• 2024-08-11BMC Genomics | 火龙果的转录组和代谢组分析揭示了果皮和果肉颜色形成的机制
    阐明火龙果果肉和果皮变色的候选基因和关键代谢产物,是培育具有优良新口味和高营养价值的火龙果的必要条件。在这里,使用转录组(RNA-Seq)和代谢组分析(UPLC-MS/MS)鉴定了属于两种不同量天尺属物种的三种火龙果的结构和调控基因以及与果皮和果肉颜色相关的关键代谢物。作者综合的转录
  • 2024-08-08Genomics | 转录组和代谢组分析揭示了铁皮石斛中黄酮类化合物的积累
    铁皮石斛是一种在中国有着悠久使用历史的中草药。黄酮是铁皮石斛重要的次生代谢产物,但其在铁皮石斛中的分子调控机制尚不清楚。在这项研究中,作者收集了一年到四年生的铁皮石斛茎,用于rna测序和质谱数据收集。结果表明,代谢组学分析检测到124种不同的类黄酮代谢物,其中黄酮醇代谢物在
  • 2024-08-08BMC Genomics | 综合代谢组学和转录组学分析揭示了菊花黄酮和咖啡酰奎宁酸的生物合成机制
    杭白菊是一种流行的药用和食用植物,主要通过黄酮类和咖啡酰奎宁酸(CQAs)的存在发挥其生物活性。然而,菊花头状花序中黄酮和CQA生物合成的调控机制尚不清楚。本研究采用高效液相色谱法测定了菊花头状花序发育过程中黄酮类化合物和CQAs的含量,发现在S1和S2阶段含量较高,在S3~S5阶段含
  • 2024-05-23[Usaco2017 Open]Bovine Genomics 题解^&*^(
    不知道为啥,我死活想不到二分(楼下正解)所以,就有了这篇题解可以看到,这道题离暴力的距离只有一步!就是数组开不下!!小问答:数组开不下时,你会?A:mapB:优化代码C:gp_hash_table由于正在学hash,所以容易想到...tong[本来的下标%9999999]然后就玄学的过了。。。ACcode#include<bi
  • 2024-04-24P3667 Bovine Genomics Hash+二分题解
    砂金听说了你在学字符串,于是在CLOI里出了道题给你P3667BovineGenomics题链:洛谷hzoi提高\(hash\)基础题。思路是二分答案,\(check\)中比较每一个区间字串的\(hash\)值是否相等。比较的时候可以用\(set\)或\(map\)。\(set\)的好处在于无重元素,判断时先将\(a\)串中区间子串
  • 2024-04-24P3667 [USACO17OPEN] Bovine Genomics G (set容器)
    [USACO17OPEN]BovineGenomicsG题目描述FarmerJohnowns\(N\)cowswithspotsand\(N\)cowswithoutspots.Havingjustcompletedacourseinbovinegenetics,heisconvincedthatthespotsonhiscowsarecausedbymutationsinthebovinegenome.Atgr
  • 2024-03-09P3670 [USACO17OPEN] Bovine Genomics S 题解
    题意给定\(2\)组字符串,每组\(n\)个,每个字符串包含\(m\)个字符。我们称一个三元组\((i,j,k)\)是合法的,当且仅当第二组的每个字符串中下标为\((i,j,k)\)的字符拼成的字符串与第一组的每个字符串中下标为\((i,j,k)\)的字符拼成的字符串均不相等。现在需要你对于给定的
  • 2023-12-15Inferring Developmental Trajectories and Causal Regulations with Single-cell Genomics用单细胞基因组学推断发育轨迹和
    InferringDevelopmentalTrajectoriesandCausalRegulationswithSingle-cellGenomicsDevelopmentiscommonlyregardedasahierarchicalbranchingprocesswhichisgovernedbyunderlyinggeneregulatorynetworks.Single-cellgenomics,single-cellRNA-seq
  • 2023-11-03RepeatMasker 软件的安装
     001、安装TRFa、github地址:https://github.com/Benson-Genomics-Lab/TRFb、wget-chttps://github.com/Benson-Genomics-Lab/TRF/archive/refs/tags/v4.09.1.tar.gztar-xzvfv4.09.1.tar.gzcdTRF-4.09.1/./configuremakemakeinstall 调用测试:(base)[root@pc1so
  • 2023-10-31单细胞测序 10x genomics
     单细胞转录组从研究方向看上,发育生物学、免疫、神经生物学、肿瘤是排名靠前的方向,这和我们平时遇到的高频研究方向基本吻合。另外,作为一个新兴的领域,10X单细胞转录组检测到细胞多,数据庞大,信息复杂,对数据分析带来诸多困难,因此算法类的文章(Computationalmethod)也高达76篇。从物种
  • 2023-10-31空间转录组测序 概述
    空间转录组测序概述在多细胞生物中,单个细胞的基因表达严格按特定的时间和空间顺序发生,即基因表达具有时间特异性和空间特异性。时间特异性可以通过对不同时间点的样本取材,使用单细胞转录组测序技术来解析时间维度上细胞类型和基因表达模式。空间特异性信息则相对较难获得。常规转