测量距离
在Pymol中实现两个原子间的空间距离测量
一、 以PDB:4hbk为例,打开PyMOL运行命令载入蛋白(也可以直接 .pdb格式导入)
二、点击菜单栏中的Wizard->Measurement 就可以进行距离测量。然后分别选择两个2个原子就可以显示这2个原子的距离。
比如我们想测定TYR48中侧链上的O原子到Lys77侧链N原子的距离,如下操作即可:
1. 点击Wizard->Measurement;打开了Measurement 面板,位于object list面板下方;
2. 鼠标点击TYR48侧链上的O原子 和 LYS77 侧链上面的N原子;
3. 如要测定其他2个原子的距离,鼠标继续点击选择2个原子就可以了;
4. 测定完成后,点击Measurement 面板中的done 就可以了。
效果如图所示:
文章转载自公众号:皮蛋笔记,欢迎关注,随时获取第一手文章内容。
标签:侧链,距离,原子,点击,PyMOL,Measurement,残基 From: https://www.cnblogs.com/wuzhixiake/p/18308886