mer
  • 2024-05-01[USACO24OPEN] The 'Winning' Gene S
    [USACO24OPEN]The'Winning'GeneS题目背景注意:本题的内存限制为512MB,通常限制的2倍。题目描述在多年举办比赛并看着Bessie一次又一次地获得第一名后,FarmerJohn意识到这绝非偶然。他得出结论,Bessie一定将胜利写进了DNA,于是他开始寻找这种「胜利」基因。他设计了一
  • 2024-01-29不能坐视了!Oracle数据库varchar2字段扩容,每月总有那么一两次。----- 优秀的程序应总是能规避问题
    Oracle数据库varchar2字段扩容-始末今天,有后端小伙伴提了个sql工单。对我司服务商系统Oracle数据库的一个mer_name字段扩容。altertableT_MER_SETTLEmodifymer_nameVARCHAR2(100)审批前,我查了一下当前这个mer_name字段的长度是VARCHAR2(64)。基于对我司客户名称的长度
  • 2023-12-03LncDLSM: Identification of Long Non-coding RNAs with Deep Learning-based Sequence Model
    关键词:作者:期刊:IEEEJournalofBiomedicalandHealthInformatics年份:2023论文原文:https://doi.org/10.1101/2022.09.02.506180主要内容1问题:长链非编码RNA(LncRNAs)在调控基因表达和其他生物过程中起着至关重要的作用。区分lncRNA和蛋白质编码转录本(PCTs)有助于研究人员深
  • 2023-09-18线段树合并的复杂度
    线段树合并的时间复杂度是\(O(m\logn)\)的(\(m\)为插入次数)。intmer(intx,inty){if(!x||!y)returnx^y;t[x]+=t[y];returnL[x]=mer(L[x],L[y]),R[x]=mer(R[x],R[y]),x;}因为每个点只会在自己被删除(情况1)或父亲被删除且自己未删除的(即合并时另一个子树为空,
  • 2023-09-06001-FactoryTalk View studio 恢复mer文件
    mer文件是AllenBradleyPanelViewPlus系列触摸屏上的运行文件,一般情况,用户在RSVIewStudioME或FactoryTakViewStudioME系统下开发完成人机界面程序后,编译成可在触摸屏上运行的mer格式文件,上传到伸触摸屏内存供其运行。由于是编译后的运行格式,它并不含有开发项目的全部信息,但
  • 2023-08-27 Long-read error correction: a survey and qualitative comparison (长读错误纠正:一项调查和定性比较)
    BasicInformation:Title:Long-readerrorcorrection:asurveyandqualitativecomparison(长读错误纠正:一项调查和定性比较)Authors:PierreMorisse,ThierryLecroq,ArnaudLefebvreAffiliation:NormandieUniversité,UNIROUEN,INSARouen,LITIS,76000Rouen,
  • 2023-05-31第三代测序中基于德布鲁因图的长读错误纠正算法
    第三代测序中基于德布鲁因图的长读错误纠正算法摘要——PacBio单分子实时测序平台可以产生大量的长读序列,这对基因组的从头组装非常重要。尽管这些长读取具有15%的高错误率,但是由于它们的高错误率而放弃它们是不明智的。Illumina测序平台产生了长度在100bp左右的短读,错误率低,成本
  • 2023-05-20iEnhancer-ENCC_test_layer1.py源码阅读
    一、基本准备¶1、导入包:与train一致¶ In [ ]:importnumpyasnpimporttorchfromtorchimportnnfromtorch.autogradimportVariablefromtorch.utils.dataimportDataset,DataLoaderimporttorch.nn.functionalasFimportpickleimport
  • 2023-05-11reads、contigs、k-mer之间的区别
    "Reads"(序列)是指从DNA测序技术中得到的短片段DNA序列。通常这些序列长度较短,可能只有几百个碱基对长。"Contigs"(连读)是通过将读取序列拼接在一起来形成更长的序列。Contigs相对较长,可能达到数千个碱基对长,但它们可能仍然缺少一些重要的信息,例如重复序列或缺失区域。"k-mers"(k个
  • 2023-05-06基于调制误差比的自适应调制matlab仿真,自适应调制包括4QAM,16QAM和64QAM
    1.算法仿真效果matlab2022a仿真结果如下:   2.算法涉及理论知识概要        自适应调制编码技术的核心思想是:在不牺牲误比特率性能(比如BER)的前提下,根据无线通信环境和QoS要求,通过动态的改变发送端的发送功率、波特率、星座图的大小、编码方案、码率等,或者是
  • 2023-04-27elementUI表格默认多选
    this.multipleSelection=row.mer_type_idthis.$nextTick(()=>{this.multipleSelection.forEach(id=>{constrow=this.categoryMerTypeList.find(item=>item.mer_type_id==id);this.$refs.multipleTable.toggleRowSelection(row,true);});})
  • 2023-04-19Kraken序列分类算法
    当然可以!kraken是一种流行的高效序列分类器,使用k-mer(k个连续碱基组成的子串)方法对不同分类下的序列进行分类。以下是kraken序列分类算法简要说明:数据预处理首先,kraken会将参考数据库中的序列分割为固定长度的k-mers,这些k-mer会被记录到一个查询表中。样品序列匹配krake
  • 2023-04-18k-mer
    k-mer是一种用于描述序列数据的概念。在生物信息学中,k-mer通常指的是长度为k的连续子序列。例如,在dna序列中,4-mer(k=4)是四个连续的碱基;在蛋白质序列中,3-mer(k=3)是三个相邻的氨基酸。k-mer在基因组学、转录组学和蛋白质组学等领域中广泛使用。它们可以用于许多任务,例如:序列比对、元