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下载微生物数据(孟德尔随机化)

时间:2023-09-09 17:44:05浏览次数:40  
标签:vcf MendelR 孟德尔 ieu 随机化 微生物 5e csv

  1. 登录https://mibiogen.gcc.rug.nl/menu/main/home

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  3. 暴露因素选择条件0到1e-5 或者5e-8

  4. 作为结局数据选择条件5e-5到1

  5. 根据菌群纲目ID进行分类 ,可以选择MendelR包里面的函数进行切割并自动化SNP模版split_mibiogen_file('刚才下载的文件.csv')

libraray(MendelR)

#在线或者本地数据,多个暴露对应一个或者多个结局
mr_common_batch(c('ieu-a-2','ieu-b-2'),c('ukb-b-212','ieu-b-7'))

mr_common_batch('ieu-a-2.vcf.csv','ukb-b-212.vcf.csv')

标签:vcf,MendelR,孟德尔,ieu,随机化,微生物,5e,csv
From: https://www.cnblogs.com/missed-forest/p/17689894.html

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