gwas流程

gwas流程

时间：2022-11-04 09:35:07浏览次数：52

标签：gwas lddecay vcf 流程 sh 计算 FarmCPU

1.首先创建ID列表和表型文件用gwas5.sh进行FarmCPU和MLM进行关联分析(mvp_p_k.r),同时计算了PCA。
2.用lddecay.sh计算vcf的ld，储存在lddecay文件夹
3.用annovar对vcf进行注释，得到hmp.txt文件
4.通过比较QQ图发现FarmCPU模型更好，对FarmCPU得到的SNP按照阈值为0.000001进行过滤
5.用fst.sh计算籼稻粳稻中的遗传结果

标签：gwas,lddecay,vcf,流程,sh,计算,FarmCPU
From： https://www.cnblogs.com/xiaosagege/p/16856616.html

企业项目开发流程，路飞项目，虚拟环境搭建
目录企业项目开发流程一、企业项目类型面向互联网用户：商城类项目面向互联网用户：二手交易类的公司内部项目：python写的重点个人博客内容收费网站房屋租赁二、完整流程三、我......
ios AppStore 上架流程（Xcode11.5）
AppStore上架流程前提已经注册苹果开发者账号登录开发者官网https://developer.apple.com/点击account进行登录点击Certific......
ios AppStore 上架流程（Xcode11.5）
AppStore上架流程前提已经注册苹果开发者账号登录开发者官网https://developer.apple.com/点击account进行登录点击Certificates,Identifiers&Profiles1.首先进......
性能测试流程
1、性能测试需求分析1）需求分析：熟悉系统熟悉系统的业务功能熟悉系统的技术架构包含用什么语言、什么样的技术框架、应用服务器、数据库服务器、怎么工作、怎么调......
IOS 上架流程简洁版
1、manifest.json基础配置应用版本名称：1.0.2（请根据自身APP版本填写）应用版本号：11（请根据自身APP版本填写） 2、HbuilderIOSApp云端打包勾选iOS（ipa包），不需要勾选Android（apk包......
IOS 上架流程简洁版
1、manifest.json基础配置应用版本名称：1.0.2（请根据自身APP版本填写）应用版本号：11（请根据自身APP版本填写） 2、HbuilderIOSApp云端打包勾选iOS（ipa包），不需要勾选Android（apk包......
微服务项目：尚融宝（60）（核心业务流程：个人中心）
认清现实，放弃幻想，准备斗争一、资金列表接口1、ControllerTransFlowController@Api(tags="资金记录")@RestController@RequestMapping("/api/core/transFlow")@Slf4jpublic......
IOS 上架流程简洁版
1、manifest.json基础配置应用版本名称：1.0.2（请根据自身APP版本填写）应用版本号：11（请根据自身APP版本填写） 2、HbuilderIOSApp云端打包勾选iOS（ipa包），不需要勾选And......
企业项目类型以及开发流程
1.企业项目类型#1面向互联网用户：商城类项目-微信小程序商城#2面向互联网用户：二手交易类的-咸鱼-转转#3公司内部项目：python写的重......
店铺选址必须实践什么流程？这几个流程作用明显
虽然很多人都想要做好开店之前的店铺选址，但是他们在选址过程中会显得一筹莫展，不知道怎么进行选址。这就需要我们在选址时实践一些流程。那么店铺选址必须实践什么流程？下......

相关文章

赞助商

阅读排行