NII
  • 2024-08-26window环境下关于fMRI的nii文件的预处理的批量代码
    配套fMRI预处理使用。之前预处理忘记删前十秒的文件(为什么要删掉?因为前十秒的文件不稳定),于是59个文件夹不仅要保留删除前十秒还没预处理的文件,还要在每个文件夹里删掉大概一共700个左右的各个预处理步骤遗留下的文件。后面问了chatGPT,写了window脚本挺好用的,省了不少事,这里记录一
  • 2024-07-29nii转dicom及修改dicom信息
    importnibabelimportnumpyasnpimportpydicomimportosfromtqdmimporttqdmdefconvertNsave(arr,file_dir,index=0,slice_thickness=1.0,pixel_spacing=(1.0,1.0)):"""`arr`:parameterwilltakeanumpyarraythatrepresents
  • 2024-07-24DICOM格式转NII格式——SPM12批量码
     运行说明:subjectsdir换成自己的文件夹地址,有多少个受试者的DICOM就有多少个subjects子元素。 %-----------------------------------------------------------------------%Jobsavedon02-Sep-201918:21:16bycfg_util(rev$Rev:6942$)%spmSPM-SPM12(7219
  • 2024-06-17nii转dicom,需要一个同序列dicom图像模板作为参考
    ``importnibabelimportnumpyasnpimportpydicomimportosfromtqdmimporttqdmdefconvertNsave(arr,file_dir,index=0,slice_thickness=1.0,pixel_spacing=(1.0,1.0)):"""`arr`:parameterwilltakeanumpyarraythatreprese