- 2024-06-0610X空间转录组数据分析之CNV轨迹层级
作者，EvilGenius今天我们要完成一项工程，那就是CNV层级轨迹，如下图：首先来看一下什么是CNV谱系拷贝数变异(CNVs)在细胞增殖过程中在基因组中积累，提供了系统发育谱系的特征。通过转录组数据上使用intercnv生成CNV谱，能够以空间和时间分辨率跟踪克隆系统发育。文章空间转录组数
- 2023-08-20序列变异类型
001、SV 002、CNV 。
- 2023-05-19CNA-seq
检测cnv的范围：1KB～几M，中值100KB杂合性缺失，位于一对同源染色体上的相同基因座位的两个等位基因中的一个（或其中部分核苷酸片段）发生缺失，与之配对的染色体上仍然存在1:在有的文献中指出cfDNA长度一般在167bp,ctDNA一般在145bp.在脑脊液中发现（ctDNA）取代在血浆中。本文对13个病人进行了
- 2023-02-12单细胞转录组实战04: infercnvpy识别恶性细胞
Infercnvisascalablepythonlibrarytoinfercopynumbervariation(CNV)eventsfromsinglecelltranscriptomicsdata.Inputdataadata.X数据需要标准化和lo
- 2023-01-15Canvas 图形-02：绘制基本图形、调色板
绘制基本图形、调色板<!DOCTYPEhtml><htmllang="en"><head><metacharset="UTF-8"/><metahttp-equiv="X-UA-Compatible"content="IE=edge"/><me
- 2023-01-06单细胞 | CNV和SNV（genome + MT）推测lineage tree
正式进入cancergenomics领域，只不过是从scRNA-seq与scATAC-seq入手。我们的问题是如何从有限的SNV和CNV数据里推测出CRC的lineage的关系。 使用的工具：https://git