TSV
  • 2024-10-20shell编程小技巧:进程替换
    今天来给大家介绍一个非常好用的shell编程技巧,即进程替换(Processsubstitution)。进程替换可以将一个进程(程序)的输入或输出当做一个文件来使用。它的两种使用形式为:<(cmd)或>(cmd).需要注意的是,<和>与(之间不能有空格!下面通过一个示例来介绍进程替换的具体用法。假如我有一个
  • 2024-10-03TSV的空洞是怎么形成的?
      知识星球里的学员问:在TSV工艺填充时,常会看到空洞,请问空洞形成的机理是什么?  TSV的空洞是什么样子?  如上图,a,d,e是有空洞的TSV;b,c是正常的的TSV填充的效果。  TSV填充空洞的形成机理?1,在TSV电镀过程中,电流在孔口区域会集中,导致该区域的电流密度较大。导致沉积速率比孔内
  • 2024-09-19单细胞数据 存储方式汇总
    (单细胞下游分析——不同类型的数据读入,与部分数据类型的转化).h5ad(anndata数据格式)10x_mtx(cellranger输出,三个文件)就是cellranger上游比对分析产生的3个文件:├──xxx_feature_bc_matrix│├──barcodes.tsv.gz:细胞标签(barcode)│├──features.tsv.gz:基因ID(
  • 2024-08-06R:tsv_to_txt.R
    此代码的功能是遍历当前目录下的所有TSV文件,将每个文件的第一列内容提取出来,并将其写入一个TXT文件中。每个TSV文件的内容占一行,文件名作为该行的第一列,第一列内容依次排开。rm(list=ls())setwd("C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\pre_result-gene\\pre")#设置工作目录li
  • 2024-08-01比较基因组学流程
    1、OrthoFinder教程 用于比较基因组学的系统发育直系学推断1.1orthofinder介绍OrthoFinder是一种快速、准确和全面的比较基因组学分析工具。它可以找到直系和正群,为所有的正群推断基因树,并为所分析的物种推断一个有根的物种树。OrthoFinder还为比较基因组分析提供全面的统计
  • 2024-06-30[HBM] HBM TSV (Through Silicon Via) 结构与工艺
    依公知及经验整理,原创保护,禁止转载。专栏《深入理解DDR》全文3300字。1概念1.1什么是HBMTSV使用TSV堆叠多个DDRDRAM成为一块HBM,成倍提高了存储器位宽,一条位宽相当于高速公路的一条车道,车道越多,在相同的车速下,传输运输量自然越大。1.2TSV优点(1)高密
  • 2024-03-11tsv文件在大数据技术栈里的应用场景
    是的,\t是指制表符(tab),它通常用作字段分隔符在TSV(Tab-SeparatedValues)格式的文件中。TSV是一种简单的文本格式,它使用制表符来分隔每一列中的值,而每一行则代表一个数据记录。TSV文件例:ID\tName\tAge\tCity1\tJohnDoe\t28\tNewYork2\tJaneSmith\t32\tLosAngeles上面的例
  • 2023-12-25JAVA TSV文件的解析与生成
    TSV文件与CSV文件的区别TSV为用制表符tab分隔的文本文件。CSV为用逗号,分隔的文本文件。TSV文件的打开方式1.使用nodepad++等文本工具打开,使用记事本打开会导致某些行的格式错误。2.打开一个Excel,直接将tsv文件拖进去即可。JAVATSV文件的解析1.添加univocity-parsersjar包依赖
  • 2023-07-25Databend 开源周报第 103 期
    Databend是一款现代云数仓。专为弹性和高效设计,为您的大规模分析需求保驾护航。自由且开源。即刻体验云服务:https://app.databend.cn。What'sOnInDatabend探索Databend本周新进展,遇到更贴近你心意的Databend。创建网络策略网络策略(NetworkPolicies)是一组用于管理
  • 2022-09-27TCGA代码分析流程 - 1.2. 整理表达矩阵和临床信息数据
    1.整理表达矩阵下载的文件是按样本存放的,每个tsv文件中都记录着一个样本的基因表达量,需要将所有tsv文件合并,得到所有样本的基因表达量的表格。准备setwd("D:/R/CHOL")
  • 2022-09-22GEO代码分析流程 - 8. 标准流程的后续 - string + Cytoscape
    蛋白互作网络图-网页工具string输入数据:差异基因输出:一个ppi图,可以导出数据放入Cytoscape进行网络可视化制作string的输入数据load("step4output.Rdata")gene_u
  • 2022-09-01Linux:按一个文件的每一行查找另一个文件
     #!/usr/bin/bashforjin`ls$1/*/*_nv.tsv`#我的目标文件是以_nv.tsv结尾的,所以将他们全列出dojj=${j##*/}jjj=${jj%_*}echo$jjj>>testnv.txt