培训时，同一段代码，大家都运行的好好的，而你却出现问题了，一般都是考虑包里的函数冲突了。这时需要一个个去排查到底是哪个函数发生了冲突，有没有更好的办法呢？本文介绍一个包conflicted，可以列出所有冲突的函数，并可以设置优先使用哪个函数来处理冲突。包的安装install.packages("c

禁止商业或二改转载，仅供自学使用，侵权必究，如需截取部分内容请后台联系作者!介绍宏基因组数据的荟萃分析是一种综合多个独立宏基因组研究结果的方法，目的是揭示不同人群或样本中微生物群落的共同特征和差异。这种方法特别适用于跨区域、跨人群的大规模比较研究，能够帮助科学家

介绍可发表的prism点图加载R包knitr::opts_chunk$set(echo=TRUE,message=FALSE,warning=FALSE)library(tidyverse)library(ggpubr)library(ggprism)rm(list=ls())options(stringsAsFactors=F)导入数据data("iris")head(iris)处理数据plotdata

用conflicted包解决参考：https://blog.csdn.net/qazplm12_3/article/details/119621588#1安装软件包install.packages("conflicted")#2显示冲突的包library(conflicted)conflict_scout()#3设置优先使用的包的函数（例如上述的`filter()`:dplyrandstats冲突）#优先使

1.jjVolcano_Redefinelibrary(scRNAtoolVis)#jjVolcano只有9个颜色，Redefine到我的24个颜色，并与我umap中的分群颜色对应jjVolcano_Redefine<-function(diffData=NULL,myMarkers=NULL,order.by=c("avg_log2FC"),log2FC.cutoff=0.

R语言dplyr包near函数查看向量对应元素是否相同或者相近实战目录R语言dplyr包near函数查看向量对应元素是否相同或者相近实战#

#清除所有变量rm(list=ls())#设置工作目录setwd("C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\新建文件夹\\PCA_Pathway")#1.加载所需的库library(vegan)library(tidyverse)library(ggpubr)library(patchwork)library(ggforce)#2.读取和处理数据otu<-read.tabl

rm(list=ls())#清除所有变量#1.导入所需的库。library(vegan)library(tidyverse)library(ggalt)library(car)library(ggforce)library(ggpubr)library(patchwork)#2.定义所需的函数。pairwise.adonis1<-function(x,factors,p.adjust.m){x=as.matri

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写在前边虽然现在是高通量测序的时代，但是GEO、ArrayExpress等数据库储存并公开大量的基因表达芯片数据，还是会有大量的需求去处理芯片数据，并且建模或验证自己所研究基因的表达情况，芯片数据的处理也可能是大部分刚学生信的道友入门R语言数据处理的第一次实战，因此准备更新100个基因

rm(list=ls())#清除所有变量#1.导入所需的库。library(vegan)#提供了进行社区生态学分析的函数，包括多元分析、物种多样性分析等。library(tidyverse)#一组用于数据科学的R包，包括ggplot2、dplyr、tidyr、readr、purrr和tibble等。library(ggalt)#增强了ggplot2的功能

主成分分析rm(list=ls())library(vegan)library(tidyverse)library(ggalt)library(car)library(ggforce)library(ggpubr)library(patchwork)#2.定义所需的函数。pairwise.adonis1<-function(x,factors,p.adjust.m){#定义了一个名为pairwise.adonis1的

rm(list=ls())#清楚所有变量#1.导入所需的库。library(vegan)#提供了进行社区生态学分析的函数，包括多元分析、物种多样性分析等。library(tidyverse)#一组用于数据科学的R包，包括ggplot2、dplyr、tidyr、readr、purrr和tibble等。library(ggalt)#增强了ggplot2的功能

#1.导入所需的库。library(vegan)library(tidyverse)library(ggalt)library(car)library(ggforce)library(ggpubr)library(patchwork)#2.定义所需的函数。pairwise.adonis1<-function(x,factors,p.adjust.m){#将输入转换为矩阵x=as.matrix(x)co=

文章和代码已经归档至【Github仓库：<https://github.com/timerring/dive-into-AI>】或者公众号【AIShareLab】回复R语言也可获取。这个包以一种统一的规范更高效地处理数据框。dplyr包里处理数据框的所有函数的第一个参数都是数据框名。下面以MASS包里的birthwt数据集为例，介

原始数据df1如下所示，ID=3有重复行，对于重复的行，则合并列。IDVal1Val2Val302341532234334593259变成如下所示：IDVal1Val2Val302341532234334,2