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  • 2023-12-26在只基于长读段的算法中,通过将长读段比对到由这些长读段自己构建的de Bruijn图上,采用何种策略进行错误纠错?
    基于长读段的算法可以通过将长读段比对到由这些长读段自己构建的deBruijn图上来进行错误纠错。在这种算法中,可以采用以下策略进行错误纠错:1.比对路径评判:通过比对长读段到deBruijn图上的路径,可以得到多条比对路径。为了找到正确的比对路径用于纠错,可以采取两种规则来评判比对
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    第三代测序中基于德布鲁因图的长读错误纠正算法摘要——PacBio单分子实时测序平台可以产生大量的长读序列,这对基因组的从头组装非常重要。尽管这些长读取具有15%的高错误率,但是由于它们的高错误率而放弃它们是不明智的。Illumina测序平台产生了长度在100bp左右的短读,错误率低,成本
  • 2023-01-02(组合数学笔记)Pólya计数理论_Part.10_Pólya定理的推广——De Bruijn定理的母函数形式
    文章目录写在前面介绍DeBruijn定理的母函数形式,由此《(组合数学笔记)Pólya计数理论》系列完结。引入与Pólya定理的母函数形式的推导类似,首先引入模式清单的概念,并介绍两个
  • 2022-11-21侠盗猎车 -- 玩转滚动码(上)
    原文首发于看雪,作者为Kevin2600,文章联系作者授权转载。0x00前言大家好,我是星舆车联网实验室Kevin2600。团队成员在漏洞挖掘,硬件逆向与AI大数据方面有着丰富经验,连