UMI：单细胞测序过程中提高准确性的一种手段。唯一分子标记（UMI）是一种分子条形码，可以在测序过程中错误校正，提高准确性。这些分子条形码均为短序列，可特异性的标记样本文库中的每个分子。UMI可用于各种测序应用，许多是与DNA和cDNA的PCR重复相关的应用。RNA-seq基因表达分析和其他定

1.程序功能描述旅行商问题（TravelingSalesmanProblem,TSP）是计算机科学和运筹学中的经典问题，其目标是寻找访问一系列城市并返回起始城市的最短可能路线。此问题属于NP-难问题，对于大规模的实例，精确的求解方法在计算上不可行。因此，启发式方法，特别是遗传算法（GeneticAlgorithms,GA），

内容来自教辅主编王友祺。基本定义与概念基因基因概念等位基因：位于同源染色体上的同一位置，控制同一对相对性状的基因。非等位基因：(1)同源染色体上不同位置控制不同相对性状的基因。（连锁）(2)非同源染色体上的基因。（自由组合）复等位基因：控制同一对相对性状的多种基因

 001、问题： gatkDBI模块在sheep1号染色体（其他染色体同样的命令并没有报错；一共134sheep个体）调用GenotypeGVCFs命令call snps时出现如下报错： 002、问题原因itlookslikewearehittingthelimitsofzlibmemory-wise.（达到zlib库的内存上限？） 003、解决方法

算法简介遗传算法（GeneticAlgorithm，GA）是一种基于自然选择和遗传操作的随机全局搜索优化算法。它通过模拟自然选择和遗传中发生的复制、交叉(crossover)和变异(mutation)等现象，从任一初始种群（父代）开始，通过随机选择、交叉和变异操作，产生更具有生存优势的子代，使群体不断向搜索空间最

 单体型（haplotype）也称单倍型，简单说就是一条染色体紧密相连的两个或两个以上基因座上一组等位基因的基因型，通常作为一个单位遗传。如一条染色体上HLA各位点的基因组合。HLA有多个基因座，每个基因座上有多个等位基因，一些基因座上的特定等位基因经常连锁在一起共同通过减数分裂传递给

 001、基于染色体合并gvcf文件gatkCombineGVCFs-Rreference.fna-Vgvcf.list-LchrN-OchrN.merged.g.vcf.gz其中：referen.fna是参考基因组；gvcf.list是将要合并的gvcf文件的列表文件，一行一个个体；格式如下：ERR2985607.g.vcfERR2985608.g.vcfERR2985609.g.vcfERR2

1.背景引入  本小节开始讲述转录组测序的准备工作.因为做的是有参的基因组分析,所以首先是准备参考基因组、测序数据.当数据准备完成后,接下来是比对参考基因组,表达定量,合并成表达矩阵,差异表达分析.  上面是转录组分析的大致步骤,这节我们介绍的是参考基因组.2.准备参

动动发财的小手，点个赞吧！简介ABBABABA统计（也称为“D统计”）为偏离严格的分叉进化历史提供了简单而有力的测试。因此，它们经常用于使用基因组规模的SNP数据（例如来自全基因组测序或RADseq）来测试基因渗入。在本次实践中，我们将结合使用可用软件和一些用R从头编写的代码来执行

目前做的基因proteinchromatinremodeling24 蛋白质染色体重塑 拟南芥编号AT5G63950CHR24基因是什么？Chr是什么？  误区①chromosome染色体chr染色体简称②（医学）R24抗体结合后形成ch-R24 CHR chromatinremodeling 染色质重塑 (chromatinremodeling)是通过

Circos玩多了难免会视觉疲劳，今天换一个新工具可视化，回到直条的染色体形式。https://www.jianshu.com/p/07ae1fe18071https://cran.r-project.org/web/packages/RIdeogram/vignettes/RIdeogram.html#install.packages('RIdeogram')library(RIdeogram)library(plyr)library(dp

1、allele又作allelomorph： 等位基因  一般指位于一对同源染色体的相同位置上控制着相对性状的一对基因。对同源的理解，不是指同源于某一生物个体，而是来源于某一个共同祖先DNA序列的基因同源（基因）：指遗传上来自于某一共同祖先DNA序列的基因。但我认为除了同一祖先，还需加上，形态

第一节减数分裂与受精作用减数分裂是两倍体细胞（有性繁殖）产生单倍体配子的过程，简单而言，染色体的数量变为一半。二倍体细胞中每一对染色体大小形态意义类似，一个从母方获得，一个从父方获得，故一对染色体也会有差距。有丝分裂产生复制品，往往用于常被磨损的细胞，例如皮肤。减数分裂的主

Circos可以在线使用，在线使用时是把表格转为圈图，不过只允许最大75行和75列；做一些简单的示意图会比较好，最后时会介绍下在线的tableviewer的使用。也可以安装在本地，在本地可以绘制基于基因组的更复杂的图。Circos由Perl写成，安装相对简单，只要Perl的包都装好了就可以了。Circos安装从htt

Admixture做群体结构分析是好用，但也有一些不顺手的地方。最大的问题是不支持非整数的染色体号！相信我们手里绝大部分vcf或plink格式文件，染色体ID基本是文本类型的吧。注意p

今天来学习一下遗传算法，其实相关的代码已经找到了，但是想先学一下，因为我发现我有些地方不能纯看代码看懂。还是得辅佐一下。说白了就是模拟生物进化的，那么我们先构建一个模

https://www.cnblogs.com/johnsonzzz/p/15151634.htmlhttps://github.com/YangJianshun/LINKVIEW可以绘制两个基因组、三个基因组的染色体水平的共线性关系。按染色体配

导读本文将介绍T2T基因组，并提供一份基因组组装的资料，其中包含：基因组组装数据和组装策略介绍；染色体水平基因组组装；基因组补洞；着丝粒和端粒分析等，获取方式见文末。简介随

导读本文将介绍基因组组装过程中，如何利用HiC测序数据，进行染色体级别基因组的组装。该过程主要利用Juicer和3D-DNA进行，有关第一步Juicer的过程，已经下方的文章中介绍了，

本文参考《MATLAB智能算法30个案例分析》一书，文末的源代码也来自本书本次推文为大家讲解免疫算法，隐约中记得一位小伙伴后台问我能否推出这样一篇推文，小编的参考资料很简单，依

染色体分散仪为细胞遗传实验室专门研发的染色体分散仪，用于细胞遗传实验室染色体滴片，得到理想的染色体分散效果。适用于原位培养和非原位培养的收获制片过程，可以处理外

全自动染色体滴片（制片）仪为细胞遗传实验室专门研发的全自动染色体滴片（制片）仪，用于自动将收获的中期分裂相细胞滴于玻片，同时完成染色体分散，制成可供显微镜阅片标准玻片。