分享一篇2023年7月25日发表在MolecularPlant上的一篇综述文章：“Plantgenomeresequencingandpopulation genomics:Currentstatusandfutureprospects”，总结了植物基于群体的基因组重测序研究的进展以及这些研究对作物育种的影响。全文摘要这篇论文总结了植物基因组重

1、OrthoFinder教程 用于比较基因组学的系统发育直系学推断1.1orthofinder介绍OrthoFinder是一种快速、准确和全面的比较基因组学分析工具。它可以找到直系和正群，为所有的正群推断基因树，并为所分析的物种推断一个有根的物种树。OrthoFinder还为比较基因组分析提供全面的统计

HGP的主要人物是人类的DNA测序遗传图谱：连锁分析法物理图谱：指DNA链的限制性酶切片段的排列顺序序列图谱：测序获得基因图谱（genemap）：基因图谱是在识别基因组所包含的蛋白质编码序列的基础上绘制的结合有关基因序列、位置及表达模式等信息的图谱。生物信息学与组学作为新兴的交

近期，中国农科院作物所联合国内多家单位，构建了用于水稻基因组选择的大规模中国栽培稻群体数据集，提出了配套的全基因组预测深度学习模型DeepCCR，为育种者快速、高效地培育优良品种提供了有利工具。相关研究成果以简讯方式在线发表在《PlantBiotechnologyJournal》上。水稻是世界

读书笔记：《生物信息学与功能基因组学》第十五章-第一部分摘要第十五章聚焦于真核生物中的真菌基因组，探讨了真菌的多样性、与人类和其他生物的密切关系以及它们在生态系统中的重要性。本章首先介绍了真菌的基本概念和分类，随后深入分析了真菌基因组的结构、功能和进化，特别

近期，华中农大赵虎&郭亮团队在JIPB上发表发表综述：FunctionalgenomicsofBrassicanapus:Progresses,challengesandperspectives，总结了近年来油菜功能基因组学的研究进展，包括种质资源、组学数据库和克隆功能基因的可用性以及主要挑战和前景。甘蓝型油菜(Brassicanapus;AA

介绍一篇RajeevKumarVarshney于2021年在TrendsinPlantScience专题《养活世界：植物育种的未来》上的综述，强调了基因组学辅助育种（genomics-assistedbreeding,GAB）的作用和意义。关于RajeevKumarVarshney，他在基因组测序、利用遗传多样性、基因组学辅助育种、种子系统和发展

今日介绍一家大数据AI超级独角兽公司，以及它如何与当前生物基因组学相结合。它就是Databricks，没错，俗称“砖厂”。Databricks简介Databricks公司诞生于2013年，是属于Spark的商业化公司，创始人来自ApacheSpark大数据处理系统的创始团队，包括加州大学伯克利分校的AMP实验室。Databric

生物信息学常用医学生物信息学数据库/生物信息学(第二版)/生物信息学基因和蛋白质分析的实用指南/医学生物信息学/简明生物信息学/生物信息学网络资源与应用/生物信息学手册/生物信息学/生物信息学：序列与基因组分析/生物信息学与功能基因组学/生物信息学算

目录深度学习：概念、工具和注意事项沿着分子生物学的中心法则进行深度学习DNA和基因特性蛋白质特性模型和数据共享理解基因组变异：从关联到因果关系和分子机制深度学习育种4.0：编辑育种结论植物基因组学取得了巨大进步，其特点是高通量技术的爆炸式增长，以低成本识别多维全基因组分子

目录深度学习：概念、工具和注意事项沿着分子生物学的中心法则进行深度学习DNA和基因特性蛋白质特性模型和数据共享理解基因组变异：从关联到因果关系和分子机制深度学习育种4.0：编辑育种结论植物基因组学取得了巨大进步，其特点是高通量技术的爆炸式增长，以低成本识别多维全基因组分子

这段文字主要描述了深度学习（DL，DeepLearning）在多个领域中的应用，并提供了其实用性的实证证据。深度学习的广泛应用：深度学习是一种强大的工具，已被用于开发各种人工智能系统、产品、设备和应用。这些产品涵盖了从社会科学到自然科学的各个领域。高科技产品的应用：许多现代技术产品，如

引言是一篇文献的开头部分，它的目的是介绍研究的背景、目标、方法和结果，以及为什么这项研究是重要和有意义的。引言通常包括以下几个部分：背景：这部分提供了研究领域的基本信息，包括相关的理论、概念、术语和先前的研究。背景应该从一般到具体，逐渐引出研究的主题和问题。目标：这部分

 《宏基因组技术及其在微生物学研究中的应用》      学   院：食品与生物工程学院小组成员：颜传永22020080057材料收集尹立来22020080059材料收集余文韬22020080060文本编写鄢楚洋22020080056文本编写 二○二三年六月宏基因组技术及其在微生物学

k-mer是一种用于描述序列数据的概念。在生物信息学中，k-mer通常指的是长度为k的连续子序列。例如，在dna序列中，4-mer（k=4）是四个连续的碱基；在蛋白质序列中，3-mer（k=3）是三个相邻的氨基酸。k-mer在基因组学、转录组学和蛋白质组学等领域中广泛使用。它们可以用于许多任务，例如：序列比对、元

宏基因组学是在生物技术和计算机科学的帮助下发展起来的，它的出现可以追溯到上世纪90年代后期。传统微生物学侧重于使用培养方法研究单个微生物菌落，而宏基因组学则通过分析环境中的dna，可以同时研究数百万个微生物群体。这种方法能够提供关于整个微生物群落的结构、功用潜力和相互作