Cell Reports | 下一代混池测序技术（NG-BSA）助力育种4.0

分享一篇去年由中国农科院作物所张红伟和华中农业大学李林团队发表在Cell Reports上的综述文章：Next-generation bulked segregant analysis for Breeding 4.0。

该综述在总结传统混池测序技术（BSA）的基础上，提出了NG-BSA的研究策略。NG-BSA通过整合高通量表型技术、生物大数据技术与机器学习技术，提高了数量性状基因（QTG）克隆的效率、通量和准确性。将NG-BSA整合到Breeding 4.0中，可以提高作物定向改良和群体改良的效率。

图1.常规的功能基因克隆方法。

图2 BSA的全面概述。

A. 定位方法，基因分型，表型鉴定和BSA方法的发展历程。B. 用于检测QTL的统计学方法。C. 影响BSA的因素。D. BSA的适用范围。

表1 BSA的方法概述

图3. NG-BSA的设计。

NG-BSA整合了几个重要方面用于功能基因的批量高效克隆，包括大群体，HTP，BBD，机器学习以及多种多样的功能基因验证方法等。

图4.育种4.0阶段的NG-BSA

对于目标性状的靶向改良，首先利用NG-BSA克隆目标性状的功能基因，然后将功能基因整合到特定品系中。靶向改良可以对育种品系进行针对性的改良，例如病虫害的抗性等。对于群体改良，可以将供体的多种优异基因渗入到优势自交系，NG-BSA辅助功能基因克隆，提高了渗入的精确性以及种群改良的效率。

更多详情介绍请参考：Cell Press论文速递：下一代混池测序技术（NG-BSA）助力育种4.0

作者：生物信息与育种，请关注同名微信公众号：生物信息与育种。