在GWAS（基因组关联研究）中，QQ plot（Quantile-Quantile plot，分位数-分位数图）是一种常用的统计图形，用于评估GWAS结果中的关联统计量是否偏离了预期的分布。
GWAS旨在寻找基因型和表型之间的关联，通过对大量的SNP（单核苷酸多态性）进行关联分析。在GWAS中，每个SNP都会计算一个关联统计量（例如p-value），用于衡量该SNP与表型之间的关联强度。QQ plot用于比较这些关联统计量的分布与预期的均匀分布（或者预期的对数线性分布）之间的差异。
在GWAS中，QQ plot通常绘制关联统计量的负对数p-value在纵轴上，而横轴上是预期的分位数（根据假设的分布）。如果GWAS结果符合预期的均匀分布（或对数线性分布），QQ plot上的点应该大致沿着对角线分布。如果点集明显偏离对角线，那么可能存在显著关联的SNP，其关联统计量超出了预期的范围，暗示着可能存在真正的关联信号。
通过观察QQ plot，可以检查GWAS结果中是否存在偏离预期的情况，例如由于遗传结构、样本相关性或其他系统性因素引起的伪关联。如果QQ plot上的点明显偏离对角线，那么可能需要进一步探索这些SNP，以确定是否存在真实的关联信号或其他潜在的问题。
标签：QQ,plot,GWAS,关联,SNP,QQplot,统计 From： https://www.cnblogs.com/mxleader/p/17500210.html