一个核心的矛盾就是有motif的TF只占我们知道TF的一半不到，那自然在做分析的时候，很多motif就被忽略了，我在想能不能构建一个de novo的DNA motif数据库，在分析数据时我们还能有另外一个选项。
目前的金标准数据库：
- TRANSFAC
- JASPAR
- HOCOMOCO
- CIS-BP
TFBS鉴定工具：
- MEME
- HOMER
能不能找到对应TF的DNA-binding domains (DBDs)，针对性的设计gRNA或者药物。important mutations in DBD in cancer.
TF binding sites (TFBSs)，Genome-wide identification of TFBSs，the peaks appear in at least two independent datasets
classify TFs into structural families
position frequency matrices (PFMs)
position weigth matrices (PWMs)
MCB 182 Lecture 7.6 - Position weight matrices, sequence logos
标签：DNA,数据库,binding,TF,motif,matrices From： https://www.cnblogs.com/leezx/p/16989942.html