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编程问答
单倍
2024-10-06
Pangene:李恒开发泛基因图谱构建工具——探索群体基因组时代研究新方向
导读:七月份,李恒开发的基因内容图谱构建软件——Pangene,以标题为:Exploringgenecontentwithpangenegraphs的论文论文形式一并发表,发表期刊为Bioinformatics杂志。该软件迎合了群体基因组学时代数据井喷的现状,而一定程度上分析工具和软件算法匮乏做出了有益地探索和补充。Pange
2024-09-03
文献解读- Genome-wide imputation using the practical haplotype graph in the heterozygous crop cassava
关键词:农业;基因测序;变异检测;文献简介标题(英文):Genome-wideimputationusingthepracticalhaplotypegraphintheheterozygouscropcassava标题(中文):使用杂合作物木薯中的实用单倍型图进行全基因组插补发表期刊:G3作者单位:康奈尔大学等发表年份:2021文章地址:https://doi.org/10.10
2024-07-10
【基于R语言群体遗传学】-16-中性检验Tajima‘s D及连锁不平衡 linkage disequilibrium (LD)
Tajima'sDTest已经开发了几种中性检验,用于识别模型假设的潜在偏差。在这里,我们将说明一种有影响力的中性检验,即Tajima'sD(Tajima1989)。Tajima'sD通过比较数据集中的两个
2024-06-15
Tropical Plants | 改进的日本晴单倍型基因组UQ_NIP
昆士兰大学RobertJ.Henry教授团队利用改进的单倍型水平基因组组装揭示更多的水稻基因。本研究利用更准确的测序技术,分析组装了一个改进的单倍型水平水稻基因组。该改进的基因组组装包含了早期基因组序列中缺失的区域,并且基于更高的序列准确性注释了3000多个新的基因。这个单倍