我试图了解如何计算高斯过程的后验概率。我正在使用 Matern 内核
ker = GPy.kern.Matern32(10, ARD=True)
均值由下式给出
K(xtest,xtrain)*K(xtrain,xtrain)^{-1}*ytrain
当尝试计算第二个乘法时:|| |我收到奇点错误,实际上 ker.K(xTrain,xTrain) 的行列式为零。我在这里做错了什么?我是否错误地构建了协方差矩阵?
chunk = np.linalg.solve(ker.K(xTrain,xTrain),yTrain)
I get a singularity error, and in effect the determinant of ker.K(xTrain,xTrain) is zero. What am I doing wrong here? Am I constructing the covariance matrices wrongly?
遇到奇点错误的原因很可能是的训练数据点
xTrain
中存在重复值,或者某些数据点彼此非常接近。这会导致协方差矩阵
ker.K(xTrain, xTrain)
中出现相同的行或列,从而导致矩阵奇异(即行列式为零)且不可逆。
以下是解决此问题的一些方法:
1. 检查并删除重复数据:
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检查的训练数据
xTrain
是否存在重复的行。 - 如果存在重复的行,请删除它们,仅保留唯一的数据点。
2. 增加微小扰动:
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在协方差矩阵的对角线上添加一个小的正值(称为“抖动”或“噪声”)。这有助于稳定矩阵求逆,并防止奇点错误。
python ker.K(xTrain, xTrain) + 1e-6 * np.eye(len(xTrain))
其中1e-6
是一个小的正值(可以根据需要调整)。
3. 使用更鲁棒的求解器:
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不要直接使用
np.linalg.solve
,而是使用更鲁棒的求解器,例如np.linalg.lstsq
或scipy.linalg.solve
。这些求解器即使在矩阵接近奇异时也能提供合理的解。 ```python from scipy.linalg import solvechunk = solve(ker.K(xTrain, xTrain), yTrain, assume_a='pos') ```
4. 检查核函数参数:
- 确保的 Matern 内核参数(长度尺度)设置正确。如果长度尺度太小,则协方差矩阵可能会变得接近奇异。尝试增加长度尺度的值。
5. 减少训练数据量:
- 如果其他方法都失败,可以尝试减少训练数据的数量。这可能会降低模型的精度,但在某些情况下可能是必要的。
其他建议:
- 在计算协方差矩阵的逆之前,检查其条件数。较大的条件数表示矩阵接近奇异,这可能会导致数值不稳定性。
- 考虑使用其他类型的核函数,例如径向基函数 (RBF) 核,它在某些情况下可能更稳定。
通过应用这些方法,应该能够解决奇点错误并成功计算高斯过程的后验概率。
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