• 2024-06-15Rajeev K. Varshney:设计未来作物,基因组学辅助育种时代来临
    介绍一篇RajeevKumarVarshney于2021年在TrendsinPlantScience专题《养活世界:植物育种的未来》上的综述,强调了基因组学辅助育种(genomics-assistedbreeding,GAB)的作用和意义。关于RajeevKumarVarshney,他在基因组测序、利用遗传多样性、基因组学辅助育种、种子系统和发展
  • 2024-02-27易基因:CHH甲基化丢失可触发玉米表观等位基因的可遗传变化|作物研究
    大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。研究人员已经在多种植物物种中观察到在杂交过程中跨染色体间互作而导致DNA甲基化变化。然而,这些互作的原因或结果知之甚少。2023年12月18日,佛罗里达大学微生物学和细胞科学系meixiaZhao等人在《PlantPhysiology》
  • 2023-10-14在全基因组选择中,基因组数据是如何输入进神经网络中的
    在全基因组选择(GS)中,通常使用基因分型数据,这些数据来源于一个组织或个体的DNA。这些数据通常是由高通量测序或基因分型技术得到的。为了将这些数据用作神经网络的输入,我们需要将它们转换为合适的格式。以下是这一过程的详细步骤:基因分型数据:通常,基因分型数据表示为二进制或三类
  • 2023-10-10单体型(haplotype)也称单倍型
     单体型(haplotype)也称单倍型,简单说就是一条染色体紧密相连的两个或两个以上基因座上一组等位基因的基因型,通常作为一个单位遗传。如一条染色体上HLA各位点的基因组合。HLA有多个基因座,每个基因座上有多个等位基因,一些基因座上的特定等位基因经常连锁在一起共同通过减数分裂传递给
  • 2023-09-26生信教程:使用全基因组SNP数据进行ABBA-BABA分析
    动动发财的小手,点个赞吧!简介ABBABABA统计(也称为“D统计”)为偏离严格的分叉进化历史提供了简单而有力的测试。因此,它们经常用于使用基因组规模的SNP数据(例如来自全基因组测序或RADseq)来测试基因渗入。在本次实践中,我们将结合使用可用软件和一些用R从头编写的代码来执行