- 2024-07-29单细胞转录组上游fasta文件处理
单细胞分析上游fasta文件处理——基于cellranger与dropseqRunner ###如果测序文件由10Xgenomics平台产生，则采用cellrangercount的基本流程进行fasta文件的上游处理；如果测序文件由dropseq平台产生，则采用dropseqRunner软件进行处理一、cellranger配置1、软件安装并查看帮助
- 2023-02-09单细胞转录组实战02: 数据整理与之质控
安装CellRangercd~/APPwget-Ocellranger-7.1.0.tar.xz"https://cf.10xgenomics.com/releases/cell-exp/cellranger-7.1.0.tar.xz?Expires=1674686023&Policy=eyJTdG
- 2023-02-07单细胞转录组实战01: CellRanger7定量
安装CellRangercd~/APPwget-Ocellranger-7.1.0.tar.xz"https://cf.10xgenomics.com/releases/cell-exp/cellranger-7.1.0.tar.xz?Expires=1674686023&Policy=eyJTdG
- 2022-12-23单细胞数据 mkfastq | 10x Genomics
除了刚接触10x的那会儿，还真没怎么亲自倒腾过fastq的制作。正常从测序商那里拿到的应该是bcl的原始数据，需要自己做一步bcl2fastq。后面大家都觉得这一步太麻烦了，没必要