:step1、选择
  • 2024-03-06SARS-CoV-2变体的筛选
    1.DesignofmolecularswitchandNOTlogicgate分子开关和非逻辑门的设计作者设计了两个基于DNA的链位移反应,以模拟两个半导体器件(图1a和b)。作为开关信号的A1和A0分别定义为输入1和输入0。A1是特异性的SARS-CoV-2序列。A0是特定的SARS-CoV-2β变体(B.1.351)序列。每个MS
  • 2024-01-26概率论
    概率(1)对立事件和互斥事件互斥事件是指两个事件不能同时发生,对立事件是指事件A,B仅有一个发生。A交B等于空------》互斥A交B等于空且A并B等于全集-------》对立(2)P(A并B)=P(A)+P(B)----》A与B
  • 2023-11-25PCA (principal component analysis)算法
    一、PCA算法PCA(principalcomponentanalysis)是一种应用广泛的降维算法,其基本思想是想通过找到一个低维的“最具有代表性”的方向,并将原数据映射到这个低维空间中去,从而实现数据的降维。1.算法原理  我们先从二维数据简单说明,假设我们有n个二维数据组成的数据集\(D_{n\ti
  • 2023-11-02「GLR-R3」惊蛰
    \(\text{「GLR-R3」}\)惊蛰\(\text{Link}\)\(\text{Describe}\)给定非负整数序列\(\{a_n\}\),定义函数\(f(x,y)\)为\[f(x,y)=\begin{cases}x-y,&x\gey\\C,&x<y\end{cases},\]其中\(C\)是给定常数。请构造一个不增非负整数序列\(\{b_n\}\),最小化\[\sum_{i=1
  • 2023-09-21【小睿的ML之路】Seaborn-单变量分析绘制
    importseabornassnsimportnumpyasnpimportpandasaspdimportmatplotlibasmplimportmatplotlib.pyplotasplt%matplotlibinlinex=np.random.normal(size=100)print(x)[0.22404072-1.9394295-0.32313598-0.25468579-0.719277940.66163234
  • 2023-06-11对“美国出现的SARS-CoV-2的分子进化特征”一文的简要介绍
    对“美国出现的SARS-CoV-2的分子进化特征”一文的简要介绍冠状病毒(CoV)是一种RNA病毒,可感染人类和其他哺乳动物,可引起多种疾病,例如呼吸道、肠道、肝脏和神经系统疾病。感染人类的冠状病毒有七种类型,包括SARS-CoV、MERS-CoV、HCoV-229E、HCoV-HKU1、HCoV-NL63、HCoV-OC43和SARS-CoV
  • 2023-06-11比较新冠病毒与蝙蝠和穿山甲冠状病毒基因组/蛋白序列比对,更好地了解COVID-19病原体SARS-CoV-2的起源与进化
    比较新冠病毒与蝙蝠和穿山甲冠状病毒基因组/蛋白序列比对,更好地了解COVID-19病原体SARS-CoV-2的起源与进化作者:王怡然 石育 赵月馨 沈讯摘要:在新冠病毒COVID-19大流行的时代背景下,病毒的遗传信息对于其分类和可追溯性及其致病性至关重要。在全基因组水平上,SARS-CoV-2的序
  • 2023-06-09股票组合投资的风险平价策略
    导入每只股票的净值数据:importpandasaspdimportnumpyasnpfromscipy.optimizeimportminimizeStockPrices=pd.DataFrame()StockPrices=pd.read_excel('zuhe.xlsx',index_col=[0])StockPrices.index.name='日期'StockPrices.head()提取每只股票的名称:
  • 2023-05-31POJ1151(线段树+扫描线求矩形面积并)
    题目:http://poj.org/problem?id=1151 #include<iostream>#include<string.h>#include<algorithm>#include<stdio.h>usingnamespacestd;constintN=10005;structnode{intl,r;intcov;doublelen;};structline{
  • 2023-04-20Eigen Faces
    处理图像一张\((H,W)\)大小的图像可以按像素点展开为\((1,HW)\)大小数组.我们将训练集中所有图像展开到一个\((N,HW)\)大小的数组中;然后求一个\((1,HW)\)大小的平均脸参考代码:#Supposeimgsisa(N,W,H)nparrayimg2D=imgs.reshape(imgs.shape[0],-1)
  • 2023-04-02序列比对
    在ncbi上搜索SARS-CoV-2、SARS-CoV(2003)及RaTG13病毒株的S(Spike)蛋白质序列,在clustalOmega进行序列比对,得到的结果发现三种蛋白序列一致性很高,序列仅有少部分有差异,其中SARS-CoV(2003)及RaTG13病毒株的S(Spike)蛋白质序列更接近   
  • 2023-03-28SARS-CoV-2、SARS-CoV (2003)及RaTG13病毒株的S(Spike)蛋白氨基酸序列差异
    在NCBI网站上得到SARS-CoV(2003)、SARS-CoV-2及RaTG13的S蛋白氨基酸序列在clustalOmega进行比对,下面是结果 
  • 2023-02-25概率论公式自测
    概率论与数理统计公式自测1.概率论基本概念基本运算:\[P(A-B)=\qquad\qquad\qquad\]\[P(A\cupB)=\qquad\qquad\qquad\]容斥原理二维、三维情况:\[P(A\cu
  • 2022-12-15概率论与数理统计
    \[方差:D(x)=E\{[x-E(x)]^2\}=E(x^2)-E(x)^2\LongrightarrowE(x^2)=D(x)-E(x)^2\\协方差:Cov(x,y)=E(xy)-E(x)E(y)\\相关系数:\rho_{xy}=\frac{Cov(x,y)}{\sqrt[
  • 2022-12-15边权树链剖分
    边权树链剖分一般的树链剖分都是维护的点权,而如果要维护边权怎么办呢?思路我们可以把边权转换为点权。一个点有很多个儿子,但只有一个父亲。如果一个节点的点权记录到其儿
  • 2022-11-21ABC278D 题解
    前言题目传送门!更好的阅读体验?难度加强版:P1253。思路很容易想到线段树。维护\(cov_i\)表示覆盖的懒标记。单点加与单点查都非常简单。全局覆盖只需要给每一层都打
  • 2022-11-13copulas对涉及时间连续随机过程的时变可靠性的影响研究(Matlab代码实现)
  • 2022-10-31SP19568 题解
    前言题目传送门!更好的阅读体验?好的线段树练习题。思路我们要维护三个操作:单点加。区间推平。区间查询质数。区间推平可以想到珂朵莉树,但是我不会,于是考虑线段树
  • 2022-10-28python coverage 代码覆盖率
    coverage  runmain.py coveragereport coveragehtml-d resulthtml 自动生成#使用API生成代码覆盖率统计报告#exec_api.pyimportcoverageimportuni
  • 2022-10-182004 Correlation Power Analysis with a Leakage Model
    一、汉明距离模型原理:CMOS电路中电流消耗与反转比特有关假设:相同数据下同时间总线比特位相同(不考虑非同步效应)、反转比特(0->1和1->0)消耗能量相同、消耗能量与
  • 2022-10-01CF1738H Palindrome Addicts
    题意初始有一个空字符串\(s\)。给定\(q\)组操作,每次操作是在\(s\)后加一个字符或是在\(s\)前删一个字符。每次操作后要输出\(s\)中本质不同回文子串数。数据
  • 2022-08-14Law of Iterated Expectations & Covariance
    LawofIteratedExpectations\(E[Y]=E_X[E[Y|X]].\)Thenotation\(E_X[.]\)indicatestheexpectationoverthevaluesof\(X\).Notethat\(E[Y|X]\)isafun