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以块的形式处理大型 Spark DataFrame 的推荐方法是什么:“toPandas()”或“RDD.foreachPartition()”?

时间:2024-07-22 11:15:08浏览次数:13  
标签:python pandas apache-spark pyspark

我正在使用 PySpark 处理大型数据集,并且需要以每个 500 条记录的块的形式处理数据。我正在考虑使用 toPandas() 将我的 Spark DataFrames 转换为 Pandas DataFrames 以方便分块或坚持使用 Spark RDD,并使用 foreachPartition() 手动处理分块。

以下是我正在考虑的示例方法。

选项1:转换为 Pandas DataFrame

batch_size = 500    
# Convert Spark DataFrame to Pandas DataFrame for easier manipulation in chunks    
pd_df = df.toPandas()    
  
# Iterate through data in batches of 500    
for start_idx in range(0, len(pd_df), batch_size):    
    chunk = pd_df.iloc[start_idx:start_idx + batch_size]    
    do_something(chunk)    

选项 2:使用 RDD foreachPartition

import itertools  
  
def process_partition(iterator):  
    chunk_size = 500  
    # Use itertools.islice to handle chunking  
    while True:  
        chunk = list(itertools.islice(iterator, chunk_size))  
        if not chunk:  
            break  # Exit loop if no more data to process  
        do_something(chunk)  # Process each chunk  
  

df.rdd.foreachPartition(process_partition)  

我正在寻求有关哪种方法可能更有效且适合在分布式环境中处理大型数据集的建议。或者还有其他推荐的解决方案吗?

请指教。谢谢!!


当在 Spark 中处理大型数据集时,希望尽可能坚持使用分布式操作,避免将数据收集到驱动程序节点(这正是 toPandas() 所做的)。 选项 2(使用 foreachPartition() 更适合处理大型 Spark DataFrame,因为它利用了 Spark 的分布式特性。

以下是应该更喜欢 foreachPartition() 而不是 toPandas() 的原因:

  • 分布式处理: foreachPartition() 在每个分区上本地运行,允许并行处理数据。另一方面, toPandas() 将整个数据集收集到驱动程序节点,这可能会导致内存不足错误并成为大型数据集的瓶颈。

  • 内存效率: foreachPartition() 一次处理一个分区,而无需将整个 DataFrame 加载到内存中。这使得它比 toPandas() 更有效率, toPandas() 需要将所有数据加载到驱动程序的内存中。

  • 灵活性: foreachPartition() 为提供了对每个分区的迭代方式的更多控制,使能够实现自定义分块逻辑。

改进选项 2:

可以通过使用 itertools.groupby() 对每个分区中的记录进行分组来进一步优化选项 2:

def process_partition(iterator):
    chunk_size = 500
    for _, chunk in itertools.groupby(enumerate(iterator), lambda x: x[0] // chunk_size):
        do_something(list(chunk)[1] for chunk in chunk)  # 处理每个块

df.rdd.foreachPartition(process_partition)

此代码使用 groupby 根据其索引在块中对记录进行分组。这消除了在 itertools.islice 中进行切片时对额外 if 条件的需求,从而使其更加高效。

其他选择:

  • Spark SQL 窗口函数: 如果需要根据某些条件对数据进行分组或排序,则可以使用 Spark SQL 窗口函数对数据进行分区,而无需收集到驱动程序。

  • 编写自定义数据源: 对于需要精细控制分块和数据读取的其他用例,可以考虑编写自定义 Spark 数据源。

总的来说,为了在 Spark 中实现最佳性能和可扩展性,请坚持使用分布式操作,例如 foreachPartition() ,并避免将大型数据集收集到驱动程序。

标签:python,pandas,apache-spark,pyspark
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