- 2024-06-15NBT | 基因注释质量评估新工具OMArK,超越BUSCO
今年2月,NatureBiotechnology在线发表论文:QualityassessmentofgenerepertoireannotationswithOMArk,描述了一个用于评估蛋白质编码基因注释质量的OMArk软件包。许多研究直接依赖于从基因组组装中预测的蛋白质编码基因库(“蛋白质组”)来进行比较。这样做依赖于以下假设:所有
- 2023-06-21centos 7中 利用conda 安装busco
001、利用conda创建py3.7环境,并进入pyt3.7环境condacreate-nbusco-py3.7python=3.7condaactivatebusco-py3.7 002、利用conda安装buscocondainstall-cconda-forge-cbiocondabusco=5.4.7 003、调用测试(busco-py3.7)[root@PC1~]#busco--versio
- 2023-05-17centos7 中安装 busco
001、系统[root@PC1software]#cat/etc/redhat-releaseCentOSLinuxrelease7.9.2009(Core) 002、python版本[root@PC1software]#python3--versionPython3.11.3 003、gcc版本[root@PC1software]#gcc--versiongcc(GCC)4.8.520150623(RedHat
- 2023-05-17conda 中 列出已经创建的环境、进入及退出
001、列出所有环境[root@PC1software]#condainfo-e#condaenvironments:#base*/root/anaconda3busco-py3.7/root/anaconda3/envs/busco-py3.7 002、进入指定环境[root@PC1~]#condaactivatebusco-py3.7 003、退出