在 Spark 上实现 Graph Embedding

标签：嵌入 Graph walk Embedding Spark 节点

在 Spark 上实现 Graph Embedding 主要涉及利用大规模图数据来训练模型，以学习节点的低维表示（嵌入）。这些嵌入能够捕捉和反映图中的节点间关系，如社交网络的朋友关系或者物品之间的相似性。在 Spark 上进行这一任务，可以使用 Spark 的图计算库 GraphX 或者利用外部库如 GraphFrames。

下面，我将介绍如何在 Spark 环境中实现基本的 Graph Embedding，我们将使用 GraphFrames，因为它提供了对 DataFrame 的支持，更为易用。

环境准备

安装 Spark：确保你的环境中已经安装了 Spark。
安装 GraphFrames：GraphFrames 是在 Spark DataFrames 上操作图的库。安装方法通常是将 GraphFrames 的依赖项添加到你的 Spark 作业中。

Graph Embedding 实现步骤

Step 1: 创建 Spark Session

首先，你需要创建一个 Spark 会话，这是使用 Spark 的入口。

from pyspark.sql import SparkSession

# 创建 Spark 会话
spark = SparkSession.builder \
    .appName("Graph Embedding Example") \
    .getOrCreate()

Step 2: 构建图

使用 GraphFrames 构建图，你需要两个主要的 DataFrame：顶点 DataFrame 和边 DataFrame。

from graphframes import *

# 创建顶点 DataFrame
vertices = spark.createDataFrame([
    ("1", "Alice"),
    ("2", "Bob"),
    ("3", "Charlie"),
], ["id", "name"])

# 创建边 DataFrame
edges = spark.createDataFrame([
    ("1", "2", "friend"),
    ("2", "3", "follow"),
    ("3", "1", "follow"),
], ["src", "dst", "relationship"])

# 创建图
graph = GraphFrame(vertices, edges)

Step 3: 使用 GraphFrames 进行图计算

我们将使用随机游走算法作为生成节点嵌入的基础。此处简化处理，考虑基于 PageRank 的方法来初始化我们的 Graph Embedding。

# 计算 PageRank
results = graph.pageRank(resetProbability=0.15, tol=0.01)
results.vertices.select("id", "pagerank").show()

Step 4: 进一步的嵌入处理

实际的 Graph Embedding 通常需要更复杂的处理，如 DeepWalk, Node2Vec 等。这些算法涉及随机游走以及后续使用 Word2Vec 算法来生成嵌入。这些步骤在 Spark 上实现需要额外的处理，可能涉及到自定义 PySpark 代码或者使用额外的库。

在现实世界的应用中，单靠 PageRank 并不足以捕获复杂的节点相互关系。更高级的方法如 Node2Vec，可以更有效地学习节点的低维表示。这里，我们将简化 Node2Vec 的实现思想，使用 PySpark 自定义实现随机游走和使用 Spark MLlib 的 Word2Vec 来生成嵌入。

随机游走算法

随机游走是 Graph Embedding 中一个重要的步骤，用于生成节点序列。这里我们简单实现随机选择下一个节点的逻辑。

from pyspark.sql.functions import explode, col

def random_walk(graph, num_walks, walk_length):
    walks = []
    for _ in range(num_walks):
        # 随机选择初始节点
        vertices = graph.vertices.rdd.map(lambda vertex: vertex.id).collect()
        for vertex in vertices:
            walk = [vertex]
            for _ in range(walk_length - 1):
                current_vertex = walk[-1]
                # 获取与当前节点相连的节点
                neighbors = graph.edges.filter(col("src") == current_vertex).select("dst").rdd.flatMap(lambda x: x).collect()
                if neighbors:
                    # 随机选择下一个节点
                    next_vertex = random.choice(neighbors)
                    walk.append(next_vertex)
            walks.append(walk)
    return walks

# 使用自定义的随机游走函数
walks = random_walk(graph, num_walks=10, walk_length=10)

使用 Word2Vec 生成嵌入

接下来，我们将使用 Spark MLlib 中的 Word2Vec 来从随机游走生成的序列中学习嵌入。

from pyspark.ml.feature import Word2Vec

# 将随机游走的结果转化为 DataFrame
walks_df = spark.createDataFrame(walks, ["walk"])

# 设置 Word2Vec 模型
word2Vec = Word2Vec(vectorSize=100, inputCol="walk", outputCol="result", minCount=0)
model = word2Vec.fit(walks_df)

# 获取节点的嵌入
node_embeddings = model.getVectors()
node_embeddings.show()

Step 5: 评估和使用嵌入

生成的节点嵌入可以用于多种下游任务，得到节点嵌入后，可以将其用于各种图分析任务，比如节点分类、图聚类等、链接预测等。评估嵌入通常需要具体任务相关的指标。评估嵌入的效果通常依赖于这些任务的性能。

节点分类示例

如果有节点的标签数据，可以使用这些嵌入来训练一个分类器，并评估其性能。

from pyspark.ml.classification import LogisticRegression
from pyspark.ml.evaluation import MulticlassClassificationEvaluator

# 假设有一个包含节点标签的 DataFrame
labels = spark.createDataFrame([
    ("1", "Class1"),
    ("2", "Class2"),
    ("3", "Class3"),
], ["id", "label"])

# 将标签与嵌入进行合并
data = labels.join(node_embeddings, labels.id == node_embeddings.word, how='inner')

# 准备数据集
data = data.select("result", "label")
(trainingData, testData) = data.randomSplit([0.8, 0.2])

# 训练逻辑回归模型
lr = LogisticRegression(maxIter=10, regParam=0.3, elasticNetParam=0.8, featuresCol="result", labelCol="label")
lrModel = lr.fit(trainingData)

# 评估模型
predictions = lrModel.transform(testData)
evaluator = MulticlassClassificationEvaluator(labelCol="label", predictionCol="prediction", metricName="accuracy")
accuracy = evaluator.evaluate(predictions)
print("Test Error = %g" % (1.0 - accuracy))

这个简单的流程展示了如何使用 Spark 和 GraphFrames 进行更高级的 Graph Embedding，并利用嵌入来执行图分析任务。实际应用中，你可能需要进一步调整模型的参数，或者对特定任务做优化。

Step 6: 部署到生产环境

将模型部署到生产环境通常涉及将模型保存并在生产环境中加载它，使用如下：

# 保存模型
model_path = "/path/to/save/model"
graph_embedding_model.save(model_path)

# 在生产环境中加载模型
loaded_model = GraphEmbeddingModel.load(model_path)

总结

这个示例提供了在 Spark 上进行基本图嵌入的框架，但请注意，真正的 Graph Embedding 如 DeepWalk 或 Node2Vec 需要更复杂的实现。如果你的需求超出了 PageRank 等简单算法的范围，可能需要查阅更多资源或使用专门的图分析工具来实现。这个示例提供了一个简单的示范引导，以便理解图嵌入的基本概念，并在 Spark 环境中实现它们。

标签：嵌入,Graph,walk,Embedding,Spark,节点
From： https://blog.csdn.net/goTsHgo/article/details/144556658